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預(yù)測(cè)PD1療效的“終極大殺器”:TMB檢測(cè),一文詳解

     PD-1抑制劑,包括PD-1抗體、PD-L1抗體,單獨(dú)使用的有效率是偏低的;但是一旦起效,療效相對(duì)是十分持久的,甚至部分晚期癌癥病友可以實(shí)現(xiàn)臨床治愈,長(zhǎng)期生存。為了在用藥之前就把更可能從PD-1抑制劑等免疫檢查點(diǎn)抑制劑中獲益的“幸運(yùn)患者”挑選出來。學(xué)術(shù)界已經(jīng)開發(fā)出眾多的預(yù)測(cè)標(biāo)志物,如:PD-L1表達(dá)、TMB檢測(cè)、MSI檢測(cè)、dMMR檢測(cè)、TIL檢測(cè)、甚至腸道菌群分析等。今天貝塔博士,重點(diǎn)解析一下TMB。

1. 什么是TMB檢測(cè)?

     TMB,全稱是“腫瘤基因突變負(fù)荷”,tumor mutational burden。說白了,就是看看病人腫瘤組織中到底有多少個(gè)基因突變,是一個(gè)數(shù)數(shù)的活。腫瘤組織中突變的基因越多,就越有可能產(chǎn)生更多的異常的蛋白質(zhì);這些異常的蛋白質(zhì),就越有可能被免疫系統(tǒng)識(shí)破,從而激活人體的抗癌免疫反應(yīng),因此對(duì)腫瘤免疫治療的療效就越好。


2. TMB檢測(cè)是怎么做的?

       人體的每一個(gè)細(xì)胞,大約有3萬多個(gè)基因,每個(gè)基因都有可能發(fā)生多種多樣的突變(點(diǎn)突變、缺失突變、插入突變、融合突變、重復(fù)突變等)。因此,如果要真正把全部基因到底有沒有突變,到底產(chǎn)生了多少個(gè)突變搞得一清二楚,就需要大動(dòng)干戈,把癌細(xì)胞基因組全部測(cè)一遍,這就耗時(shí)耗力耗錢了。

    目前已經(jīng)有越來越多的證據(jù),尤其是美國(guó)最大的基因檢測(cè)公司Foundation Medicine的科學(xué)家做的相關(guān)研究顯示,只要對(duì)人體3萬多個(gè)基因中的數(shù)百個(gè)有代表性的基因,做一下深入分析,相當(dāng)于抽樣調(diào)查了,就可以大致反應(yīng)總體的情況了。

       因此,目前國(guó)內(nèi)外的公司基本采用的都是各自設(shè)計(jì)出來的數(shù)百個(gè)基因的一個(gè)套裝,把這數(shù)百個(gè)基因恰好可以用來指導(dǎo)靶向藥的選擇,又可以用來作為抽樣調(diào)查的標(biāo)本,從而推算出來病人TMB的高低,每百萬個(gè)堿基所含有的突變個(gè)數(shù)來度量。一般認(rèn)為:TMB超過20個(gè)突變/Mb(Mb代表的就是每百萬個(gè)堿基),就是高;低于10個(gè)突變/Mb,就是低。當(dāng)然,不同的公司,由于所采用的基因套餐以及技術(shù)不同,略有差異。


3. TMB檢測(cè)預(yù)測(cè)PD-1療效,到底有多厲害?

貝塔醫(yī)生舉3個(gè)例子:

 (1)2017年底,最頂尖醫(yī)學(xué)雜志NEJM發(fā)表過一個(gè)有趣的數(shù)據(jù),作者把目前已經(jīng)同時(shí)公布過TMB數(shù)據(jù)以及PD-1抑制劑治療有效率的臨床試驗(yàn)結(jié)果,匯總成了一張圖。橫坐標(biāo)是每一種常見腫瘤中位的突變個(gè)數(shù),也就是TMB的大小??v坐標(biāo)是從目前已經(jīng)開展并公開發(fā)表的臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)中,匯總出來的每一種常見腫瘤接受PD-1抗體治療后的有效率。比如dMMR的腸癌、非腸癌有效率都在30%-40%;最高的是皮膚鱗癌,突破了50%,最低的是胰腺癌、生殖細(xì)胞腫瘤等,有效率低于5%。每一種腫瘤都根據(jù)它的TMB大小以及對(duì)PD-1抑制劑的有效率,在圖中畫出坐標(biāo)點(diǎn)。同時(shí)用圓圈的大小,來代表樣本量的大小。作者驚訝且興奮地發(fā)現(xiàn):目前已經(jīng)公布的各大常見腫瘤接受PD-1抑制劑治療的有效率,和TMB大小幾乎是線性關(guān)系。TMB越大,PD-1抑制劑有效率越高。從曲線的相關(guān)系數(shù),可以算出來,不同病友接受PD-1抑制劑治療之所以有效率差別那么大,有55%的差異可以被TMB高低來解釋

 

(2)2017年世界肺癌大會(huì)上,施貴寶公司公布過一項(xiàng)名為CheckMate-032的臨床試驗(yàn)結(jié)果。這是一項(xiàng)納入了401名一線治療失敗的晚期肺癌患者的II期臨床試驗(yàn),接受PD-1抑制劑單獨(dú)或聯(lián)合伊匹木治療。按照TMB高低劃分成TMB高、TMB中、TMB低三類病人,那么在接受聯(lián)合治療的人群中,三組的有效率分別為62%、20%、23%,TMB高的人群有效率高3倍;而三組的中位總生存期,分別為:22.0個(gè)月、3.6個(gè)月、3.4個(gè)月——22.0個(gè)月與3.4個(gè)月,相差6倍

