今天是第1599期日?qǐng)?bào)。
Nature Reviews Microbiology[IF:34.209]
① 腸道菌群可影響人體代謝健康，飲食對(duì)二者有調(diào)控作用；② 菌群異常（如多樣性降低、特定成員和功能改變等）可能參與了肥胖、2型糖尿病、代謝性肝病、心血管代謝疾病和營(yíng)養(yǎng)不良等代謝疾病的發(fā)生發(fā)展；③ 短鏈脂肪酸、脂多糖、次級(jí)膽汁酸、三甲胺、咪唑丙酸、支鏈氨基酸、吲哚及其衍生物等一系列的菌群代謝產(chǎn)物和衍生物，可作為菌群的“信使”，影響宿主能量穩(wěn)態(tài)、肥胖、食欲、血糖調(diào)控、胰島素敏感性、炎癥和內(nèi)分泌調(diào)節(jié)等，調(diào)控宿主代謝。
Gut microbiota in human metabolic health and disease
09-04, doi: 10.1038/s41579-020-0433-9
【主編評(píng)語(yǔ)】Nature Reviews Microbiology近期發(fā)表了來(lái)自丹麥哥本哈根大學(xué)Oluf Pedersen團(tuán)隊(duì)的一篇重磅綜述，總結(jié)了與多種常見代謝疾病相關(guān)的腸道菌群變化特征，以及菌群代謝和衍生物參與驅(qū)動(dòng)疾病發(fā)生發(fā)展的可能機(jī)制，并探討了以菌群為導(dǎo)向的干預(yù)方法和未來(lái)的研究轉(zhuǎn)化方向等內(nèi)容。我們特別將文章中的圖片編譯為一圖讀懂，希望能幫助你漲知識(shí)。（@mildbreeze）
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Nature[IF:42.778]
① 菌群、腸上皮及其相鄰的免疫和間質(zhì)細(xì)胞，構(gòu)成腸道中的宿主-菌群互作界面，結(jié)直腸癌（CRC）中潛在促癌菌增多、保護(hù)性菌群減少；② 一些促癌菌有基因毒性，可誘發(fā)DNA損傷、致癌突變等，飲食/藥物相關(guān)的細(xì)菌代謝產(chǎn)物異常也可參與CRC發(fā)生；③ 腸屏障紊亂導(dǎo)致的菌群入侵能誘導(dǎo)癌癥相關(guān)促炎細(xì)胞因子，失控的炎癥反過(guò)來(lái)促進(jìn)適應(yīng)炎癥環(huán)境的潛在有害菌生長(zhǎng)，一些促癌菌能改變腫瘤微環(huán)境中的免疫組成，使之促癌；④ 多種新方法技術(shù)可研究菌群與CRC的關(guān)系。
Host–microbiota maladaptation in colorectal cancer
09-23, doi: 10.1038/s41586-020-2729-3
【主編評(píng)語(yǔ)】高達(dá)90%的結(jié)直腸癌（CRC）疾病風(fēng)險(xiǎn)被認(rèn)為是環(huán)境因素（如飲食），而越來(lái)越多的研究描述了“致癌”CRC相關(guān)微生物群。這種生態(tài)失調(diào)是導(dǎo)致疾病的原因還是僅僅代表了一種旁觀者效應(yīng)，目前還不十分清楚。為了證明因果關(guān)系，有必要探究哪些特定類群的微生物或代謝物驅(qū)動(dòng)CRC，并充分描述其潛在機(jī)制。最新發(fā)表在Nature的綜述討論了到目前為止已報(bào)道的CRC中宿主與微生物的相互作用，特別關(guān)注與腸道屏障破壞、基因毒性和有害炎癥相關(guān)的機(jī)制，并評(píng)論了該領(lǐng)域的未知和挑戰(zhàn)，以及尖端技術(shù)如何幫助克服這些困難。我們特別將文中的配圖編譯為一圖讀懂，希望能幫你漲知識(shí)。（@Lexi）
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Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:29.848]
① 飲食行為不規(guī)律導(dǎo)致肥胖或食物成癮，伴隨著腦-腸-菌群（BGM）軸的改變，且改變后的BGM互作機(jī)制具有一定的穩(wěn)定性；② 膳食和菌群互作、其對(duì)飽腹和腸道炎癥的介導(dǎo)以及由此對(duì)腦穩(wěn)態(tài)相關(guān)機(jī)制的擾亂，導(dǎo)致對(duì)進(jìn)食的享樂(lè)回饋機(jī)制和抑制機(jī)制產(chǎn)生重大影響；③ 上述機(jī)制會(huì)反過(guò)來(lái)進(jìn)一步刺激機(jī)體對(duì)高熱量食物的選擇，惡化腸道失調(diào)；④ 靶向BGM多節(jié)點(diǎn)的治療方法的結(jié)合，以及基于腸道菌群組成和功能的個(gè)體干預(yù)，可能是未來(lái)緩解肥胖或食物成癮的可取方式。
Brain–gut–microbiome interactions in obesity and food addiction
08-27, doi: 10.1038/s41575-020-0341-5
【主編評(píng)語(yǔ)】這篇發(fā)表在Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology上的綜述文章，重點(diǎn)研究了肥胖或食物成癮狀態(tài)下，腦腸軸的相互作用和調(diào)節(jié)機(jī)制。膳食與菌群互作產(chǎn)生的信號(hào)分子，影響?yīng)勝p和抑制等調(diào)節(jié)機(jī)制，進(jìn)而反過(guò)來(lái)影響機(jī)體膳食選擇。環(huán)境因素，比如壓力、抗生素等也會(huì)影響B(tài)GM。除了減肥手術(shù)，基于BGM的干預(yù)手段，比如限時(shí)飲食、認(rèn)知行為干預(yù)等，可能也是防治肥胖和食物成癮的方式。我們特別將配圖翻譯制作了一圖讀懂，希望能幫你漲知識(shí)。（@兵兵）
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Gut[IF:19.819]
① 腸道黏液層由兩類糖基化的粘蛋白組成；② 不同腸段的黏液層有不同特點(diǎn)，大腸黏液層含內(nèi)外兩層；③ 黏液層被不斷消耗和補(bǔ)充，是腸道的第一道免疫防線，限制細(xì)菌與腸上皮接觸，也為菌群提供營(yíng)養(yǎng)和黏附位點(diǎn)，黏液層相關(guān)菌群與腸腔中的不同；④ 黏液層與菌群存在雙向互作，一些菌群成員和組分以及炎癥因子等能調(diào)控粘蛋白生成和降解；⑤ 膳食纖維缺乏和一些食品添加劑可通過(guò)菌群削弱黏液層屏障，益生菌、下一代有益菌和微生物產(chǎn)物可用于增強(qiáng)黏液層。
Mucus barrier, mucins and gut microbiota: the expected slimy partners?
