今天是第1325期日?qǐng)?bào)。
Nature Communications[IF:11.878]
① 在Ca+和膽固醇幫助下，通過(guò)渦旋可快速將二油?；字岣采w到大腸桿菌Nissle 1917菌株（EcN）表面，形成自組裝脂膜包被的細(xì)菌（LCB），該方法也適用其它形態(tài)的細(xì)菌；② 正常培養(yǎng)時(shí)，LCB的生長(zhǎng)及活力與EcN無(wú)差異，但在強(qiáng)酸、強(qiáng)堿、高濃度乙醇和膽鹽、人工胃液和腸液條件下具有更高的存活率；③ LCB在小鼠腸道的保留時(shí)間和存活率顯著高于未包被的EcN；④ LCB在預(yù)防和治療鼠傷寒沙門氏菌和DSS誘導(dǎo)的小鼠結(jié)腸炎方面明顯優(yōu)于EcN。
Biointerfacial self-assembly generates lipid membrane coated bacteria for enhanced oral delivery and treatment
12-19, doi: 10.1038/s41467-019-13727-9
【主編評(píng)語(yǔ)】口服活菌改善腸道微生態(tài)的療法，受限于活菌在消化道內(nèi)的低存活率。上海交大醫(yī)學(xué)院附屬仁濟(jì)醫(yī)院、上海市腫瘤研究所劉盡堯團(tuán)隊(duì)，近期在Nature Communications報(bào)道了一種方法，可快速制備被脂膜包被的細(xì)菌，能大大增強(qiáng)細(xì)菌在消化道內(nèi)的存活和存留，并以大腸桿菌Nissle 1917菌株為例，表明這一技術(shù)可提高這種益生菌防治小鼠結(jié)腸炎的效果。（@mildbreeze）
Cell Host and Microbe[IF:15.753]
① 納入212名雙胞胎，發(fā)現(xiàn)酒精可導(dǎo)致腸道菌群失調(diào)，羅斯拜瑞氏屬豐度降低；② 腸道羅斯拜瑞氏菌（R. intestinalis）能改善小鼠酒精性脂肪肝（ALD），降低與肝臟炎癥、脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)基因的表達(dá)，死菌也有效；③ R. intestinalis鞭毛蛋白或可通過(guò)識(shí)別TLR5，上調(diào)緊密連接蛋白Occludin和粘蛋白MUC2基因，保護(hù)腸屏障，并上調(diào)IL-22和REG3γ基因；④ R. intestinalis干預(yù)ALD小鼠，可改善腸道菌群；⑤ R. intestinalis含糖苷水解酶，能恢復(fù)多糖代謝功能。
Roseburia Spp. Abundance Associates with Alcohol Consumption in Humans and Its Administration Ameliorates Alcoholic Fatty Liver in Mice
12-19, doi: 10.1016/j.chom.2019.11.001
【主編評(píng)語(yǔ)】目前認(rèn)為腸道菌與酒精肝的發(fā)生有關(guān)，但是，對(duì)究竟哪些細(xì)菌的變化會(huì)引起酒精性脂肪肝，及這些細(xì)菌的功能是什么，相關(guān)的研究都還不夠充分。Cell Host and Microbe最近發(fā)表的研究，招募了212名雙胞胎，在考慮宿主基因和其他潛在混雜因素的基礎(chǔ)上，分析了飲酒（酒精攝入）對(duì)腸道菌群的影響，結(jié)果發(fā)現(xiàn)酒精可導(dǎo)致腸道菌群失調(diào)，羅斯拜瑞氏屬豐度降低，腸桿菌科增多。用腸道羅斯拜瑞氏菌（R. intestinalis）干預(yù)酒精性脂肪肝小鼠，能改善小鼠酒精性脂肝，增強(qiáng)腸屏障。本研究結(jié)果或可用于開(kāi)發(fā)治療酒精性脂肝的微生物療法。（@nana）
Cell Host and Microbe[IF:15.753]
① 對(duì)比分析兒童、年輕人及老年人的鼻菌群組成，發(fā)現(xiàn)在人鼻菌群成熟期間，莫拉克斯氏菌屬等致病菌顯著減少，而表皮葡萄球菌顯著增加；② 在老年人中，鼻菌群的上述變化趨勢(shì)有所逆轉(zhuǎn)，表皮葡萄球菌減少而致病菌增加；③ 在體外，表皮葡萄球菌可刺激鼻上皮細(xì)胞產(chǎn)生抗菌肽（包括hBD3及LL37），以減少致病菌數(shù)量；④ 表皮葡萄球菌可形成生物膜，以保護(hù)其自身免受抗菌肽影響；
Staphylococcus epidermidis Contributes to Healthy Maturation of the Nasal Microbiome by Stimulating Antimicrobial Peptide Production
