之前寫過(guò)四篇關(guān)于Zotero技巧的帖子。
* [Zotero（1）：文獻(xiàn)管理軟件Zotero基礎(chǔ)及進(jìn)階示范](
http://www.yangzhiping.com/tech/zotero1.html)
* [Zotero（2）：作為知識(shí)管理工具的Zotero](
http://www.yangzhiping.com/tech/zotero2.html)
* [Zotero（3）：平板與社交：再談研究輔助工具Zotero兼配套APP](
http://www.yangzhiping.com/tech/zotero3.html)
* [Zotero（4）：Zotero之Zotfile插件的使用](
http://www.yangzhiping.com/tech/zotero4.html)
在找這幾篇舊文的朋友，可以去我的個(gè)人博客看看，存檔在那里：
http://t.cn/z8dHbTM 多數(shù)技巧還沒(méi)過(guò)時(shí)。今天這篇帖子則側(cè)重，如何打造一個(gè)半自動(dòng)化的電子文獻(xiàn)資料管理流程。這篇不講基礎(chǔ)安裝、云同步等技巧，前面帖子已經(jīng)講得夠多了。讓我們開(kāi)干吧，超詳細(xì)，眾多技巧匯合，請(qǐng)耐心看。
## 問(wèn)題1：如何快速收藏電子書(shū)或者論文？
假設(shè)在豆瓣看了一本好書(shū)，如丹尼特新作【直覺(jué)泵】，網(wǎng)址如下：
* [Intuition Pumps and Other Tools for Thinking (豆瓣)](
http://book.douban.com/subject/20437999/)
點(diǎn)擊瀏覽器右上角的Zotero圖標(biāo)，收藏即可：
好了，打開(kāi)Zotero，我們看到，該書(shū)已經(jīng)保存在這里了。
同樣，對(duì)于論文你也可以如此處理，參照老文章，建議多使用[Google Scholar](
http://scholar.google.com/)
## 問(wèn)題2：如何標(biāo)記文獻(xiàn)的重要性？
步驟如下：
1、在丹尼特這本書(shū)的條目這里，創(chuàng)建一個(gè)【重要文獻(xiàn)】類似標(biāo)簽；
2、在界面的左下角，找到【重要文獻(xiàn)】該標(biāo)簽，然后右鍵，對(duì)該標(biāo)簽指派顏色：
比如紅色，同時(shí)會(huì)指派快捷鍵，如【1】如下圖所示：
3、以上操作只需要執(zhí)行一次。未來(lái)就很爽了，看到好文獻(xiàn)，直接鍵盤按【1】就表示喜歡。最多可分配6個(gè)數(shù)字。比如，1表示非常重要文獻(xiàn)，2表示比較重要文獻(xiàn)，諸如此類。
## 問(wèn)題3：怎么判斷文獻(xiàn)重要性？
我們?cè)趺磁袛辔墨I(xiàn)特別重要呢？有三個(gè)簡(jiǎn)單辦法：
* 作者的重要性：比如【H指數(shù)】
* 文獻(xiàn)的引用次數(shù)：比如【Google學(xué)術(shù)引用次數(shù)】
* 文獻(xiàn)的學(xué)術(shù)社交媒體影響力，比如【altmetric分?jǐn)?shù)】
以前的文章與我最近的微博，都談過(guò)最后一個(gè)辦法【altmetric分?jǐn)?shù)】，這里就不詳細(xì)說(shuō)了。只說(shuō)第一個(gè)與第二個(gè)辦法：H指數(shù)與Google學(xué)術(shù)引用次數(shù)。先說(shuō)第一個(gè)：H指數(shù)。
H指數(shù)是什么？如果人際關(guān)系混得不錯(cuò)，在30以上，一般在國(guó)內(nèi)可以拿下學(xué)霸地位。超過(guò)50，鳳毛麟角，屬于普通老百姓要珍惜的大牛級(jí)別科學(xué)家。比如，施一公是60。
比如，丹尼特這位作者的H指數(shù)可以在這里查詢：[Daniel C. Dennett - Google Scholar Citations](
http://scholar.google.com/citations?user=3FWe5OQAAAAJ&hl=en&oi=ao)
我們發(fā)現(xiàn)他高達(dá)68，那么就表示這位作者非常重要：