09-11, doi: 10.1136/gutjnl-2020-322260
【主編評(píng)語(yǔ)】腸道黏液層對(duì)維持腸道健康至關(guān)重要。Gut近期發(fā)表了來(lái)自比利時(shí)魯汶大學(xué)Patrice Cani團(tuán)隊(duì)的綜述，對(duì)腸道黏液層的組成、功能、調(diào)節(jié)方式以及影響因素進(jìn)行了詳細(xì)的介紹，特別強(qiáng)調(diào)了黏液層與腸道菌群的雙向互作，值得專業(yè)人士參考。（@mildbreeze）
Nature Reviews Immunology[IF:40.358]
① 分娩方式、抗生素使用、母乳喂養(yǎng)、病毒感染等因素均可影響生命早期的菌群定殖；② 宿主的菌群變化可直接調(diào)控Treg的誘導(dǎo)、IgA的產(chǎn)生及Th2型免疫應(yīng)答，或通過(guò)代謝產(chǎn)生短鏈脂肪酸等方式調(diào)控Treg、ILC2等免疫細(xì)胞的發(fā)育、增殖與功能；③ 環(huán)境菌群的暴露也可通過(guò)不同的機(jī)制影響免疫系統(tǒng)的發(fā)育，病毒及真菌對(duì)免疫系統(tǒng)的調(diào)控也不容忽視；④ 益生菌/益生元干預(yù)、預(yù)防呼吸道感染、提前接觸食物、攝入水解配方奶粉等方式或可通過(guò)調(diào)節(jié)菌群以預(yù)防過(guò)敏。
Early life microbial exposures and allergy risks: opportunities for prevention
09-11, doi: 10.1038/s41577-020-00420-y
【主編評(píng)語(yǔ)】現(xiàn)代化的生活方式可直接或間接影響菌群（包括細(xì)菌、病毒、真菌），后者在宿主免疫應(yīng)答的塑造中起到主導(dǎo)作用。生命早期是菌群發(fā)育的窗口期，也是有效預(yù)防過(guò)敏性疾病的關(guān)鍵時(shí)機(jī)。Nature Reviews Immunology上發(fā)表的一篇綜述文章，介紹了各種過(guò)敏性疾病的風(fēng)險(xiǎn)因素（包括剖腹產(chǎn)、抗生素暴露、缺少母乳喂養(yǎng)、病毒感染等）對(duì)生命早期菌群定殖及免疫系統(tǒng)發(fā)育的影響，并討論了通過(guò)調(diào)控菌群以預(yù)防過(guò)敏的潛在策略。（@szx）
Nature[IF:42.778]
① 抗生素處理（ABX）和無(wú)菌孕鼠的胚胎中，軸突生成相關(guān)基因表達(dá)異常、丘腦皮層軸突生長(zhǎng)受損，影響后代成年后的觸覺靈敏度；② 給ABX母鼠在孕前定植多菌株群落（特別是梭菌屬為主的產(chǎn)芽孢菌），可預(yù)防后代的這些神經(jīng)發(fā)育和行為缺陷；③ 母體菌群調(diào)控母體血液和胚胎大腦的代謝組，TMAO和咪唑丙酸等菌群相關(guān)代謝物能在體外促進(jìn)胚胎丘腦軸突生長(zhǎng)，給ABX孕鼠補(bǔ)充這些代謝物（而非SCFA）也能防止胚胎的軸突生長(zhǎng)缺陷和之后的觸覺行為異常。
The maternal microbiome modulates fetal neurodevelopment in mice
09-23, doi: 10.1038/s41586-020-2745-3
【主編評(píng)語(yǔ)】此前研究表明（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1071164332），孕期感染和炎癥誘導(dǎo)的母體免疫激活，在能誘導(dǎo)Th17細(xì)胞的腸道細(xì)菌的存在下，能增加后代的神經(jīng)發(fā)育異常的風(fēng)險(xiǎn)。然而，在沒有這些應(yīng)激源的情況下，母體菌群對(duì)后代神經(jīng)發(fā)育的影響尚不清晰。Nature最新發(fā)表了來(lái)自UCLA的研究，發(fā)現(xiàn)在懷孕早-中期，母體腸道菌群能通過(guò)特定的代謝產(chǎn)物，對(duì)胚胎大腦發(fā)育起調(diào)控作用，能影響胚胎丘腦皮層的軸突生長(zhǎng)和后代的某些觸覺感官靈敏度。這些發(fā)現(xiàn)為孕期的母體腸道菌群如何影響后代神經(jīng)發(fā)育，提供了新見解。（@mildbreeze）
Cell[IF:38.637]
① 納入51例IBS患者和24例健康人，分析6個(gè)月內(nèi)多時(shí)間點(diǎn)的腸道菌群、代謝組、表觀遺傳組和轉(zhuǎn)錄組；② 便秘型患者中SCFA和初級(jí)膽汁酸（BA）減少，而腹瀉型患者中色胺和初級(jí)BA增多，這些菌群代謝物參與刺激結(jié)腸液體分泌，其變化是造成IBS亞型癥狀的潛在原因；③ 患者發(fā)病期間，菌群α多樣性降低、β多樣性升高，一種古菌增多，初級(jí)BA升高，但有個(gè)體差異；④ 患者及其菌群的嘌呤降解增加，導(dǎo)致次黃嘌呤減少，結(jié)腸上皮的嘌呤缺乏可能參與了IBS病理。
Longitudinal Multi-omics Reveals Subset-Specific Mechanisms Underlying Irritable Bowel Syndrome
09-10, doi: 10.1016/j.cell.2020.08.007
【主編評(píng)語(yǔ)】腸道微生物組的變化可能參與了腸易激綜合征（IBS）的發(fā)生發(fā)展，但背后的機(jī)制仍待深入挖掘。Cell最新發(fā)表了來(lái)自美國(guó)梅奧診所Purna Kashyap團(tuán)隊(duì)與明尼蘇達(dá)大學(xué)Dan Knights團(tuán)隊(duì)的研究，通過(guò)縱向取樣的整合多組學(xué)方法，揭示了IBS及其不同亞型（便秘型、腹瀉型）的腸道菌群組成和功能（代謝產(chǎn)物、基因）的變化特征，以及這些變化可能參與IBS發(fā)病的機(jī)制，相關(guān)的菌群代謝物和宿主-微生物代謝途徑或是潛在的IBS治療靶點(diǎn)。該研究是通過(guò)縱向多組學(xué)方法研究人類疾病機(jī)制的一個(gè)范例。（@mildbreeze）
Cell[IF:38.637]
① 克羅恩病患者腸系膜脂肪組織（MAT）的爬行脂肪（CrF）中，存在一群從腸道移位出來(lái)的粘膜相關(guān)微生物，能在CrF中存活；② 無(wú)害梭菌是其中最常見的，在粘膜和脂肪中存在菌株變化，可能對(duì)脂質(zhì)環(huán)境有偏好性；③ 悉生小鼠中，無(wú)害梭菌能移位至MAT，引起MAT擴(kuò)張；④ CrF的特征為促纖維化和促脂肪生成，且有活躍的微生物免疫監(jiān)視；⑤ 無(wú)害梭菌能增加促纖維化的M2巨噬細(xì)胞，從而可能通過(guò)刺激組織重塑形成脂肪組織屏障，以防止細(xì)菌從腸道向全身擴(kuò)散。
Translocation of Viable Gut Microbiota to Mesenteric Adipose Drives Formation of Creeping Fat in Humans
