物流業(yè)務從流轉(zhuǎn)稅的角度講，主要涉及到增值稅和營業(yè)稅兩大稅種。在增值稅和營業(yè)稅的征稅范圍中，并沒有明確規(guī)定"物流"這一稅目，因此，在稅務管理實踐中，從事物流的企業(yè)應當根據(jù)自身的經(jīng)營范圍和收入來源來確定如何繳納流轉(zhuǎn)稅。當然，如果物流企業(yè)兼營增值稅勞務或者提供交通運輸業(yè)和服務業(yè)以外的其他稅目的營業(yè)稅勞務，就超出了物流企業(yè)的經(jīng)營范圍，因此不再是純粹的物流企業(yè)，如郵政物流業(yè)務包括一體化物流，貨代業(yè)務，專遞、快遞業(yè)務、區(qū)域配送業(yè)務，倉儲業(yè)務等等。對于郵政物流業(yè)務，除《營業(yè)稅稅目注釋》中明確規(guī)定屬于郵政通信業(yè)稅目征稅范圍的業(yè)務外，其他物流業(yè)務應當比照上述原則征收流轉(zhuǎn)稅。因此，對物流企業(yè)的進行納稅檢查，就應該根據(jù)有關企業(yè)的業(yè)務情況，確定檢查方法。
對物流業(yè)務征稅，要根據(jù)物流業(yè)務的具體功能并對照現(xiàn)行稅法規(guī)定來分析，納稅檢查也要圍繞相應的經(jīng)濟事項進行。從稅收的角度講，物流業(yè)務包括以下幾個項目。
其一，交通運輸業(yè)務。物流企業(yè)提供搬運、裝卸、運輸勞務取得的收入，屬于營業(yè)稅"交通運輸業(yè)"稅目的征稅范圍，適用3%的稅率。
其二，服務業(yè)務。物流企業(yè)提供儲存、保管、信息勞務取得的收入屬于營業(yè)稅"服務業(yè)"稅目的征稅范圍，適用5%的稅率。
其三，增值稅業(yè)務。物流企業(yè)提供包裝、流通加工勞務取得的收入屬于增值稅的征稅范圍，其適用稅率要根據(jù)納稅人應繳納的增值稅所適用的增值稅率情況來確定。
其四，混合銷售業(yè)務。物流企業(yè)提供配送勞務取得的收入屬于混合銷售收入。因為物流企業(yè)一般是以提供營業(yè)稅勞務為主，所以對于物流企業(yè)的混合銷售行為（在提供營業(yè)稅勞務的同時提供包裝、加工等增值稅勞務的）應當征收營業(yè)稅，但是，根據(jù)財政部、國家稅務總局（94）財稅字第026號通知規(guī)定，從事運輸業(yè)務的單位和個人，發(fā)生銷售貨物并負責運輸所售貨物的混合銷售行為，征收增值稅。
其五，兼營業(yè)務。如果物流企業(yè)在提供交通運輸業(yè)勞務時，同時提供服務業(yè)勞務的，應當分別核算不同稅目的營業(yè)收入，并分別申報繳納交通運輸業(yè)營業(yè)稅和服務業(yè)營業(yè)稅。凡未按規(guī)定分別核算應稅收入的，一律從高適用稅率，按"服務業(yè)"稅目征收營業(yè)稅。如果物流企業(yè)兼營營業(yè)稅勞務和增值稅勞務，能夠分別核算營業(yè)稅收入和增值稅收入的，可分別申報繳納營業(yè)稅和增值稅；不能分別核算收入的，一律征收增值稅。
從目前企業(yè)的生產(chǎn)經(jīng)營情況來看，物流業(yè)務涉及到所有納稅人。從稅務管理系統(tǒng)提供的信息反映，目前對物流業(yè)務的處理存在的問題較多。主要的有兩個方面：
其一，對運輸業(yè)務的稅收政策把握不準確，導致大量運輸中所含的增值稅不能抵扣。
其二，技術操作不當，導致企業(yè)運輸?shù)亩愂粘杀炯哟蟆?/font>
有鑒于此，我們有必要從有關物流企業(yè)的稅收政策的具體規(guī)定的分析開始，討論如何進行納稅檢查。另外，對于聯(lián)運業(yè)務，財政部、國家稅務總局《關于營業(yè)稅若干政策問題的通知》（財稅[2003]16號）規(guī)定，經(jīng)地方稅務機關批準使用運輸企業(yè)發(fā)票，按"交通運輸業(yè)"稅目征收營業(yè)稅的單位將承擔的運輸業(yè)務分給其他運輸企業(yè)并由其統(tǒng)一收取價款的，以其取得的全部收入減去支付給其他運輸企業(yè)的運費后的余額為營業(yè)額。由于目前我國的物流企業(yè)的物流業(yè)務仍是以交通運輸業(yè)務為主，所以在這里我們以交通運輸業(yè)務的營業(yè)稅檢查作為討論的重點問題