我們對(duì)丹尼特這本書(shū)標(biāo)記為很重要，那么，選中它，按個(gè)【1】就可以了，效果如下圖所示：
接下來(lái)，我們說(shuō)說(shuō)第二個(gè)簡(jiǎn)單辦法，【Google學(xué)術(shù)引用次數(shù)】。當(dāng)然，你可以去Google學(xué)術(shù)，查看被引次數(shù)，然后手動(dòng)添加。比如，丹尼特這本書(shū)被引用9次：
不過(guò)，懶鬼可不是這思路。我們可以借助插件自動(dòng)更新【Google學(xué)術(shù)引用次數(shù)】。
因?yàn)樾伦x者可能是第一次接觸Zotero插件安裝，這里多解釋幾句如何安裝插件。
1、打開(kāi)Zotero的【插件】窗口，位置如下所示：
2、然后下載插件，比如該插件的下載地址是：
https://raw.github.com/beloglazov/zotero-scholar-citations/master/builds/zotero-scholar-citations-1.8.4-fx.xpi3、下載好了，回到Zotero的插件安裝界面，如下圖所示：
安裝好了，如有必要，重啟Zotero即可。
好的，繼續(xù)回到丹尼特這本書(shū)。我們點(diǎn)擊右鍵，更新一下引用即可。
問(wèn)題馬上來(lái)了，更新完了，我們看條目的【引用次數(shù)】那里還是空的??！老陽(yáng)，這是怎么回事！
別急，這是該插件開(kāi)發(fā)者為了避免將你條目自帶的【引用次數(shù)】字段與【Google學(xué)術(shù)引用次數(shù)】沖突，所以，他將其保存在【其它】那個(gè)字段里面去了。怎么顯示它？如下圖所示：
勾上它就可以了。我們?cè)僦匦驴匆幌陆缑?，哇，【Google學(xué)術(shù)引用次數(shù)】真的有了！如下圖所示：
丹尼特大神這本書(shū)因?yàn)椴懦霭鏇](méi)多久，所以才被引9次。而另一位大神2004年出版的Culture, leadership, and organizations，因?yàn)閷儆谀硞€(gè)流派開(kāi)山之作，被引用了3281次。
因?yàn)閦otero-scholar-citations這個(gè)插件是可以批量更新【Google學(xué)術(shù)引用次數(shù)】的。如此一來(lái)，我們標(biāo)記論文、圖書(shū)重要性，就更容易了。不過(guò)需要特別注意的是，Google學(xué)術(shù)本身為了防止機(jī)器人，做了限制，你一次別更新太多文獻(xiàn)了，那樣，將彈出一個(gè)窗口，Google需要你填入驗(yàn)證碼，確定你不是機(jī)器人，才能繼續(xù)更新。
## 問(wèn)題4：怎樣查找英文原版電子書(shū)？
說(shuō)一下怎么查找英文原版書(shū)。
1、電子書(shū)檢索：
http://t.cn/zY3Vmkp 這幾個(gè)網(wǎng)站可檢索到70%網(wǎng)上曾出現(xiàn)過(guò)的；
2、私有數(shù)據(jù)庫(kù)：如果是心理學(xué)，推薦APA的psycinfo數(shù)據(jù)庫(kù)與MIT的cognet數(shù)據(jù)庫(kù)，新書(shū)多半可查到；
3、國(guó)家圖書(shū)館的英文新書(shū)非常齊全，多半可復(fù)印到，同時(shí)可輔以各高校藏書(shū)；
4、亞馬遜，尤其是kindle直接購(gòu)買電子書(shū)。
## 問(wèn)題5：如何保存電子書(shū)？
好的，丹尼特這本書(shū)，我們假設(shè)已經(jīng)查到了電子書(shū)。但是，從網(wǎng)上下載的電子書(shū)，命名亂七八糟，不一定符合你的規(guī)律，同時(shí)，能否自動(dòng)將下載的電子書(shū)導(dǎo)入到Zotero庫(kù)中？
有，這就是我之前在：[Zotero（4）：Zotero之Zotfile插件的使用](
http://www.yangzhiping.com/tech/zotero4.html) 中介紹過(guò)的Zotfile插件。
安裝辦法仍然同上一個(gè)插件一樣，我們?cè)谒墓倬W(wǎng)找到插件下載：
http://www.jlegewie.com/zotfile.html假設(shè)，我們平時(shí)從網(wǎng)上下載電子資料，都放在【download】目錄下面，那么，在插件中心那里，設(shè)置Zotfile的常用目錄是【download】目錄。如下圖所示：