09-28, doi: 10.1016/j.cell.2020.09.009
【主編評(píng)語(yǔ)】“爬行脂肪”（creeping fat）是指克羅恩病患者炎癥/纖維化腸段周圍肥大的腸系膜脂肪組織。Cell最新發(fā)表的一項(xiàng)研究表明，在克羅恩病患者中，這種“爬行脂肪”的現(xiàn)象其實(shí)是一種人體的保護(hù)性反應(yīng)。這些增生的腸系膜脂肪組織在移位出來(lái)的無(wú)害梭菌（Clostridium innocuum）等腸道細(xì)菌的刺激下，“爬”向有腸屏障損傷的位點(diǎn)，從而“堵上”腸道的“漏洞”，阻止?jié)撛诘挠泻?xì)菌抗原順著屏障損傷從腸道中擴(kuò)散出來(lái)。（@mildbreeze）
Science[IF:41.845]
① 在慢性腎病（CKD）模型小鼠中，高Saa（含硫氨基酸）飲食能增加盲腸硫水平，并減輕CKD癥狀和腎損傷；② 飲食中的Saa含量高低對(duì)小鼠腸道菌群組成影響不大，但其被菌群代謝產(chǎn)生的硫化物能通過(guò)調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)硫巰基化修飾來(lái)影響細(xì)菌功能；③ 在CKD患者腸道中富集的大腸桿菌，其分泌的酶TnaA可分解色氨酸產(chǎn)生吲哚；④ 高Saa飲食導(dǎo)致TnaA硫巰基化修飾水平升高，抑制其活性，這減少了腸內(nèi)吲哚生成，降低尿毒素硫酸吲哚酚水平，從而減少CKD小鼠腎損傷。
Diet posttranslationally modifies the mouse gut microbial proteome to modulate renal function
09-18, doi: 10.1126/science.abb3763
【主編評(píng)語(yǔ)】腸道菌群與慢性腎病存在關(guān)聯(lián)。膳食蛋白質(zhì)可被菌群代謝為硫化氫、吲哚、硫酸吲哚酚等物質(zhì)，其中吲哚和硫酸吲哚酚是尿毒素，而硫化氫則具有多種生理調(diào)節(jié)作用，包括通過(guò)翻譯后修飾來(lái)影響蛋白質(zhì)功能。Science發(fā)表的一項(xiàng)最新研究發(fā)現(xiàn)，飲食中的含硫氨基酸被腸道菌群代謝后產(chǎn)生的硫化物，可通過(guò)對(duì)大腸桿菌的色氨酸酶進(jìn)行硫巰基化修飾，來(lái)抑制其產(chǎn)生吲哚的能力，從而減少尿毒素生成和小鼠腎損傷。這些發(fā)現(xiàn)說(shuō)明，飲食能通過(guò)翻譯后修飾的機(jī)制，在不影響腸道菌群組成的情況下改變腸道菌群功能，為研究飲食-菌群互作和靶向菌群的飲食干預(yù)帶來(lái)新的啟示。（@mildbreeze）
Cell[IF:38.637]
① 小腸上皮細(xì)胞（SIEC）的轉(zhuǎn)錄組及MHCII表達(dá)呈現(xiàn)由進(jìn)食介導(dǎo)的晝夜震蕩特征；② 改變小鼠的進(jìn)食節(jié)律（擾亂腸道生物鐘、限時(shí)進(jìn)食、延遲進(jìn)食）或飲食組成（高脂飲食）影響SIEC的MHCII表達(dá)節(jié)律；③ 這種調(diào)控作用依賴于小腸菌群，小腸菌群通過(guò)接觸依賴性方式誘導(dǎo)SIEC的MHCII表達(dá)；④ SIEC的MHCII表達(dá)調(diào)控CD4+ IL-10+上皮內(nèi)淋巴細(xì)胞比例及小腸上皮屏障通透性的節(jié)律性變化；⑤ 時(shí)差可破壞上述飲食-菌群-免疫軸，惡化小鼠的克羅恩病樣腸炎。
Diet Diurnally Regulates Small Intestinal Microbiome-Epithelial-Immune Homeostasis and Enteritis
09-03, doi: 10.1016/j.cell.2020.08.027
【主編評(píng)語(yǔ)】在一天的24小時(shí)里，小腸暴露于不同的食物及菌群抗原中，但仍維持免疫穩(wěn)態(tài)，在遺傳易感性個(gè)體中，這一平衡的破壞可能導(dǎo)致克羅恩病。Cell最新發(fā)表了來(lái)自以色列魏茨曼科學(xué)研究所Eran Elinav團(tuán)隊(duì)和Hagit Shapiro團(tuán)隊(duì)的最新合作研究，發(fā)現(xiàn)飲食組成及進(jìn)食節(jié)律可通過(guò)調(diào)控小腸菌群的周期性變化，介導(dǎo)小腸上皮細(xì)胞（SIEC）中的MHCII表達(dá)的晝夜震蕩，從而影響小腸的IL-10分泌及上皮屏障功能的節(jié)律。破壞上述飲食-菌群-SIEC MHCII-IL-10-上皮屏障軸的節(jié)律可惡化小鼠的克羅恩病樣腸炎，對(duì)該軸的調(diào)控或可作為未來(lái)克羅恩病干預(yù)的潛在策略。（@szx）
Cell[IF:38.637]
① 開發(fā)2種方法，可對(duì)成年小鼠和人的腸神經(jīng)系統(tǒng)（ENS）進(jìn)行單核RNA測(cè)序；② 分析小鼠腸道~119萬(wàn)個(gè)細(xì)胞核，獲得5068個(gè)回腸+結(jié)腸神經(jīng)元，鑒定出21個(gè)神經(jīng)元亞群和3個(gè)神經(jīng)膠質(zhì)亞群；③ ENS基因表達(dá)受生物節(jié)律和所處腸段的影響，CNS疾病相關(guān)基因在ENS中隨衰老而表達(dá)升高；④ 分析~44萬(wàn)個(gè)人結(jié)腸細(xì)胞核，獲得1445個(gè)神經(jīng)元，與小鼠的結(jié)腸神經(jīng)元亞群存在一致和差異；⑤ 鑒定出ENS與上皮、間質(zhì)和免疫細(xì)胞之間的潛在互作；⑥ 人ENS中表達(dá)與腸道和腸外疾病相關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)基因。
The Human and Mouse Enteric Nervous System at Single-Cell Resolution
09-03, doi: 10.1016/j.cell.2020.08.003
【主編評(píng)語(yǔ)】盡管腸神經(jīng)元數(shù)量稀少（比如在結(jié)腸中，神經(jīng)元在結(jié)腸細(xì)胞總數(shù)中只占不到1%），腸神經(jīng)系統(tǒng)（ENS）對(duì)腸道功能起到重要的調(diào)控作用。但由于技術(shù)限制，這些神經(jīng)元難以從組織中分離出來(lái)，導(dǎo)致人們一直缺乏對(duì)ENS分子特征的系統(tǒng)性研究。Cell最新上線來(lái)自美國(guó)Broad Institute的研究，開發(fā)了兩種可用于對(duì)ENS和其它組織進(jìn)行單細(xì)胞核RNA測(cè)序的方法（RAISIN RNA-seq和MIRACL-seq），并用這些方法分析了小鼠和人體腸道中的160萬(wàn)個(gè)細(xì)胞及其中的6513個(gè)腸神經(jīng)元，揭示了腸神經(jīng)元的非凡的多樣性。該研究鑒定出幾十個(gè)神經(jīng)元亞群，揭示了不同因素（年齡、物種、生物節(jié)律、所處腸段等）對(duì)ENS的組成和基因表達(dá)的影響，以及腸神經(jīng)與其它腸道細(xì)胞之間的潛在互作，并為腸神經(jīng)元通過(guò)神經(jīng)-免疫互作機(jī)制參與腸道和腸外疾病提供了新證據(jù)。（@mildbreeze）
