今天是第1818期日報。
Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:29.848]
① 選擇健康、菌群多樣性高的供體和恰當?shù)姆桨噶鞒淌羌S菌移植（FMT）成功的關(guān)鍵，但受體因素也很重要；② 受體的遺傳因素（如免疫相關(guān)基因變異）、免疫因素（腸道炎癥、分泌型IgA）、原有腸道菌群的構(gòu)成和功能、生活方式、臨床狀態(tài)和用藥情況等可決定供體菌群的植入效果；③ 優(yōu)化供體/受體的匹配度（遺傳、免疫和菌群），在移植前進行腸道準備，用免疫抑制劑減輕腸道炎癥對供體菌群的免疫壓力，以及健康的飲食干預(yù)，可能有助于改善FMT效果。
Recipient factors in faecal microbiota transplantation: one stool does not fit all
04-27, doi: 10.1038/s41575-021-00441-5
【主編評語】糞菌移植（FMT）可治愈約90%復(fù)發(fā)艱難梭菌感染，但對其他與腸道菌群改變相關(guān)的疾病，F(xiàn)MT的療效存在著比較大的變數(shù)。如何提高FMT的成功率、增加供體菌群的植入綠，是目前臨床上需要解決的問題。Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology近期發(fā)表的長篇觀點文章，重點探討了影響FMT成功率的潛在受體因素，為未來該領(lǐng)域的研究方向提出了若干建議。推薦專業(yè)人士仔細參閱。（@mildbreeze）
Microbiome[IF:11.607]
① 87名肥胖青少年隨機分為2組，接受多供體FMT膠囊（含4名同性別瘦供體糞菌）或安慰劑治療；② 在追蹤的6個月內(nèi)，F(xiàn)MT持續(xù)地改變了受體腸道菌群的結(jié)構(gòu)和功能；③ 2名供體的菌群在菌株植入上具有優(yōu)勢，提示存在超級供體現(xiàn)象，其菌群呈現(xiàn)多樣性高、普氏菌/擬桿菌比值高等特征；④ 植入的菌株引起了受體腸型的轉(zhuǎn)變，并提供了改變菌群代謝潛力的基因；⑤ 供體菌株的植入情況在不同受體間存在很大差異，提示受體因素同樣影響FMT的效果。
Strain engraftment competition and functional augmentation in a multi-donor fecal microbiota transplantation trial for obesity
05-14, doi: 10.1186/s40168-021-01060-7
【主編評語】供體選擇是影響糞菌移植（FMT）的植入和有效性的重要因素。然而，目前還未評估過在多供體移植的情況下，菌株植入的程度、變異和穩(wěn)定性。Microbiome報道了一項納入87名肥胖青少年的多供體FMT雙盲隨機對照試驗，雖然FMT干預(yù)未能有效減輕受試者的體重，但改善了代謝指標。該研究重點分析了FMT后的供體菌株植入情況，及其對受體腸道菌群組成和功能的影響，有一些有意思的發(fā)現(xiàn)。（@mildbreeze）
Gastroenterology[IF:17.373]
① 納入48例4-17歲兒童潰瘍性結(jié)腸炎（UC）患者，其中23例被排除，25例隨機分為糞菌移植（FMT）組(n=13)和安慰劑組(n=12)進行為期36周試驗；② 治療六周后，92%的FMT組和50%的安慰劑組到達臨床復(fù)合終點(兒童UC活動指數(shù)、c反應(yīng)蛋白或糞鈣保護蛋白改善)；③ FMT組的菌群多樣性呈上升趨勢；④ 給藥方式(直腸灌腸給藥)和嚴格的納入標準是導致患者招募困難的原因；⑤ 未來的試驗中應(yīng)重點關(guān)注患者招募、FMT給藥、黏膜愈合檢測、安全性等問題。
Results of the first pilot randomized controlled trial of fecal microbiota transplant in pediatric ulcerative colitis: lessons, limitations, and future prospects
05-04, doi: 10.1053/j.gastro.2021.04.067
【主編評語】Gastroenterology近期發(fā)表的文章，報道了首個兒童糞菌移植(FMT)治療潰瘍性結(jié)腸炎(UC)的隨機對照試驗，結(jié)果提示FMT可能對于兒童UC的治療具有一定的作用，但需要更多的研究進行驗證。同時提出未來的試驗中應(yīng)重點關(guān)注患者招募、FMT給藥、黏膜愈合檢測、安全性等問題。（@愛的抉擇）