12-19, doi: 10.1016/j.chom.2019.11.003
【主編評(píng)語(yǔ)】來(lái)自上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬仁濟(jì)醫(yī)院的李敏團(tuán)隊(duì)與國(guó)外團(tuán)隊(duì)合作在Cell Host and Microbe上發(fā)表的一項(xiàng)最新研究，發(fā)現(xiàn)在鼻菌群成熟期間，表皮葡萄球菌通過(guò)刺激鼻上皮細(xì)胞產(chǎn)生抗菌肽殺傷致病菌，并通過(guò)形成生物膜抵抗抗菌肽的殺傷作用，從而促進(jìn)鼻菌群的健康成熟。（@szx）
Gut Microbes[IF:7.823]
① 豬腸道菌群在調(diào)控消化道健康、代謝穩(wěn)態(tài)以及生理、神經(jīng)和免疫功能中有重要作用；② 動(dòng)物的年齡、出生方式、品種和遺傳、飲食因素（膳食纖維、銅含量、益生菌、益生元等）、抗生素使用、應(yīng)激源（如斷奶、感染和炎癥等）以及周圍環(huán)境，都可能影響豬的腸道菌群；③ 腸道菌群可影響豬的腸道和系統(tǒng)性免疫，在菌群與宿主的互作中，腸堿性磷酸酶（IAP）和誘導(dǎo)型熱休克蛋白（iHSP）可調(diào)控抗氧化和抗炎癥反應(yīng)，對(duì)消化道上皮起保護(hù)作用。
Interactions between host and gut microbiota in domestic pigs: a review
11-24, doi: 10.1080/19490976.2019.1690363
【主編評(píng)語(yǔ)】豬不僅是重要的養(yǎng)殖動(dòng)物，也是研究菌群-宿主互作的模式生物。Gut Microbes近期發(fā)表了來(lái)自廣東海洋大學(xué)團(tuán)隊(duì)的綜述，回顧了家豬相關(guān)的腸道菌群與宿主互作的研究進(jìn)展。（@mildbreeze）
Free Radical Biology and Medicine[IF:5.657]
① 小鼠分為4組：對(duì)照、DSS誘導(dǎo)結(jié)腸炎、DSS+NaCl處理、DSS+NaNO3處理；② NaNO3可緩解DSS誘導(dǎo)的小鼠結(jié)腸炎，增加結(jié)腸長(zhǎng)度，維持體重，減少結(jié)腸上皮細(xì)胞的凋亡，減少結(jié)腸及外周血中的炎癥細(xì)胞浸潤(rùn)；③ DSS處理可導(dǎo)致小鼠腸道菌群失調(diào)，NaNO3處理可恢復(fù)乳桿菌屬等有益細(xì)菌，增加Gordonibacter等分類群；④ DSS處理可導(dǎo)致p53信號(hào)通路、結(jié)直腸癌相關(guān)通路等代謝通路的富集，NaNO3處理可降低這些通路。
Nitrate ameliorates dextran sodium sulfate-induced colitis by regulating the homeostasis of the intestinal microbiota
12-04, doi: 10.1016/j.freeradbiomed.2019.12.002
【主編評(píng)語(yǔ)】來(lái)自首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京口腔醫(yī)院的王松靈團(tuán)隊(duì)與北京大學(xué)口腔醫(yī)院的陳峰團(tuán)隊(duì)在Free Radical Biology and Medicine上發(fā)表的一項(xiàng)最新研究，發(fā)現(xiàn)在DSS誘導(dǎo)的小鼠結(jié)腸炎模型中，硝酸鹽可緩解結(jié)腸炎癥，并調(diào)節(jié)腸道菌群的組成與功能，提示硝酸鹽或可用于未來(lái)的IBD治療。（@szx）
Science of the Total Environment[IF:5.589]
① 在61名患者及73名健康人的糞便中共檢測(cè)到111個(gè)抗生素抗性基因（ARG）和7個(gè)可移動(dòng)遺傳元件（MGE）；② ARG的主要作用機(jī)制包括：導(dǎo)致抗生素失活、細(xì)胞保護(hù)及外排泵；③ 與健康人相比，患者腸道抗性組及菌群的多樣性較低，而抗生素ARG濃度較高；④ 抗生素含量與ARG的總豐度正相關(guān)，與ARG及菌群的多樣性負(fù)相關(guān)；⑤ 高豐度的cfxA基因（β內(nèi)酰胺類抗生素耐藥基因）可作為抗生素使用的生物標(biāo)記；⑥ 人腸道中的獸用抗生素可能從飲食中獲得。