Cell[IF:38.637]
① 缺乏巨噬細(xì)胞會(huì)導(dǎo)致小鼠遠(yuǎn)端（而非近端）結(jié)腸上皮細(xì)胞大量死亡，破壞腸道屏障的完整性；② 遠(yuǎn)端結(jié)腸上皮下高表達(dá)CD11c的巨噬細(xì)胞，會(huì)向腸上皮細(xì)胞間插入氣球樣的突出物（BLP），這些BLP中富含含有上皮細(xì)胞膜的內(nèi)溶酶體；③ BLP能對(duì)腸上皮細(xì)胞吸收的液體進(jìn)行迅速的取樣檢查，感知其中是否有真菌毒素（如膠霉毒素），從而在真菌毒素富集時(shí)阻止腸上皮吸收液體，保護(hù)腸上皮細(xì)胞免于由吸收真菌毒素導(dǎo)致的細(xì)胞死亡，維持腸屏障完整性。
Macrophages Maintain Epithelium Integrity by Limiting Fungal Product Absorption
09-23, doi: 10.1016/j.cell.2020.08.048
【主編評(píng)語(yǔ)】結(jié)腸中包含大量的腸道微生物，同時(shí)也是吸收液體的主要器官。腸道菌群中的真菌產(chǎn)生的一些有毒代謝物會(huì)損傷腸上皮功能，因此結(jié)腸對(duì)于液體的吸收必須受到嚴(yán)格的調(diào)控，來(lái)避免吸收有毒的真菌代謝物。Cell最新發(fā)表的一項(xiàng)研究，揭示了巨噬細(xì)胞在維護(hù)結(jié)腸上皮-菌群互作中的一種新作用。該研究表明，遠(yuǎn)端結(jié)腸中存在一群特殊的巨噬細(xì)胞，能向腸上皮伸出氣球樣的突出物，這些突出物能“檢查”腸上皮吸收的液體，在檢測(cè)到真菌毒素富集時(shí)，叫停腸上皮的液體吸收功能，從而保護(hù)腸上皮免受真菌毒素的荼毒。（@mildbreeze）
Nature[IF:42.778]
① 構(gòu)建一個(gè)支架系統(tǒng)微芯片，可“指引”腸道干細(xì)胞自組織生成類似腸道的管形上皮層，具有管腔以及隱窩樣和絨毛樣空間結(jié)構(gòu)；② 將此“迷你腸道”與外部泵送系統(tǒng)連通，灌注培養(yǎng)液以清除死亡細(xì)胞，可使其保持穩(wěn)定長(zhǎng)達(dá)≥1個(gè)月；③ 該“迷你腸道”中含有常規(guī)腸道類器官中罕見的稀有特化細(xì)胞類型，包括類M細(xì)胞和腸內(nèi)分泌細(xì)胞等，并具有腸道的關(guān)鍵生理特點(diǎn)和再生能力；④ 其管腔內(nèi)可定植微生物，用以研究宿主-微生物互作。
Homeostatic mini-intestines through scaffold-guided organoid morphogenesis
09-16, doi: 10.1038/s41586-020-2724-8
【主編評(píng)語(yǔ)】類器官是研究組織器官生理和功能的前沿模型，但是目前的類器官基本都是封閉的囊性結(jié)構(gòu)，且存活期較短，限制了其研究應(yīng)用。Nature發(fā)表的一項(xiàng)新研究報(bào)道了一種新的類器官培養(yǎng)方法，通過(guò)支架微芯片引導(dǎo)腸道干細(xì)胞形成類似腸道的管形類器官。這種“迷你腸道”可以長(zhǎng)期保持穩(wěn)定，并擁有與真實(shí)腸道相似的細(xì)胞類型多樣性、結(jié)構(gòu)和功能，也可以支持微生物的定植，或是研究宿主-微生物互作等許多腸道相關(guān)問(wèn)題的好模型，其中用到的培養(yǎng)技術(shù)對(duì)于其它的類器官研究也有借鑒價(jià)值。（@mildbreeze）
Nature Materials[IF:38.663]
① 小鼠腸道類器官與1型天然淋巴細(xì)胞（ILC1）共培養(yǎng)時(shí)，ILC1分泌的TGF-β1通過(guò)誘導(dǎo)腸上皮p38γ磷酸化，促進(jìn)CD44v6+隱窩細(xì)胞擴(kuò)增；② IBD患者病灶處分離的ILC1特異性表達(dá)TGF-β1、MMP9，促進(jìn)人腸道類器官上皮及間充質(zhì)細(xì)胞表達(dá)CD44v6；③ 用3D合成水凝膠共培系統(tǒng)對(duì)ILC1重塑腸道基質(zhì)過(guò)程進(jìn)行分析和量化，表明ILC1可通過(guò)影響纖連蛋白1的沉積與MMP介導(dǎo)的降解，驅(qū)動(dòng)基質(zhì)的僵化與軟化；④ ILC1驅(qū)動(dòng)類器官的胞外基質(zhì)重塑、腫瘤生長(zhǎng)和纖維化等基因表達(dá)。
ILC1 drive intestinal epithelial and matrix remodelling
09-07, doi: 10.1038/s41563-020-0783-8
【主編評(píng)語(yǔ)】腸上皮細(xì)胞（IEC）與天然淋巴細(xì)胞（ILC）及其相互作用是腸道屏障的重要組成部分，炎癥性腸?。↖BD）患者的腸炎病灶處存在1型ILC（ILC1）積累，但I(xiàn)EC與ILC1的相互作用及其在IBD中的意義尚不清楚。Nature Materials近期發(fā)表的一項(xiàng)研究通過(guò)腸道類器官、合成水凝膠共培養(yǎng)系統(tǒng)等方法，揭示了ILC1促進(jìn)腸隱窩生長(zhǎng)和胞外基質(zhì)重塑的作用，而ILC1在腸道炎癥病灶處的積聚可能是驅(qū)動(dòng)腫瘤發(fā)生和纖維化等IBD不良預(yù)后的潛在原因。（@mildbreeze）
Trends in Biotechnology[IF:14.343]
① 2D細(xì)胞培養(yǎng)為靜態(tài)模型，組成簡(jiǎn)單，便于研究細(xì)胞基本行為，可通過(guò)Transwell共培養(yǎng)研究細(xì)胞間互作；② 微流體模型易于研究腸屏障功能，優(yōu)勢(shì)是具有動(dòng)態(tài)培養(yǎng)、循環(huán)張力和厭氧感應(yīng)式的特點(diǎn)；③ 類器官和膠體微滴培養(yǎng)常用于患者細(xì)胞培養(yǎng)，能有效呈現(xiàn)病理特性，易于研究細(xì)胞間機(jī)械作用力；④ 3D組織培養(yǎng)除具備其他模型的特點(diǎn)外，可實(shí)現(xiàn)免疫細(xì)胞長(zhǎng)期共培養(yǎng)，增加了上皮細(xì)胞生長(zhǎng)區(qū)域；⑤ 新模型系統(tǒng)的開發(fā)利用對(duì)腸道先天免疫系統(tǒng)疾病的研究至關(guān)重要。
In Vitro Models of Intestine Innate Immunity