Annals of the Rheumatic Diseases[IF:16.102]
① 31名活動性外周PsA患者隨機分為2組，15名接受糞菌移植治療，16名接受假手術(shù)治療；② 其中30名患者（97%）完成了26周的臨床評估，未觀察到嚴重不良事件；③ 糞菌移植組治療失敗的發(fā)生率高于假手術(shù)組（9/15，60%）vs.（3/16，19%）；④ 兩組間HAQ-DI評分變化差值為0.23分（0.07 vs 0.30），假手術(shù)組效果更好，兩組間的ACR20應(yīng)答比例沒有差異（7/15，47%）vs（8/16，50%）；⑤ 綜上，F(xiàn)MT在治療活動性外周PsA方面不如假手術(shù)組。
Safety and efficacy of faecal microbiota transplantation for active peripheral psoriatic arthritis: an exploratory randomised placebo-controlled trial
04-29, doi: 10.1136/annrheumdis-2020-219511
【主編評語】Annals of the Rheumatic Diseases上發(fā)表的一項隨機對照試驗結(jié)果，在31名活動性外周銀屑病關(guān)節(jié)炎（PsA）中，分別進行糞菌移植或假手術(shù)干預(yù)，糞菌移植的安全性良好，但治療失敗率比假手術(shù)更高，且在HAQ-DI評分、ACR20等次要指標上也劣于或不優(yōu)于假手術(shù)。（@szx）
Nature Methods[IF:30.822]
① 在宏基因組測序分析中，序列豐度（如Kraken2）和物種豐度（如MetaPhlAn2）是兩種截然不同的相對豐度類型；② 宏基因組分析工具性能測評時，物種分類軟件表現(xiàn)的好壞受到金標準豐度類型的影響，因此忽略相對豐度類型之間的區(qū)別可產(chǎn)生誤導性結(jié)論；③ 對于同一組數(shù)據(jù)，不同豐度計算方法對Alpha多樣性、Beta多樣性和排序（降維）分析的結(jié)果會產(chǎn)生極大影響，甚至出現(xiàn)相悖的生物學結(jié)論；④ 目前不同豐度之間的轉(zhuǎn)換仍存在較大困難，因此跨研究比較時選擇產(chǎn)生同類型豐度的宏基因組學物種分類工具十分關(guān)鍵。
Challenges in benchmarking metagenomic profilers
05-13, doi: 10.1038/s41592-021-01141-3
【主編評語】本文通過嚴謹?shù)恼撟C分析，量化了宏基因組學物種分類工具所產(chǎn)生的兩種相對豐度類型的差別，對于混淆兩種豐度所產(chǎn)生的影響進行了全面系統(tǒng)地研究。作者通過數(shù)據(jù)模擬，對宏基因組物種分類工具的輸出結(jié)果進行了深度解讀，提出了基于不同豐度類型的雙層評價標準，為解決微生物組研究中如何選擇宏基因組學物種分類工具的問題提供了重要依據(jù)，也對微生物組標準化研究提出了一系列建設(shè)性的意見。作者呼吁整個菌群研究界應(yīng)更多地關(guān)注由于忽視序列豐度和物種豐度之間的區(qū)別而引起的潛在誤導性生物學結(jié)論。本文第一作者是哈佛大學醫(yī)學院的孫政博士和加州大學圣地亞哥分校的黃適博士，Rob Knight教授和劉洋彧教授為本文的通訊作者。（@劉永鑫-中科院-宏基因組）
Gut[IF:19.819]
① 納入271名非糖尿病丹麥人進行分析，發(fā)現(xiàn)尿液馬尿酸水平與糞便微生物基因豐富度和多樣性呈強正相關(guān)性；② 尿液馬尿酸水平與微生物苯甲酸（馬尿酸的前體分子）生物合成途徑功能模塊正相關(guān)，且在擬桿菌2腸型者中最低；③ 在常吃富含飽和脂肪肉食的受試者中，高馬尿酸水平與代謝健康相關(guān)；④ 在高脂喂養(yǎng)的肥胖小鼠中，慢性輸注馬尿酸能改善小鼠的糖耐量、增強胰島素分泌；⑤ 馬尿酸是代謝健康的標志物和介導因子。
Human and preclinical studies of the host–gut microbiome co-metabolite hippurate as a marker and mediator of metabolic health
05-11, doi: 10.1136/gutjnl-2020-323314
