1945年9月將六個專區(qū)合并為四個，原第三專區(qū)撤銷分別劃入第一、二、四專區(qū)，第五、六兩專區(qū)合并為新的第三專區(qū)。渤海區(qū)直屬中共華東中央局領(lǐng)導。渤海區(qū)領(lǐng)導機關(guān)由廣饒北部移駐惠民縣城。與此同時，濰縣、昌北二縣劃歸膠東區(qū)。1946年6月章歷縣自魯中區(qū)劃入本區(qū)。同年9月津南縣由冀中區(qū)劃入本區(qū)(1948年8月復歸冀中)。1948年5月各專區(qū)行政機構(gòu)名稱由專員公署改稱行政專員公署。同年7月張店、周村二市由本區(qū)劃歸新設(shè)的魯中南行政區(qū)淄博特區(qū)；新設(shè)的壽(光) 南縣劃歸昌濰特區(qū)(旋改為昌濰專區(qū))；黃驊、滄縣、滄州市自本區(qū)劃歸冀中區(qū)。1949年7月所轄第一、二、三、四專區(qū)分別以地名作專名依次重新定名為滄南、洛北、清河、墾利專區(qū)。同年10月平原縣自河北省衡水行署劃歸本區(qū)管轄。
(一)第一(滄南)專區(qū)
1945年9月原第一專區(qū)和原第三專區(qū)的慶云等縣合并為第一(滄南) 專區(qū)，先后轄樂陵、慶云、寧津(振華)和今屬河北省的鹽山、東光、南皮、新海(黃驊)、吳橋、滄縣等9縣市。1949年7月渤海第一專區(qū)改稱滄南專區(qū)。專署駐樂陵等地。
(二)第二(濼北)專區(qū)
1945年9月原第三專區(qū)撤銷，所轄商河、商惠二縣劃歸第二專區(qū)。1949年7月第二專區(qū)改稱濼北專區(qū)。同年8月冀魯豫邊區(qū)的齊(河) 禹(城)縣和河西縣劃歸渤海濼北專區(qū)。同年10月平原縣自河北省衡水專區(qū)劃入本專區(qū)。先后轄臨邑、惠(民)濟(陽)、商河、商(河)惠(民)、陵縣、濟陽、齊河、禹城、德平、德縣、平原、平(原)禹(城)等
縣和德州市。專署機關(guān)駐臨邑縣城。
(三)第三(清河)專區(qū)
1945年9月原渤海第三專區(qū)撤銷，第五、六兩專區(qū)合并為新的第三專區(qū)。1949年7月改稱清河專區(qū)。先后轄鄒平、長山、齊東、高苑、青城、桓臺、周村、臨淄、博興、廣饒、壽光、益(都)壽(光)、羊角溝、章(丘)歷(城)等縣、市。專署機關(guān)駐博興等地。
(四)第四(墾利)專區(qū)
1945年9月原渤海第三專區(qū)所轄的惠民、陽信、無棣等縣劃入。1949年7月改稱墾利專區(qū)。計轄墾利、利津、沾化、濱縣、蒲臺、惠民、陽信、無棣等8縣。專署機關(guān)駐無棣、沾化、陽信等地。