08-24, doi: 10.1016/j.tibtech.2020.07.009
【主編評(píng)語(yǔ)】動(dòng)物模型作為體內(nèi)模型在研究腸道疾病發(fā)揮了很大的作用，然而在一定程度上看，動(dòng)物模型與人類疾病存在差異，而這些針對(duì)差異的研究，應(yīng)用人類本身細(xì)胞構(gòu)建的體外模型可以發(fā)揮重要的作用。近期一篇發(fā)表在Cell旗下綜述期刊Trends in Biotechnology上的關(guān)于體外腸道模型綜述的文章，詳細(xì)總結(jié)了目前主要用到的體外模型，包括有2D細(xì)胞模型、膜支持的微流體模型、類器官模型和3D組織培養(yǎng)模型，在腸道先天免疫研究中的應(yīng)用、優(yōu)勢(shì)和特點(diǎn)。（@Zhonghua）
Cell Metabolism[IF:21.567]
① 免疫細(xì)胞通過(guò)糖酵解、三羧酸循環(huán)（TCA）、戊糖磷酸途徑、脂肪酸及氨基酸代謝，產(chǎn)生能量并實(shí)現(xiàn)免疫功能；② 丁酸輔酶A進(jìn)入腸上皮細(xì)胞線粒體進(jìn)行β-氧化、參與TCA、氧化磷酸化產(chǎn)生能量；③ SCFA影響ATP/AMP轉(zhuǎn)化、蛋白激酶活性及組蛋白乙?；ㄟ^(guò)雙重機(jī)制調(diào)節(jié)mTOR通路控制T細(xì)胞功能；④ 丁酸推動(dòng)色氨酸轉(zhuǎn)化為5-羥吲哚乙酸、結(jié)合B細(xì)胞芳香烴受體促進(jìn)免疫抑制；⑤ IBD中上皮細(xì)胞谷氨酰胺代謝失調(diào)、線粒體功能障礙引發(fā)炎癥，且與SCFA多寡相關(guān)。
The Gut Microbiota at the Service of Immunometabolism
09-17, doi: 10.1016/j.cmet.2020.09.004
【主編評(píng)語(yǔ)】免疫代謝包含免疫系統(tǒng)對(duì)機(jī)體大代謝的影響和免疫細(xì)胞自身代謝需求與環(huán)境因素的互作。Cell metabolism上發(fā)表一篇觀點(diǎn)，對(duì)后者特別是腸道菌群對(duì)免疫細(xì)胞代謝的主導(dǎo)作用進(jìn)行了討論。詳述了菌群相關(guān)代謝產(chǎn)物如短鏈脂肪酸（SCFA）、膽酸鹽、色氨酸等對(duì)腸上皮細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、B細(xì)胞、先天性淋巴細(xì)胞及多種效應(yīng)T細(xì)胞的調(diào)節(jié)機(jī)理，及其在感染、IBD等病理情況下的互作。作者指出未來(lái)可關(guān)注特異性代謝產(chǎn)物添加、刪除、代謝通路調(diào)控作為治療手段的研究。（@solo）
Immunity[IF:22.553]
① 負(fù)向能量平衡（攝取<消耗）促進(jìn)代謝重編程（脂肪酸氧化>糖酵解），以調(diào)節(jié)免疫應(yīng)答等生理過(guò)程，從而促進(jìn)健康及長(zhǎng)壽；② 肥胖相關(guān)的能量失調(diào)導(dǎo)致脂肪組織中的促炎性免疫細(xì)胞浸潤(rùn)及NLRP3炎性小體活化，以促進(jìn)2型糖尿病、心血管疾病、癌癥等發(fā)生，并弱化針對(duì)病原體的免疫防御；③ 蛋白及必需氨基酸限制誘導(dǎo)轉(zhuǎn)硫作用途徑及整合性應(yīng)激應(yīng)答，以抑制NLRP3炎性小體介導(dǎo)的炎癥及Th17應(yīng)答；④ 卡路里限制減少循環(huán)中的免疫細(xì)胞，并降低系統(tǒng)性炎癥應(yīng)答。
Dietary Regulation of Immunity
09-15, doi: 10.1016/j.immuni.2020.08.013
【主編評(píng)語(yǔ)】整合性免疫代謝應(yīng)答（IIMR）將膳食攝入、能量利用及儲(chǔ)存與免疫應(yīng)答調(diào)控相聯(lián)系，對(duì)于穩(wěn)態(tài)的維持與恢復(fù)至關(guān)重要。來(lái)自Immunity上發(fā)表的一篇綜述文章，詳細(xì)介紹了飲食中的宏量營(yíng)養(yǎng)素?cái)z入及其代謝與免疫系統(tǒng)的關(guān)聯(lián)，重點(diǎn)討論了飲食中葡萄糖、脂肪、蛋白等組分的變化可能如何影響免疫系統(tǒng)——尤其是脂肪組織中的免疫應(yīng)答。（@szx）
Nature Reviews Nephrology[IF:20.711]
① 表觀遺傳改變、腸道失調(diào)、線粒體功能障礙、炎癥、氧化應(yīng)激和早衰是慢性腎?。–KD）的常見特征；② 利用生物活性營(yíng)養(yǎng)素（如姜黃素、花青素、白藜蘆醇和槲皮素等等）采用“以食為藥”的方法，或能對(duì)這些表型進(jìn)行靶向干預(yù)；③ 腸道失調(diào)與炎癥和心血管風(fēng)險(xiǎn)增加相關(guān)，菌群和飲食干預(yù)可改變腸道菌群和尿毒素生成；④ 抗衰老膳食化合物或可減輕CKD早衰及相關(guān)并發(fā)癥如線粒體代謝紊亂的影響；⑤ 一些生物活性物質(zhì)或可調(diào)節(jié)促炎轉(zhuǎn)錄因子和炎性小體的表達(dá)。
Food as medicine: targeting the uraemic phenotype in chronic kidney disease
09-22, doi: 10.1038/s41581-020-00345-8
【主編評(píng)語(yǔ)】中國(guó)自古就有”藥食同源“的說(shuō)法，很多食物或者某些膳食模式可用于防治疾病。近期發(fā)表于Nature Reviews Nephrology的一篇綜述，介紹了“以食為藥”（food as medicine）治療慢性腎?。–KD）的相關(guān)研究進(jìn)展。文章討論了“以食為藥”和“食物組”（foodome）的概念，歸納了多種食物和/或其生物活性成分對(duì)CKD中不同病生理特征（表觀遺傳、腸道菌群組成和功能、早衰、線粒體功能、炎癥和氧化應(yīng)激相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子、一氧化氮生成）的靶向性和多效性的調(diào)控機(jī)制。文章干貨頗多配圖精美，感興趣的讀者可詳細(xì)閱讀。（@mildbreeze）
Cell Metabolism[IF:21.567]
① C57BL/6小鼠在18月齡膳食補(bǔ)充AKG顯著延長(zhǎng)雌鼠壽命，延長(zhǎng)雌雄鼠中年健康時(shí)間；② AKG膳食推遲衰老的發(fā)生，較大程度增加健康時(shí)間，降低發(fā)病率，推遲發(fā)病時(shí)間；③ AKG顯著降低衰老表型嚴(yán)重程度，改善運(yùn)動(dòng)能力，且不具有副作用，但對(duì)心功能改善不明顯；④ AKG膳食小鼠中未檢測(cè)到mTORC1信號(hào)活性減低；⑤ AKG膳食顯著緩解雌鼠衰老導(dǎo)致的炎癥因子水平上升，上調(diào)抗炎因子IL10表達(dá)，減輕慢性炎癥水平；⑥ AKG處理細(xì)胞可以改善衰老相關(guān)的分泌表型（SASP）。