 

(3)Foundation Medicine的科學(xué)家研究過1638例測(cè)過TMB的病友,其中151例接受過PD-1抑制劑治療。這151患者,按照TMB分成高、中、低三組,TMB高的人群,相比于另外兩組(TMB低或中等)的病人,有效率(58% VS 20%)、無疾病進(jìn)展生存期(12.8個(gè)月 vs 3.3個(gè)月)、總生存期(未達(dá)到 vs 16.3個(gè)月),均明顯提高,甚至倍增。

 

          此外,2018年初,施貴寶公司更是破天荒地宣布,以TMB作為篩選標(biāo)準(zhǔn)(TMB高于10個(gè)突變/Mb)的三期臨床試驗(yàn),checkmate227大獲成功。在TMB高于10個(gè)突變/Mb的晚期非小細(xì)胞肺癌中,PD-1抗體聯(lián)合伊匹木單抗,一線治療,戰(zhàn)勝了標(biāo)準(zhǔn)方案化療,如果一切順利,或許有望獲批上市。那么,那個(gè)時(shí)候TMB檢測(cè),也將正式獲得歐美藥監(jiān)局的許可,正式上市。


4. 哪些病人適合去做TMB檢測(cè)?

      廣義上講,所有病友都可以去測(cè)一下TMB。但是畢竟這個(gè)檢測(cè)還是比較貴的,有些癌種,測(cè)了以后陽(yáng)性率太低,那也不劃算。100個(gè)人去測(cè)了,才1個(gè)人高,那其余99個(gè)都花了冤枉錢,不值當(dāng)。

       Chalmers教授分析過來自167種癌癥的10萬份腫瘤組織標(biāo)本的數(shù)據(jù),結(jié)論是如下20種癌癥,TMB高的概率超過10%,非常值得去測(cè)一測(cè):皮膚基底細(xì)胞癌、皮膚鱗狀細(xì)胞癌、皮膚惡性黑色素瘤、皮膚Merkel細(xì)胞癌、原發(fā)不明的惡性黑色素瘤、頭頸惡性黑色素瘤、肺大細(xì)胞癌、原發(fā)不明的鱗狀細(xì)胞癌、肺大細(xì)胞神經(jīng)內(nèi)分泌癌、肺肉瘤樣癌、胃腺癌(腸型)、子宮內(nèi)膜癌(內(nèi)膜型)、彌漫大B細(xì)胞淋巴瘤、非小細(xì)胞肺癌、子宮內(nèi)膜癌、膀胱癌、原發(fā)不明的尿路上皮癌、軟組織血管肉瘤、肺腺癌、肺腺鱗癌、皮膚附件癌、膀胱移行細(xì)胞癌、B細(xì)胞淋巴結(jié)淋巴瘤、肺鱗癌、原發(fā)不明腫瘤、頭頸部鱗癌


5. TMB高低與PD-L1表達(dá)、MSI穩(wěn)定性有什么聯(lián)系?

       目前的研究提示:TMB高低和PD-L1表達(dá)沒啥關(guān)系。PD-L1低的,不要灰心可以再測(cè)一下TMB;TMB低的,不要灰心,可以再測(cè)一下PD-L1;這兩個(gè)檢測(cè)只要有一個(gè)有好消息,貝塔博士覺得,都是可以酌情考慮接受PD-1抑制劑治療的(當(dāng)然,具體病情,具體分析)。

       MSI和TMB的關(guān)系是這樣的:MSI可以理解為TMB的一種子集、一個(gè)特例。幾乎所有MSI高度不穩(wěn)定的病人,TMB都是高的;但是反過來,TMB高的病人,并不一定都是MSI不穩(wěn)定的,還有相當(dāng)一部分病人是MSI穩(wěn)定型的。10萬例病例研究顯示:MSI高度不穩(wěn)定的病友中,97%的病友TMB不小于10個(gè)突變/Mb,83%的病友不小于20個(gè)突變/Mb,也就是說如果某病友MSI高度不穩(wěn)定,那么就夠了,不用再去測(cè)TMB,因?yàn)?7%都是高的。但是,反過來,只有16%的TMB高的病友,MSI是高度不穩(wěn)定的——因此,對(duì)于不少癌種,如果單獨(dú)只測(cè)MSI,很可能結(jié)果是陰性的;但是,這些病友其實(shí)TMB是高的,是可以用PD-1抑制劑的,如果不測(cè)TMB,這部分病友就漏掉了寶貴的機(jī)會(huì)。

 

6. TMB檢測(cè)去哪做,要花多少錢?

        目前,國(guó)內(nèi)外的TMB檢測(cè),以Foundation Medicine公司最權(quán)威,但實(shí)在是非常貴。國(guó)內(nèi)幾大最權(quán)威的基因檢測(cè)公司,均可提供TMB檢測(cè)服務(wù),病友只要準(zhǔn)備好病理組織白片(3-5張)或者抽外周血即可,報(bào)價(jià)在1.5-2萬元左右,7-10個(gè)工作日出報(bào)告。如有疑問,可以咨詢貝塔博士(微信號(hào):Doctor_Beta)。


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