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倭黑猩猩基因組測序完成,與人類親緣關(guān)系最近
?黑猩猩和人類基因組的DNA序列相似性達到99%;即使考慮到DNA序列插入或刪除,兩者的相似性也有96%;人類與黑猩猩有29%的共同基因編碼生成同樣的蛋白質(zhì).
從遺傳學的角度上來講倭黑猩猩與人類共享了約98.7%的DNA,黑猩猩與人類同樣共享了約98.7%的DNA,倭黑猩猩和黑猩猩共享了99.6%的DNA.有約1.6%的基因是人類與倭黑猩猩而非黑猩猩所共有的.同時也有相同數(shù)量的DNA是人類與黑猩猩而非倭黑猩猩所共有的.由此可見,黑猩猩與倭黑猩猩跟人類的接近程度幾乎相同.
關(guān)于它們與靈長目其他生物跟人類的接近程度問題,有另外一項研究:考古學告訴我們,紅毛猩猩屬在約1400萬年前獨立進化,大猩猩屬在約1000萬年前獨立進化.而人類的祖先與倭黑猩猩及黑猩猩的共同祖先則是700萬年前至400萬年前在非洲分離開來的.
除此之外猴子、鼠、狗、豬等動物與人類的生理活性基因85%~95%相同
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?其實,當我們檢視自己的DNA時,發(fā)現(xiàn)和黑猩猩并沒有太大的不同。但卻正是因為這些微小卻微妙的差異,徹底改變了世界,讓我們成為“人類”。 
你不必是一名生物學家或人類學家,就能看出類人猿——大猩猩、黑猩猩、倭黑猩猩、猩猩——與我們?nèi)祟愂嵌嗝吹叵嗨?。除了它們身體的某些部分過大和長有更多毛發(fā)之外,即便小孩子都能看出它們的身體與我們?nèi)绯鲆晦H。 
科學家?guī)资昵熬偷贸鼋Y(jié)論:黑猩猩是人類的近親,其基因大約有98~99%與人類相同。
而這1~2%的極細微基因差異,卻散布于整個基因組,是所有其他差異的根源。農(nóng)耕、語言、繪畫、音樂、技術(shù)以及哲學,所有這些文明成就將人類與黑猩猩截然分開,并使穿上西裝的黑猩猩看上去那么滑稽可笑。 
基因藍圖令差異初露端倪 
是什么賦予我們諸如復(fù)雜的大腦和直立行走能力等優(yōu)勢,是什么令我們?nèi)菀赘腥警懠?、艾滋病和阿爾茨海默氏癥,而黑猩猩卻能免于這些疾病的侵擾,這都是未解之謎。 
不過,這種情況正被迅速改變。一年前,遺傳學家宣布成功繪制了黑猩猩基因組序列草圖,得以首次對人類和黑猩猩的DNA進行比較。不久后,由德國萊比錫馬克斯-普朗克進化人類學研究所的分子遺傳學家史旺特·帕伯領(lǐng)導(dǎo)的一個研究小組,將宣布一個更驚人的成就:對尼安德特人的重要基因組片斷的測序。尼安德特人(原始人類)與人類的親緣性比黑猩猩更親近。
對上述基因藍圖(加上大猩猩和其他靈長目動物的基因組)進行對照,將能夠準確解釋我們何以成為人類。 
隨著古生物學家收集到越來越多的化石,他們獲得了大量具有解剖學特征的數(shù)據(jù)。對這些特征進行比較分析,輔以對不同特征出現(xiàn)和消失年代的對照,科學家們繪出了日益精細的家譜圖,顯示了猿、原始人類和人類之間的關(guān)系。他們逐漸發(fā)現(xiàn),達爾文有關(guān)猿和人類都源于共同祖先的直覺推斷接近于正確。 
基因差異讓人類更易生病 
直到20世紀60年代,我們的身體與猿的關(guān)系的細節(jié),才開始獲得生物化學上的解釋。1975年,分子遺傳學推動了一篇跨時代論文的發(fā)表。加州大學伯克利分校的兩名科學家瑪麗-克萊爾·金和艾倫·威爾遜在論文里推算,黑猩猩和人類有98~99%的基因物質(zhì)相同。 