Alpha-Ketoglutarate, an Endogenous Metabolite, Extends Lifespan and Compresses Morbidity in Aging Mice
09-01, doi: 10.1016/j.cmet.2020.08.004
【主編評(píng)語(yǔ)】衰老的機(jī)制和延緩衰老已經(jīng)成為目前生物醫(yī)學(xué)的重點(diǎn)問(wèn)題。在一些無(wú)脊椎模型動(dòng)物的研究中發(fā)現(xiàn)，三羧酸循環(huán)的中間代謝物α-酮戊二酸（AKG）可以顯著延緩衰老，然而AKG在哺乳動(dòng)物中是否具有相近的效果并不清楚。近期一篇發(fā)表在Cell Metabolism的論文研究了膳食添加AKG對(duì)于小鼠衰老的作用，研究發(fā)現(xiàn)在18月齡的小鼠膳食中添加2%的CaAKG（α-酮戊二酸鈣鹽）可以顯著改善小鼠的衰老的表型，推遲衰老的發(fā)生和嚴(yán)重程度，延長(zhǎng)雌性小鼠的壽命。通過(guò)對(duì)細(xì)胞因子初步分析發(fā)現(xiàn)AKG可以抑制衰老相關(guān)炎癥細(xì)胞因子的表達(dá)，上調(diào)抗炎因子IL-10，從而抑制衰老導(dǎo)致的慢性炎癥，延緩衰老的進(jìn)程。（@Zhonghua）
JAMA Oncology[IF:24.799]
① 納入1171名未治療的局部晚期或轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌（CRC）患者，存活患者中位隨訪時(shí)間為5.4年；② 咖啡攝入的增加與癌癥進(jìn)展和死亡風(fēng)險(xiǎn)的降低有關(guān)，1杯咖啡/天增量的風(fēng)險(xiǎn)比（HR）分別為0.95和0.93；③ 相比不喝咖啡的人，每天喝2-3杯咖啡的參與者其總生存期（OS）和無(wú)進(jìn)展生存期（PFS）的多變量HR均為0.82；④ 每天喝>4杯咖啡的參與者其OS和PFS的多變量HR分別為0.64和0.78；⑤ 含咖啡因和不含咖啡因的咖啡都具有顯著相關(guān)性。
Association of Coffee Intake With Survival in Patients With Advanced or Metastatic Colorectal Cancer
09-17, doi: 10.1001/jamaoncol.2020.3938
【主編評(píng)語(yǔ)】一些在咖啡中發(fā)現(xiàn)的化合物具有抗氧化、抗炎和胰島素增敏的作用，可能有助于抗癌活性。流行病學(xué)研究已確定了咖啡攝入量的增加與結(jié)直腸癌（CRC）復(fù)發(fā)和死亡率降低之間的聯(lián)系。但晚期或轉(zhuǎn)移性CRC患者咖啡飲用量與生存率之間的關(guān)系尚不清楚。最新發(fā)表在JAMA Oncology的前瞻性觀察隊(duì)列研究發(fā)現(xiàn)，在晚期或轉(zhuǎn)移性CRC患者中，飲用咖啡可能與疾病進(jìn)展和死亡風(fēng)險(xiǎn)的降低有關(guān)，但需要進(jìn)一步的研究來(lái)闡明潛在的生物學(xué)機(jī)制。（@Lexi）
Science[IF:41.845]
① 調(diào)節(jié)腸道菌群的方法包括糞菌移植（FMT）、多菌株群落、飲食干預(yù)、益生菌/元和后生元等，在治療一些腸道和系統(tǒng)性疾病上有一定效果；② 選擇合適的菌群調(diào)節(jié)策略需考慮菌群失調(diào)的程度和特征；③ FMT的特性在于其提供的菌群多樣性有助于恢復(fù)菌群的功能冗余，但也存在可重復(fù)性等方面的局限，安全性、供/受體因素、劑量和移植途徑等是FMT應(yīng)考慮的因素；④ 單/多菌株的活菌藥物，飲食/益生元干預(yù)及其與FMT或活菌藥物的聯(lián)合使用，也是臨床研究熱點(diǎn)。
Modulating gut microbes
09-11, doi: 10.1126/science.abc3965
【主編評(píng)語(yǔ)】美國(guó)德州大學(xué)MD安德森癌癥中心的Jennifer Wargo近期在Science發(fā)表一篇科普文章，介紹了幾種調(diào)節(jié)腸道菌群的干預(yù)方法（糞菌移植、活菌藥物、飲食和益生元等）用于疾病治療的優(yōu)勢(shì)、特點(diǎn)和挑戰(zhàn)。（@mildbreeze）
Gut[IF:19.819]
① 對(duì)比64名IBD患者與45名健康人，患者糞便中的血管生成素（ANG）水平顯著降低；② 在不同的結(jié)腸炎小鼠模型中，缺失Ang1可引起腸道菌群失調(diào)，惡化結(jié)腸炎；③ Ang1缺失導(dǎo)致小鼠腸道菌群中的毛螺菌科減少、α-變形菌綱增加，兩者分別可緩解或惡化DSS誘導(dǎo)的結(jié)腸炎；④ 機(jī)制上，ANG通過(guò)直接結(jié)合α-變形菌破壞其細(xì)胞膜完整性，以抑制α-變形菌綱，從而促進(jìn)毛螺菌科生長(zhǎng)；⑤ 口服ANG1可恢復(fù)Ang1缺陷小鼠的腸道菌群組成，緩解結(jié)腸炎。
Angiogenin maintains gut microbe homeostasis by balancing α-Proteobacteria and Lachnospiraceae
08-25, doi: 10.1136/gutjnl-2019-320135
【主編評(píng)語(yǔ)】抗菌肽在維持腸道健康中發(fā)揮重要作用，并與炎癥性腸病（IBD）相關(guān)，血管生成素（ANG）是一種腸道分泌的抗菌肽。浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第一醫(yī)院的許正平、盛靜浩與團(tuán)隊(duì)在Gut上發(fā)表的一項(xiàng)最新研究，發(fā)現(xiàn)ANG可以調(diào)節(jié)腸道菌群穩(wěn)態(tài)，從而對(duì)模型小鼠的結(jié)腸炎起抑制作用。糞便ANG水平以及相關(guān)腸道細(xì)菌的改變，在IBD患者中也同樣存在。該研究提示，靶向ANG或可作為菌群失調(diào)相關(guān)腸道疾病的潛在治療策略。（@szx）
Gastroenterology[IF:17.373]
① 在2種結(jié)直腸癌小鼠模型中，嗜熱鏈球菌可抑制腫瘤生長(zhǎng)；② 嗜熱鏈球菌及其條件培養(yǎng)基可抑制結(jié)直腸癌細(xì)胞系的存活；③ 嗜熱鏈球菌條件培養(yǎng)基中＞100kDa的組分可誘導(dǎo)結(jié)直腸癌細(xì)胞的凋亡及在G0/G1期的停滯，并可抑制裸鼠中的結(jié)直腸癌移植瘤的生長(zhǎng)；④ 嗜熱鏈球菌分泌的β-半乳糖苷酶在體外及體內(nèi)均有顯著的抑制結(jié)直腸癌作用；⑤ β-半乳糖苷酶可增加雙歧桿菌屬及乳桿菌屬的益生菌的豐度，并通過(guò)促進(jìn)半乳糖產(chǎn)生抑制Hippo信號(hào)通路以激活氧化磷酸化。