繼續(xù)：
完工！未來(lái)我們下載電子書(shū)時(shí)，就會(huì)自動(dòng)導(dǎo)入。它的原理是這樣的：
1、假設(shè)在Zotero中，我們的鼠標(biāo)正選中了丹尼特這本書(shū)的條目。
2、此時(shí)，我們通過(guò)瀏覽器，下載了這本書(shū)的電子版，保存在【download】目錄下面。那么，插件Zotfile就會(huì)識(shí)別出來(lái)，并且默認(rèn)認(rèn)為這個(gè)電子文件是該條目的附件。然后自動(dòng)導(dǎo)入過(guò)來(lái)。它默認(rèn)支持pdf、doc、txt等格式，你也可以設(shè)置更多格式，如常用的epub、mobi格式，如下圖所示：
3、同時(shí)，導(dǎo)入文件成功后，會(huì)自動(dòng)將文件重命名為【作者_(dá)出版年份_文獻(xiàn)標(biāo)題】這種格式。當(dāng)然，你不喜歡這種文件名格式，也可以在剛才那里自定義其它命名方法。
成功后，如下圖所示：
以前那些亂七八糟的PDF怎么處理呢？我們可以將每本電子書(shū)拖到對(duì)應(yīng)條目下面。然后批量重命名即可。如下圖所示：
## 問(wèn)題6：如何寫筆記？
好了，收藏狂們一般非常樂(lè)意干前面5個(gè)步驟，卻不太喜歡干這個(gè)步驟：讀書(shū)與寫筆記。
Zotero現(xiàn)已支持用Markdown格式寫筆記，強(qiáng)！步驟如下，
1）在插件中心，安裝Markdown here插件，
http://t.cn/8kxA5bG 2）重啟后，找到條目，然后新建一筆記，如下圖所示：
我們開(kāi)始用Markdown語(yǔ)法寫筆記。這是筆記原文。
按下快捷鍵：【ctrl+alt+m】，你用Markdown寫的筆記就生成為漂亮的文檔了！下圖是生成效果：
什么？你還在問(wèn)：Markdown語(yǔ)法是什么？枉我推廣這么久。。。
去讀這里：[Markdown在線寫作速成](
http://joinwee.com/lesson/10/)
## 問(wèn)題7：Zotero如何配合altmetric分?jǐn)?shù)？
什么是altmetric分?jǐn)?shù)？它可以查出在論文互引網(wǎng)站、推特、科學(xué)博客、專業(yè)科學(xué)媒體上對(duì)論文的議論等。 當(dāng)然，僅限國(guó)外科學(xué)媒體。
Zotero如何配合使用？我之前的兩篇老文章介紹比較詳細(xì)了，
* [如何查詢Altmetric分?jǐn)?shù)](
http://www.douban.com/note/282310988/)
* [Zotero（3）：平板與社交：再談研究輔助工具Zotero兼配套APP](
http://www.yangzhiping.com/tech/zotero3.html)
這里重點(diǎn)講講平板上，如iPad上如何配合使用。
科技發(fā)展真快，zotero配合altmetric分?jǐn)?shù)，可以按照論文社交媒體影響力，來(lái)排序了。這樣同行在看的重要論文一目了然了。如下圖所示：
將文獻(xiàn)按照altmetric分?jǐn)?shù)排序即可。然后社交媒體影響越大的，就越排在前面。掃了一下今年我看的論文，同行熱議的，集中在：
* 1、研究方法的討論，第一篇就是；
* 2、計(jì)算社會(huì)科學(xué)類，如第二篇就是Facebook線索識(shí)別人格；
* 3、某個(gè)生理區(qū)域的突破；
* 4、縱向跟蹤研究，如第五篇發(fā)現(xiàn)書(shū)呆子有利于保護(hù)認(rèn)知老化。
## 問(wèn)題8：看資料看暈了，怎么辦？
有一種學(xué)問(wèn)，叫做【科學(xué)計(jì)量學(xué)】，研究【科學(xué)的科學(xué)】，之前也寫過(guò)很多文章介紹了。比如這篇：
* [科學(xué)計(jì)量學(xué)：發(fā)現(xiàn)學(xué)科正在靜悄悄發(fā)生的革命](
http://www.yangzhiping.com/tech/scientometrics-sci2.html)
其實(shí)，Zotero也可以完成類似任務(wù)。這就是我之前介紹過(guò)的papermachine插件。下載地址在這里：