1998年,美國加州大學圣迭戈分校的糖生物學家阿吉特·瓦基發(fā)表報告認為,和黑猩猩相比,人類的細胞膜表面有某種不同的唾液酸分子。由于唾液酸是瘧疾病毒、感冒病毒等許多病毒的停泊處,因而這解釋了為什么人類比黑猩猩更容易感染這些疾病。 
一年前,遺傳學家在《自然》雜志上發(fā)表了黑猩猩基因組草圖??茖W家們得知,組成人類和黑猩猩的基因組的堿基對序列,僅有1.23%的差異,并且它們之間最大的差異發(fā)生在Y染色體上。 
“垃圾DNA”讓猿變成人 
對科學家來說,如此少的基因數(shù)量意味著,基因本身并不能主宰全部的物種差異。變異還取決于“分子開關(guān)”,是它決定了基因在何時何地開啟和關(guān)閉??咸刂萘⒋髮W人類學家歐文·洛夫喬伊說:“就拿生成手、陰莖和椎骨的基因來說,人類和猿有一些相同結(jié)構(gòu)的基因。但骨盆卻不一樣,人類擁有與猿截然不同的骨盆。這就好比兩座不同磚房的設(shè)計圖,所用的磚是一樣的,但造出的房子卻完全不同?!?span> 
這些“分子開關(guān)”處在基因組的功能性非編碼區(qū),該區(qū)曾被視為“垃圾DNA”,但近來因為基因組的“暗物質(zhì)”(dark matter)而得到重視。事實上,基因組的許多暗物質(zhì)是垃圾——它們是發(fā)生進化之后被遺忘或不相關(guān)的殘余物。但是,屬于暗物質(zhì)的非編碼DNA在進化中能夠起到關(guān)鍵作用。 
在物種進化過程中,造成暗物質(zhì)和基因發(fā)生變化的是突變。單個的堿基對——基因字母表中的字母——發(fā)生翻轉(zhuǎn),就像我們見到的排字錯誤一樣。 
當?shù)怪没驈?fù)制發(fā)生在基因或功能性的基因組非編碼區(qū)時,這常常是有害的。但有時候,純粹是出于偶然,這種變異能賦予新物種某些優(yōu)勢,使得它繁殖更多的后代,從而在下一代保存了之前發(fā)生的變異。 
  最劇烈變異促成人腦發(fā)育 
有關(guān)基因復(fù)制如何幫助我們遠離猿猴的一個驚人發(fā)現(xiàn),是由丹佛科羅拉多大學的詹姆斯·塞克拉領(lǐng)導(dǎo)的一個研究小組,在大腦區(qū)域發(fā)現(xiàn)了一種名為DUF1220的基因。 
其復(fù)制可見于許多靈長目動物,其中人類攜帶的DUF1220數(shù)量最多,非洲類人猿就少得多,而猩猩和舊世界猴更少。 
另一個驚人發(fā)現(xiàn)則是,通過使用一種高級電腦程序,搜尋人類、黑猩猩和其他脊椎動物經(jīng)歷劇烈變化的基因組片斷。最終發(fā)現(xiàn)了49個不連續(xù)的人類加速區(qū)(HARS),這是在人類大腦進化過程中起作用的一種基因。 
從黑猩猩進化到人類,在此過程中發(fā)生的最劇烈變異被稱為HAR1,它是控制胎兒在妊娠期第7周到第19周大腦發(fā)育的一種基因的一部分。 
所有這些意味著什么 
事實上,連最堅定的基因組比較研究的支持者,都承認我們目前所知道的還十分有限。但同時,即便最激烈的批評者都承認,這些基因組的研究具有重大意義。 
對于我們大多數(shù)人來說,問題在于人類何以成為人類。隨著科學家不斷提醒我們,進化是一種隨機進程:偶然的基因改變與隨機的環(huán)境條件相互作用,造就了比其同類更適合的生物體。在經(jīng)過35億年的這種隨機演變后,一種能思考自身的起源,并為莫扎特音樂陶醉的動物出現(xiàn)了。
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?這只名為Ulindi的倭黑猩猩的基因組顯示了人類、黑猩猩和倭黑猩猩的親緣關(guān)系是如此之近。圖片來源:馬普學會