Streptococcus thermophilus inhibits colorectal tumorigenesis through secreting β-galactosidase
09-10, doi: 10.1053/j.gastro.2020.09.003
【主編評(píng)語(yǔ)】嗜熱鏈球菌是酸奶生產(chǎn)中使用的一種益生菌，此前研究對(duì)526份糞便樣本的測(cè)序分析鑒定出結(jié)直腸癌患者的嗜熱鏈球菌減少。香港中文大學(xué)胡嘉麒、于君、陳德威和澳門科技大學(xué)伍建林與團(tuán)隊(duì)，在Gastroenterology上發(fā)表的一項(xiàng)最新研究發(fā)現(xiàn)，嗜熱鏈球菌可顯著抑制結(jié)直腸癌細(xì)胞系的存活，并可顯著抑制小鼠模型中的結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展。進(jìn)一步分析表明，嗜熱鏈球菌的抗腫瘤作用主要由其分泌的β-半乳糖苷酶所介導(dǎo)，后者可調(diào)控腸道菌群組成以增加有益菌的豐度，并可通過(guò)促進(jìn)半乳糖的產(chǎn)生以抑制Hippo信號(hào)通路。（@szx）
European Heart Journal[IF:22.673]
① 納入來(lái)自6個(gè)種族的4672名受試者，分析糞便菌群組成、糞便短鏈脂肪酸（SCFA）水平及血壓；② 糞便菌群組成可解釋4.4%的收縮壓差異，Roseburia菌屬、梭菌屬、Romboutsia菌屬、瘤胃菌科可最好地預(yù)測(cè)收縮壓；③ 菌群組成對(duì)收縮壓差異的解釋在荷蘭人中最高（4.8%），在南亞蘇里南人、非洲蘇里南人、加納人、摩洛哥人、土耳其人中較低（<0.8%）；④ 收縮壓較低的荷蘭受試者中，產(chǎn)SCFA菌的豐度較高，但糞便SCFA水平較低。
Associations between gut microbiota, faecal short-chain fatty acids, and blood pressure across ethnic groups: the HELIUS study
09-01, doi: 10.1093/eurheartj/ehaa704
【主編評(píng)語(yǔ)】European Heart Journal上發(fā)表的一項(xiàng)隊(duì)列研究結(jié)果，對(duì)來(lái)自6個(gè)種族的近5000名受試者的糞便菌群組成、糞便短鏈脂肪酸（SCFA）水平及血壓進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)糞便菌群組成與血壓相關(guān)，但關(guān)聯(lián)度在不同種族中有所差異（在荷蘭人中最高）。有意思的是，在荷蘭人中，較低的血壓與較高的產(chǎn)SCFA菌豐度和較低的糞便SCFA水平相關(guān)，研究者推測(cè)這可能是因?yàn)楫a(chǎn)SCFA菌能促進(jìn)腸道對(duì)SCFA的吸收。（@szx）
Cell Metabolism[IF:21.567]
① 溫?zé)岘h(huán)境（34℃）可改善成年小鼠的骨骼微結(jié)構(gòu)和強(qiáng)度，并在骨質(zhì)疏松小鼠模型中，預(yù)防由切除卵巢引起的骨質(zhì)流失；② 這些益處是由溫?zé)嵴T導(dǎo)的腸道菌群改變所介導(dǎo)的；③ 對(duì)人類數(shù)據(jù)的薈萃分析顯示，髖骨折發(fā)生率與溫度之間存在獨(dú)立于維生素D和鈣水平的負(fù)相關(guān)性；④ 宏基因組和代謝組分析顯示，溫?zé)岘h(huán)境增強(qiáng)了菌群的多胺生物合成，使乙酰亞精胺和腐胺等多胺水平升高；⑤ 補(bǔ)充精胺和亞精胺可增加小鼠骨強(qiáng)度，而抑制多胺合成會(huì)限制溫?zé)釋?duì)骨骼的益處。
Warmth Prevents Bone Loss Through the Gut Microbiota
09-10, doi: 10.1016/j.cmet.2020.08.012
【主編評(píng)語(yǔ)】骨質(zhì)疏松是常見的代謝性骨病，以骨量低和微結(jié)構(gòu)退化為特征，尤其高發(fā)于絕經(jīng)后的老年女性。Cell Metabolism發(fā)表的一項(xiàng)最新研究發(fā)現(xiàn)，溫?zé)岘h(huán)境可通過(guò)增強(qiáng)腸道菌群的多胺生物合成功能，改善小鼠的骨骼強(qiáng)度、減少骨質(zhì)疏松，對(duì)人類數(shù)據(jù)的薈萃分析也支持溫度對(duì)骨骼健康的影響。（@mildbreeze）
Nature Reviews Disease Primers[IF:40.689]
① UC發(fā)病率地區(qū)差異但不受種族影響，多種遺傳/環(huán)境因素影響UC風(fēng)險(xiǎn)；② UC致病機(jī)制：菌群失調(diào)導(dǎo)致結(jié)腸粘液層受損，促進(jìn)細(xì)菌易位并激活巨噬細(xì)胞及其它APC，增強(qiáng)趨化/促炎因子分泌，以促進(jìn)免疫細(xì)胞浸潤(rùn)；③ 應(yīng)綜合病史、內(nèi)窺、組織學(xué)及實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)進(jìn)行診斷，糞便鈣衛(wèi)蛋白等或可作為非侵入性診斷標(biāo)志物；④ 根據(jù)病程采用5-ASA、類固醇、生物制劑（靶向TNF、IL-12/23、整合素）、JAK抑制劑、手術(shù)等治療手段；⑤ 應(yīng)關(guān)注患者的腸外癥狀及生活質(zhì)量的改善。
Ulcerative colitis (Nature Reviews Disease Primers)
09-10, doi: 10.1038/s41572-020-0205-x
【主編評(píng)語(yǔ)】Nature Reviews Disease Primers上發(fā)表的一篇綜述文章，詳細(xì)介紹了潰瘍性結(jié)腸炎（UC）的流行病學(xué)、風(fēng)險(xiǎn)因素、發(fā)病機(jī)制、診斷/篩查/預(yù)防、藥物及手術(shù)等治療及管理方式，并討論了未來(lái)的研究方向，包括機(jī)制研究、治療目標(biāo)變化、新藥研發(fā)及個(gè)性化醫(yī)療。（@szx）
Gastroenterology[IF:17.373]
① 回腸CD患者及CD樣回腸炎小鼠模型的炎癥回腸組織中的簇細(xì)胞（tuft cell）數(shù)量顯著低于健康對(duì)照或野生型小鼠；② 簇細(xì)胞可分為ATOH1依賴性與ATOH1非依賴性兩類；③ ATOH1非依賴性簇細(xì)胞的擴(kuò)增與參與三羧酸循環(huán)的基因的表達(dá)增加相關(guān)，菌群產(chǎn)生的琥珀酸鹽可驅(qū)動(dòng)簇細(xì)胞的擴(kuò)增；④ 在2種回腸炎小鼠模型中，琥珀酸鹽處理可導(dǎo)致簇細(xì)胞的擴(kuò)增、增加GATA3+細(xì)胞及2型細(xì)胞因子（IL-22、IL-25及IL-13）、減少RORγt+ 細(xì)胞及IL-23，以緩解腸道炎癥。