[How to Use Paper Machines | Paper Machines](
http://papermachines.org/)
對(duì)一個(gè)類別論文進(jìn)行【文獻(xiàn)可視化】分析，結(jié)果如下。先看詞云（Word Cloud）的分析結(jié)果，如下圖所示：
再看看Topic Modeling的分析結(jié)果。如下圖所示：
前者可以看出該子類論文關(guān)鍵詞；后者可看出從1990到2010年，該研究領(lǐng)域隨時(shí)間的動(dòng)蕩。當(dāng)然，我選擇的示范數(shù)據(jù)不好，并不能體現(xiàn)出其厲害之處。
一個(gè)不算遺憾的小提醒是，papermachine插件目前只支持英文等語(yǔ)種論文分析，另一個(gè)問(wèn)題是，它對(duì)版本兼容性要求較高。
## 問(wèn)題9：mendeley與 Zotero，哪個(gè)更好？
這又是一個(gè)讀者老問(wèn)我的問(wèn)題，誰(shuí)叫這個(gè)世界上，有一種叫做【選擇障礙】的病。這么說(shuō)吧，開(kāi)源世界的發(fā)展速度快于你的想象。 mendeley 被商業(yè)公司收購(gòu)后，很多擁抱開(kāi)放科學(xué)理念的科學(xué)家，開(kāi)始抵制mendeley了，轉(zhuǎn)投Zotero懷抱。如這位：
* [Mendeley sells out; I’m moving to Zotero](
http://research.coquipr.com/archives/492)
昨晚幫大家，再次測(cè)試mendeley，看一下它最新進(jìn)展如何，結(jié)果還是不得不放棄，安心用我的zotero。它的缺點(diǎn)有什么呢？
* 其一，對(duì)于文獻(xiàn)量龐大到一定程度的人，程序崩潰太頻繁；
* 其二，它的zotero整合功能，還是無(wú)法自動(dòng)導(dǎo)入子文件夾；
* 其三，搜索全方位弱于zotero，在Zotero中，我可以任意定義諸如【豆瓣近7天看的書(shū)】，【30天前看的BBS這本刊物的論文】，以備復(fù)習(xí)使用，而mendeley難以做到；
* 其四，mendeley超過(guò)2g空間就收費(fèi)。Zotero至少10g空間隨便用。
* 其五，對(duì)于中國(guó)用戶來(lái)說(shuō)，mendeley還有個(gè)致命缺點(diǎn)，無(wú)法導(dǎo)入豆瓣讀書(shū)記錄與github的程序庫(kù)；無(wú)法將筆記與論文區(qū)分開(kāi)。這樣，只能將其當(dāng)做文獻(xiàn)管理軟件而非知識(shí)管理軟件用。
貴陽(yáng)小楊哥(
http://blog.yesmryang.net/tags/Zotero/)，也是忠實(shí)的開(kāi)源軟件Zotero推廣者，在我的微博評(píng)論下，補(bǔ)充道：
> Zotero早就可以把「附件」和「題錄」分開(kāi)放置了！附件放Dropbox/skydrive/百度盤什么的，20G不是問(wèn)題！
## 小結(jié)
開(kāi)源程序的發(fā)展速度往往超出人們想象。目前Zotero引領(lǐng)的開(kāi)源引文格式項(xiàng)目——[CSL](
http://citationstyles.org/)，已經(jīng)突破六千多期刊。以致商業(yè)科技出版公司的人不敢相信。每過(guò)一些日子，你又會(huì)發(fā)現(xiàn)一些好用的小技巧。隔一段時(shí)間，對(duì)天天用的軟件，更新使用模式，是個(gè)好習(xí)慣。同時(shí)，開(kāi)源程序總具備一種質(zhì)樸的美。Zotero將電子書(shū)或PDF、筆記、引用文獻(xiàn)三者放在一起，從下載電子書(shū)或PDF，到閱讀、做標(biāo)注、寫筆記，再到引用，一條龍服務(wù)，非常方便。有特別不滿意的地方，源代碼公開(kāi)了，自己修改就好了。
我們還可以自定義這些zotero搜索類別：【2013年看過(guò)的書(shū)】、【2013年看過(guò)的論文】與【2013年寫過(guò)的讀書(shū)筆記】、【2013年閱讀的最重要的論文】或者【2013年同行評(píng)價(jià)最高的論文】。年底這么整理一下，溫故而知新，也很有成就感:D