  黑猩猩如今不得不與別的生物分享在動物界與人類親緣關(guān)系最近的殊榮了。一個國際研究小組日前首次成功測定了倭黑猩猩的基因組,從而證明這種靈長類動物與人類共享的脫氧核糖核酸(DNA)百分比同黑猩猩是一樣的。研究小組還在這3個基因組中發(fā)現(xiàn)了一些小而誘人的差異——它們或許解釋了盡管與人類共享了99%的DNA,但倭黑猩猩和黑猩猩如何在外貌或舉止上與我們相去甚遠。這是科學家獲得的又一份人類“近親”的基因組圖譜,有助于對比研究是哪些基因?qū)е铝巳祟惻c各種猩猩的區(qū)別。

  研究小組成員之一、德國萊比錫市馬普學會進化人類學研究所的計算生物學家Janet Kelso表示:“我們在基因上關(guān)系很近,但在行為上卻大相徑庭。這將促使我們尋找造成現(xiàn)代人與黑猩猩和倭黑猩猩存在差異的遺傳基礎(chǔ)?!?br>
  自從研究人員于2005年開始對黑猩猩進行測序以來,人們已經(jīng)知道自身與黑猩猩共享了99%的DNA,從而使其成為與我們最近的“親戚”。然而實際上有兩種靈長類動物與人類的關(guān)系最密切——倭黑猩猩(Pan paniscus)和黑猩猩(Pan troglodytes)。這曾促使科學家推測是否人類、黑猩猩和倭黑猩猩的祖先看起來和動起來更像一只倭黑猩猩、黑猩猩,或其他生物,以及自從人類的祖先與倭黑猩猩及黑猩猩的共同祖先在700萬年前至400萬年前的非洲分離以來,這3個物種如何變得如此不同。

  在生物分類上,靈長目人科包括人類在內(nèi)有4個屬,其中紅毛猩猩屬在約1400萬年前獨立進化,大猩猩屬在約1000萬年前獨立進化。

  由馬普學會領(lǐng)導(dǎo)的這項國際合作研究選擇萊比錫動物園的一只名為Ulindi的倭黑猩猩作為測序?qū)ο螅@部分緣于它是一只雌性(黑猩猩基因組來自一只雄性)。Ulindi的全基因組分析結(jié)果發(fā)表在最新出版的《自然》雜志上,揭示了倭黑猩猩和黑猩猩共享了99.6%的DNA。這證明了這兩種非洲類人猿依然彼此在遺傳構(gòu)成上相當接近,盡管它們的祖先于100萬年前開始在非洲分開進化,這或許緣于剛果河的形成將其祖先種群一分為二所致。如今,倭黑猩猩只棲息在剛果民主共和國境內(nèi),并且沒有跡象表明它們在與黑猩猩分開之后再次與后者發(fā)生了雜交,這可能因為剛果河作為一道天然屏障阻礙了兩個種群的混合。

  倭黑猩猩雖然和黑猩猩的“親緣”關(guān)系非常接近,但它們的生活習性卻大不相同。比如黑猩猩群體是由雄性領(lǐng)導(dǎo),彼此間侵略性較強,經(jīng)?;ハ酄幎?,而倭黑猩猩群體通常是由雌性領(lǐng)導(dǎo),它們不怎么愛打斗。研究人員希望能通過對比它們的基因組,找出是哪些基因?qū)е铝诉@種區(qū)別。

  研究人員同時發(fā)現(xiàn),倭黑猩猩與人類共享了約98.7%的DNA——這一百分比與人類同黑猩猩的共享率是一致的。

  當馬普學會的科學家將倭黑猩猩基因組直接與黑猩猩和人類基因組進行比較后,他們發(fā)現(xiàn)有少量基因組——約1.6%——是人類與倭黑猩猩而非黑猩猩所共有的。同時也有相同數(shù)量的DNA是人類與黑猩猩而非倭黑猩猩所共有的。這些差別表明,形成人類、黑猩猩和倭黑猩猩的原始類人猿種群相當龐大且基因多樣化——大約有27000只繁殖個體。一旦人類的祖先在400多萬年前與倭黑猩猩和黑猩猩的祖先分離后,倭黑猩猩和黑猩猩的祖先便保持著這樣的多樣性直至它們的種群在100萬年前徹底分裂為兩個種群。

  在這3個物種中,這些DNA之間的小差異的功能尚未搞清,馬普學會的科學家從中找到了線索,認為其中一些可能與涉及免疫響應(yīng)調(diào)控、腫瘤抑制,以及社會誘因感知的基因有關(guān)。

  此外,對倭黑猩猩基因組的研究也有助于了解我們?nèi)祟愖陨?。此前,科學界已完成了對紅毛猩猩、大猩猩和黑猩猩的基因組測序,對這些人類“近親”的基因組進行全面比較有助于確定是哪些基因讓我們“與眾不同”。(記者趙路)       
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