【主編評語】腸道菌群產(chǎn)物參與調(diào)控宿主代謝，馬尿酸是一種菌群和宿主的共代謝產(chǎn)物，此前研究表明馬尿酸與健康的代謝表型相關(guān)。Gut近期發(fā)表的一項研究，通過人體研究揭示了尿液馬尿酸、腸道菌群、飲食和代謝健康之間的關(guān)聯(lián)，并在動物實驗中檢驗了馬尿酸與糖穩(wěn)態(tài)調(diào)節(jié)的因果關(guān)系，表明馬尿酸不僅可作為代謝健康的標志物，還在宿主代謝健康中起到重要的介導作用。（@mildbreeze）
Advanced Science[IF:15.84]
① 在卵巢切除（OVX）誘導的骨質(zhì)疏松小鼠中，移植兒童腸道菌群（CGM）可以抑制其骨量和骨強度下降，而移植老年人腸道菌群則無保護作用；② 16SrRNA基因測序顯示，CGM逆轉(zhuǎn)了OVX誘導的Akk菌的減少，直接補充Akk就足以糾正OVX引起的骨代謝失衡，防止骨質(zhì)疏松癥；③ 機制上，CGM和Akk的骨保護作用是通過分泌胞外囊泡進入并積累到骨組織中，增強成骨作用并抑制破骨細胞形成來減弱OVX誘導的骨質(zhì)疏松。
Extracellular Vesicles from Child Gut Microbiota Enter into Bone to Preserve Bone Mass and Strength
02-21, doi: 10.1002/advs.202004831
【主編評語】腸道菌群參與調(diào)節(jié)骨穩(wěn)態(tài)，但相關(guān)機制尚不明晰。中南大學湘雅醫(yī)院謝輝團隊近期在Advanced Science發(fā)表研究，揭示了兒童腸道菌群促進骨骼健康的一種新機制。（@mildbreeze）
Advances in Nutrition[IF:7.265]
① 納入13項前瞻性觀察性研究進行薈萃分析，總結(jié)飲食攝入的類胡蘿卜素水平及循環(huán)中的類胡蘿卜素濃度與2型糖尿病風險之間的關(guān)聯(lián)；② 飲食攝入的β-胡蘿卜素、總類胡蘿卜素、α-胡蘿卜素、葉黃素/玉米黃素的水平與2型糖尿病風險之間呈顯著負相關(guān)；③ 循環(huán)中的β-胡蘿卜素、總類胡蘿卜素、番茄紅素、葉黃素的濃度與2型糖尿病風險之間呈顯著負相關(guān)；④ 循環(huán)中的α-胡蘿卜素、β-胡蘿卜素、葉黃素及總類胡蘿卜素與2型糖尿病風險之間呈非線性關(guān)聯(lián)。
Dietary Intake and Circulating Concentrations of Carotenoids and Risk of Type 2 Diabetes: A Dose-Response Meta-Analysis of Prospective Observational Studies
05-12, doi: 10.1093/advances/nmab048
【主編評語】華中科技大學的潘安團隊與劉剛團隊在Advances in Nutrition上發(fā)表的一項薈萃分析結(jié)果，總結(jié)了13項前瞻性觀察性研究的數(shù)據(jù)后發(fā)現(xiàn)，飲食攝入或血液中的類胡蘿卜素水平（尤其是β-胡蘿卜素）越高，2型糖尿病的風險越低。（@szx）
Free Radical Biology and Medicine[IF:6.17]
① 納入17篇文獻（涉及21項小鼠或大鼠研究）進行薈萃分析，其中10項研究關(guān)注代謝綜合征，5項研究關(guān)注2型糖尿病，6項研究關(guān)注非酒精性脂肪性肝?。∟AFLD）；② 在對照動物中，蝦青素可顯著降低脂肪組織重量及收縮壓；③ 在2型糖尿病動物模型中，蝦青素可顯著降低血糖水平；④ 在NAFLD動物模型中，蝦青素可改善多種疾病標志物（膽固醇、甘油三酯、谷丙轉(zhuǎn)氨酶、谷草轉(zhuǎn)氨酶），并降低肝臟重量及體重。
Effects of astaxanthin in animal models of obesity-associated diseases: a systematic review and meta-analysis
05-08, doi: 10.1016/j.freeradbiomed.2021.05.008
【主編評語】蝦青素是雨生紅球藻（一種淡水綠藻）產(chǎn)生的具有抗氧化作用的化合物。Free Radical Biology and Medicine上發(fā)表的一項薈萃分析結(jié)果，總結(jié)了21項動物（小鼠或大鼠）研究的數(shù)據(jù)后發(fā)現(xiàn)，補充蝦青素可降脂、降糖、抑制氧化應(yīng)激、降低炎癥反應(yīng)，從而緩解多種肥胖相關(guān)疾病，包括：降低2型糖尿病動物模型的血糖、改善非酒精性脂肪性肝病動物模型的多項指標。（@szx）
感謝本期日報的創(chuàng)作者：fang fang，mildbreeze，Dr.Smile，菌菌君，劉永鑫-中科院-宏基因組，王新宇，szx
