導(dǎo)讀 | 無(wú)需病毒載體,實(shí)現(xiàn)對(duì)人類T細(xì)胞高效、精準(zhǔn)的基因改造,這是科學(xué)家們最新發(fā)表在Nature雜志上的突破成果。而“魔剪”CRISPR又在其中發(fā)揮了至關(guān)重要的作用。研究人員認(rèn)為,這一成果對(duì)科研、醫(yī)學(xué)和工業(yè)領(lǐng)域具有重大意義,將大大加快下一代細(xì)胞療法的發(fā)展,為癌癥等疾病的治療帶來(lái)新希望。 |
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病毒引發(fā)感染是通過(guò)注射它們自己的遺傳物質(zhì)。自上世紀(jì)70年代以來(lái),科學(xué)家們就已經(jīng)開(kāi)始運(yùn)用病毒的這一特性:利用病毒載體運(yùn)送DNA到細(xì)胞中,用于研究、基因療法等。
然而,構(gòu)建病毒載體其實(shí)是一個(gè)非常艱苦、昂貴的過(guò)程,臨床級(jí)載體(clinical-grade vectors)的短缺還導(dǎo)致了基因療法和細(xì)胞療法的生產(chǎn)瓶頸。此外,即使是可用的,病毒載體也遠(yuǎn)不是一種理想的工具,因?yàn)樗鼈?strong>會(huì)將基因隨意插入到細(xì)胞基因組中,這將損害現(xiàn)有的健康基因或使新引入的基因不受確保細(xì)胞正常運(yùn)作的調(diào)節(jié)機(jī)制的控制。這些局限性可能會(huì)導(dǎo)致嚴(yán)重的副作用,已經(jīng)引起了人們對(duì)基因療法和細(xì)胞療法(如CAR-T)的擔(dān)憂。
圖片來(lái)源:Nature
擺脫“病毒”的新技術(shù)
7月11日,發(fā)表在Nature雜志上題為“Reprogramming human T cell function and specificity with non-viral genome targeting”的研究中,來(lái)自加州大學(xué)舊金山分校(UCSF)的科學(xué)家們開(kāi)發(fā)出了一種在不使用病毒插入DNA的前提下就能“重寫(xiě)”人類T細(xì)胞基因組的強(qiáng)大技術(shù)。
具體來(lái)說(shuō),該技術(shù)依賴于電穿孔:將一個(gè)電場(chǎng)應(yīng)用于細(xì)胞,使得細(xì)胞膜暫時(shí)具有更大的滲透性。經(jīng)過(guò)一年的探索,UCSF的Alex Marson博士帶領(lǐng)的團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),當(dāng)一定數(shù)量的T細(xì)胞、DNA和CRISPR被混合在一起,然后暴露于適當(dāng)?shù)碾妶?chǎng)后,T細(xì)胞能夠精準(zhǔn)整合特定的基因序列到基因組中被CRISPR切割的位點(diǎn)。
Alex Marson, MD, PhD, UCSF immunologist whose group has developed an approach to edit T cell genomes without using viruses, speaks with MD/PhD student Theo Roth. Credit: Noah Berger.
事實(shí)上,Marson博士實(shí)驗(yàn)室的成員先前已經(jīng)在利用電穿孔和CRISPR插入少量遺傳物質(zhì)到T細(xì)胞中取得了一定程度的成功。但大量嘗試將長(zhǎng)的DNA序列插入到T細(xì)胞中的實(shí)驗(yàn)都失敗了:導(dǎo)致了細(xì)胞死亡。這使得很多研究人員認(rèn)為,大的(長(zhǎng)的)DNA序列對(duì)T細(xì)胞毒性過(guò)大。
為了展示新技術(shù)的多功能性和實(shí)力,Marson博士等利用它修復(fù)了T細(xì)胞中的一種致病基因突變,并且創(chuàng)造出了能夠找到和殺死人類黑色素瘤細(xì)胞的“定制T細(xì)胞”。
據(jù)論文第一作者Theodore L. Roth介紹,科學(xué)家們嘗試將新基因插入T細(xì)胞已有30年之久。在他們的研究中,經(jīng)過(guò)近一年的反復(fù)試驗(yàn),Roth確定了T細(xì)胞數(shù)量、DNA數(shù)量和CRISPR豐度(CRISPR abundance)的比值,結(jié)合擁有適當(dāng)參數(shù)的電場(chǎng),實(shí)現(xiàn)了對(duì)T細(xì)胞基因組高效、準(zhǔn)確的編輯。
The research team created CRISPR guides that would cause green fluorescent protein to be expressed in only certain cellular locations and structures. Credit: Alex Marson's Lab.