Succinate Produced by Intestinal Microbes Promotes Specification of Tuft Cells to Suppress Ileal Inflammation
08-20, doi: 10.1053/j.gastro.2020.08.029
【主編評(píng)語(yǔ)】寄生蟲感染流行的國(guó)家的克羅恩?。–D）發(fā)病率較低，小腸中的簇細(xì)胞（tuft cell）可感知并誘導(dǎo)針對(duì)真核寄生蟲的免疫應(yīng)答。來(lái)自Gastroenterology上發(fā)表的一項(xiàng)最新研究，發(fā)現(xiàn)回腸CD患者及回腸炎小鼠模型的炎癥回腸組織中，簇細(xì)胞的數(shù)量顯著減少。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，腸道菌群產(chǎn)生的琥珀酸鹽可促進(jìn)簇細(xì)胞的擴(kuò)增，而在2種不同的回腸炎小鼠模型中，琥珀酸鹽處理可以簇細(xì)胞依賴性方式緩解腸道炎癥。（@szx）
Gastroenterology[IF:17.373]
① 納入中國(guó)不同地域6個(gè)民族的942名健康人，分析腸道真菌組和相關(guān)影響因素；② 不同人群的腸道真菌組有高度差異，城市化相關(guān)因素影響最大，城市人比農(nóng)村人的真菌豐富度低；③ 城市人中釀酒酵母增多，并與肝病相關(guān)血液參數(shù)負(fù)相關(guān)，而都柏林念珠菌減少，并與代謝相關(guān)的血液參數(shù)相關(guān)（與空腹HDL-C正相關(guān)，與空腹血糖負(fù)相關(guān)）；④ 真菌與血液參數(shù)的關(guān)聯(lián)呈地域和種族特異性；⑤ 同一屬的真菌大多受到食物的共調(diào)節(jié)，不同民族的真菌組特征與其飲食相關(guān)。
Population-level configurations of gut mycobiome across six ethnicities in urban and rural China
09-18, doi: 10.1053/j.gastro.2020.09.014
【主編評(píng)語(yǔ)】昆明醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院繆應(yīng)雷、王昆華和香港中文大學(xué)黃秀娟與團(tuán)隊(duì)，近期在Gastroenterology發(fā)表了一項(xiàng)關(guān)于中國(guó)人腸道真菌組的重要研究。該研究納入了香港和云南不同地區(qū)的6個(gè)民族的900多名健康人，系統(tǒng)性地分析了宿主、環(huán)境、飲食等多種因素（共118個(gè)變量）與腸道真菌組的關(guān)聯(lián)，揭示了地理、城市化、民族和飲食習(xí)慣等在塑造腸道真菌組中的重要影響。（@mildbreeze）
Cell Host and Microbe[IF:15.923]
① 納入來(lái)自中國(guó)香港和云南的930名健康志愿者，其中涵蓋漢、藏、苗、白、傣和哈尼6個(gè)名族，每個(gè)名族均有來(lái)自城市和農(nóng)村的參與者；② 20種宿主因素與人類腸道病毒組差異顯著相關(guān)，其中地理位置影響最大，不同名族的飲食習(xí)慣與某些病毒種類相關(guān)；③ 城市化增強(qiáng)了腸道病毒組個(gè)體間的差異性，城市居住時(shí)間與乳酸桿菌噬菌體、乳球菌噬菌體等多種噬菌體具有相關(guān)性；④ 被檢測(cè)的中國(guó)人群中，腸道病毒組比腸道細(xì)菌微生物組表現(xiàn)出更多的異質(zhì)性。
Human-Gut-DNA Virome Variations across Geography, Ethnicity, and Urbanization
09-09, doi: 10.1016/j.chom.2020.08.005
【主編評(píng)語(yǔ)】香港中文大學(xué)的Siew C. Ng和昆明醫(yī)科大學(xué)的Yinglei Miao合作在Cell Host and Microbe發(fā)表文章，繪制了中國(guó)人群的腸道DNA病毒組圖譜，揭示了基于群體的變異以及宿主和環(huán)境因素在人類腸道DNA病毒組形成過(guò)程中的重要性。（@愛的抉擇）
Nature Communications[IF:12.121]
① 在體外，短鏈脂肪酸可促進(jìn)CD4+ T細(xì)胞及ILC產(chǎn)生IL-22；② 丁酸鹽通過(guò)抑制組蛋白去乙?；福℉DAC），并激活GPR41以促進(jìn)缺氧誘導(dǎo)因子1α（HIF1α）及芳香烴受體（AhR）的表達(dá)，從而促進(jìn)IL-22的產(chǎn)生；③ 機(jī)制上，丁酸鹽可促進(jìn)HIF1α與IL-22啟動(dòng)子的HRE區(qū)域結(jié)合，并誘導(dǎo)IL-22啟動(dòng)子的HRE區(qū)域的組蛋白乙酰化，從而增強(qiáng)IL-22的表達(dá)；④ 在鼠檸檬酸桿菌感染誘導(dǎo)的小鼠結(jié)腸炎模型中，丁酸鹽通過(guò)促進(jìn)IL-22產(chǎn)生以緩解結(jié)腸炎。
Intestinal microbiota-derived short-chain fatty acids regulation of immune cell IL-22 production and gut immunity
09-08, doi: 10.1038/s41467-020-18262-6
【主編評(píng)語(yǔ)】天然淋巴細(xì)胞（ILC）與CD4+ T細(xì)胞產(chǎn)生的IL-22對(duì)于腸道免疫十分關(guān)鍵，但背后的調(diào)控機(jī)制尚未明確。Nature Communications上發(fā)表的一項(xiàng)最新研究，揭示了腸道菌群調(diào)節(jié)IL-22產(chǎn)生以維持腸道免疫穩(wěn)態(tài)的機(jī)制：腸道菌群代謝產(chǎn)生的短鏈脂肪酸（特別是丁酸鹽）可通過(guò)激活GPR41，并抑制組蛋白去乙?；?，從而促進(jìn)CD4+ T細(xì)胞及ILC產(chǎn)生IL-22，以緩解小鼠結(jié)腸炎。（@szx）
感謝本期日?qǐng)?bào)的創(chuàng)作者：orchid，Lexi，Johnson，高壓鍋里的水母，mildbreeze，szx，solo，營(yíng)養(yǎng)師陳彬林，楸楸，白藍(lán)木，Unbroken，愛的抉擇
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