Gut resistomes, microbiota and antibiotic residues in Chinese patients undergoing antibiotic administration and healthy individuals
11-21, doi: 10.1016/j.scitotenv.2019.135674
【主編評(píng)語(yǔ)】來(lái)自南開(kāi)大學(xué)的羅義和毛大慶與團(tuán)隊(duì)在Science of the Total Environment上發(fā)表的一項(xiàng)最新研究，從中國(guó)3個(gè)省份收集上百份糞便樣本，對(duì)比分析了健康人（6個(gè)月內(nèi)未接受過(guò)抗生素治療）及患者（1個(gè)月內(nèi)接受過(guò)抗生素治療）的腸道抗性組、菌群、及抗生素殘留情況，發(fā)現(xiàn)近期使用抗生素可降低腸道菌群多樣性，增加腸道中的抗生素耐藥基因水平。（@szx）
NPJ Biofilms and Microbiomes[IF:6.333]
① 日本人動(dòng)物產(chǎn)品攝入較多，腸道菌群中擬桿菌豐度更高，而印度人攝入更多的植物多糖，普雷沃氏菌和念珠菌豐度更高；② 念珠菌在體外對(duì)植物多糖阿拉基木聚糖（AX）具有強(qiáng)烈的生長(zhǎng)反應(yīng)；③ 含有AX的念珠菌生長(zhǎng)培養(yǎng)基上清液，促進(jìn)糞便普雷沃氏菌（P. copri）快速增殖，其中的阿拉伯糖是潛在的促生長(zhǎng)因子；④ 念珠菌對(duì)木糖具有生長(zhǎng)反應(yīng)，對(duì)阿拉伯糖則沒(méi)有，而P. copri對(duì)木糖和阿拉伯糖皆有生長(zhǎng)反應(yīng)；⑤ 無(wú)菌小鼠經(jīng)念珠菌定殖后，可促進(jìn)P. copri定殖。
Comparison of Japanese and Indian intestinal microbiota shows diet-dependent interaction between bacteria and fungi
12-20, doi: 10.1038/s41522-019-0110-9
【主編評(píng)語(yǔ)】腸道菌群中存在微生物的跨界互作，NPJ Biofilms and Microbiomes發(fā)表的一項(xiàng)研究報(bào)道了這樣一個(gè)具體例子。該研究通過(guò)對(duì)比不同飲食偏好的日本人和印度人的腸道菌群，結(jié)合體外和動(dòng)物實(shí)驗(yàn)，表明腸道真菌念珠菌可促進(jìn)腸道共生細(xì)菌——糞便普雷沃氏菌的定植和生長(zhǎng)，這種真菌-細(xì)菌互作中，特定膳食多糖成分可能有關(guān)鍵介導(dǎo)作用。（@mildbreeze）
Nature Microbiology[IF:14.3]
① 微生物組中心的首要任務(wù)是通過(guò)促進(jìn)合作、支持新項(xiàng)目和提供實(shí)驗(yàn)室和分析服務(wù)，加速微生物組研究，也為校園和社區(qū)服務(wù)；② 為欲從事微生物組研究的人員提供培訓(xùn)、對(duì)微生物組研究方法的需要、資金資助，促進(jìn)了微生物組中心的出現(xiàn)；③ 多個(gè)中心形成微生物組中心聯(lián)盟（MCC），利于跨學(xué)科合作、制定行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)、提供平臺(tái)等；④ 多數(shù)中心由短期內(nèi)部資金支持，依賴教職工自愿貢獻(xiàn)時(shí)間，MCC或可通過(guò)擴(kuò)大資助范圍、發(fā)展慈善和行業(yè)伙伴關(guān)系等解決此問(wèn)題。
The emergence of microbiome centres
12-19, doi: 10.1038/s41564-019-0644-x
【主編評(píng)語(yǔ)】Nature Microbiology最近發(fā)表的評(píng)論文章，從微生物組中心的任務(wù)及作用、出現(xiàn)的原因、面臨的問(wèn)題及解決方法等方面進(jìn)行了闡述，意在說(shuō)明微生物組中心的建立旨在共享戰(zhàn)略和加速知識(shí)轉(zhuǎn)移，為微生物組科學(xué)發(fā)聲。（@nana）
感謝本期日?qǐng)?bào)的創(chuàng)作者：EADGBE，王文東，szx，宋云皓，Echo Quasimodo
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