“實(shí)力”驗(yàn)證
研究中,Roth首先設(shè)計(jì)CRISPR用綠色熒光蛋白(green fluorescent protein,GFP)標(biāo)記一組不同的T細(xì)胞蛋白,結(jié)果證實(shí),新技術(shù)具有高度的特異性,且脫靶效應(yīng)水平非常低:GFP只在特定的細(xì)胞位置和結(jié)構(gòu)中表達(dá)。
接著,他們開(kāi)始驗(yàn)證新技術(shù)的治療前景。在第一個(gè)實(shí)驗(yàn)中,Roth及其同事使用了由耶魯醫(yī)學(xué)院Kevan Herold提供給Marson博士實(shí)驗(yàn)室的T細(xì)胞。這些細(xì)胞來(lái)自患罕見(jiàn)、嚴(yán)重自身免疫性疾病的三個(gè)兄弟姐妹。基因組測(cè)序顯示,這些兒童的T細(xì)胞攜帶著IL2RA基因的突變。而IL2RA基因編碼的是對(duì)調(diào)節(jié)性T細(xì)胞(Tregs,可抑制其他免疫細(xì)胞,阻止自身免疫)發(fā)育至關(guān)重要的一種細(xì)胞表面受體。
利用基于CRISPR的新技術(shù),UCSF的團(tuán)隊(duì)快速修復(fù)了兒童T細(xì)胞中的IL2RA缺陷,以及因突變受損的細(xì)胞信號(hào)。研究人員希望,就像利用CAR-T療法抗癌一樣,類似的技術(shù)能夠有效治療自身免疫性疾病。
在第二個(gè)實(shí)驗(yàn)中,借助新技術(shù),科學(xué)家們用“被專門(mén)設(shè)計(jì)用于識(shí)別人類黑色素瘤細(xì)胞特殊亞型的新受體”完全取代了“正常人類T細(xì)胞中的天然T細(xì)胞受體(T cell receptors,細(xì)胞用于檢測(cè)疾病和感染的傳感器)”。在培養(yǎng)皿中,被改造過(guò)的T細(xì)胞表現(xiàn)出了特異性:不僅能夠有效地找到目標(biāo)黑色素瘤細(xì)胞,同時(shí)還會(huì)忽略其他細(xì)胞。這對(duì)于癌癥精準(zhǔn)治療是非常重要的。
研究人員強(qiáng)調(diào),在不使用病毒載體的情況下,他們能夠生產(chǎn)出大量經(jīng)CRISPR改造后表達(dá)新T細(xì)胞受體的工程細(xì)胞。而將這些CRISPR工程細(xì)胞(CRISPR-engineered cells)移植給攜帶人類黑色素瘤的小鼠后,它們能夠進(jìn)入腫瘤部位,并顯示出抗癌活性。
Set of test tubes in Alex Marson's lab. Credit: Noah Berger.
前景廣闊
Roth表示,由于新技術(shù)使得“在一周多一點(diǎn)的時(shí)間內(nèi)創(chuàng)建可用的定制T細(xì)胞系”成為了可能,因此,它已經(jīng)改變了Marson博士實(shí)驗(yàn)室的研究環(huán)境。先前一些受限于病毒載體的實(shí)驗(yàn)現(xiàn)在可以進(jìn)行了。
“這是一種能夠用于改變、增強(qiáng)以及重編程T細(xì)胞的快速、靈活的方法。與速度和易用性一樣重要的是,新技術(shù)使得‘將大量的DNA片段插入T細(xì)胞中’成為了可能,這將賦予T細(xì)胞強(qiáng)大的新特性?!盡arson博士評(píng)價(jià)道。
總結(jié)來(lái)說(shuō),研究人員希望,他們的新技術(shù)——一種基于CRISPR的快速、全能、經(jīng)濟(jì)的方法能夠在新興的細(xì)胞治療領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用,加速開(kāi)發(fā)新的、更安全的癌癥、自身免疫性疾病和其他疾?。òê币?jiàn)的遺傳性疾?。┑闹委煼椒?。
參考資料:
Decades of work have aimed to genetically reprogram T cells for therapeutic purposes1,2 using recombinant viral vectors, which do not target transgenes to specific genomic sites3,4. The need for viral vectors has slowed down research and clinical use as their manufacturing and testing is lengthy and expensive. Genome editing brought the promise of specific and efficient insertion of large transgenes into target cells using homology-directed repair5,6. Here we developed a CRISPR–Cas9 genome-targeting system that does not require viral vectors, allowing rapid and efficient insertion of large DNA sequences (greater than one kilobase) at specific sites in the genomes of primary human T cells, while preserving cell viability and function. This permits individual or multiplexed modification of endogenous genes. First, we applied this strategy to correct a pathogenic IL2RA mutation in cells from patients with monogenic autoimmune disease, and demonstrate improved signalling function. Second, we replaced the endogenous T cell receptor (TCR) locus with a new TCR that redirected T cells to a cancer antigen. The resulting TCR-engineered T cells specifically recognized tumour antigens and mounted productive anti-tumour cell responses in vitro and in vivo. Together, these studies provide preclinical evidence that non-viral genome targeting can enable rapid and flexible experimental manipulation and therapeutic engineering of primary human immune cells.
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