口腔中友好的厭氧菌，開(kāi)啟了消化食物的第一步；雖然胃中是強(qiáng)酸環(huán)境，但仍然有細(xì)菌存活，它們會(huì)對(duì)胃酸的分泌產(chǎn)生一定影響；腸道中的細(xì)菌能夠合成多種營(yíng)養(yǎng)素，譬如維生素K，這是人體自身細(xì)胞所合成不了的。
腸道中的食物殘?jiān)鼤?huì)通過(guò)結(jié)腸最終到達(dá)直腸，我們自身無(wú)法消化和吸收這些食物殘?jiān)?。但是，結(jié)腸里生活著的細(xì)菌卻能將它們進(jìn)一步消化，比如，果蔬里的纖維素不能被小腸直接消化，卻能被結(jié)腸里的細(xì)菌們利用，這些細(xì)菌會(huì)代謝分泌出一些叫“短鏈脂肪酸”的物質(zhì)，它們可以被我們的腸道吸收。結(jié)腸中細(xì)菌為我們提供的能量，可以占到食物總能量的15%，這對(duì)早期人類(lèi)的生存至關(guān)重要。
微生物和免疫系統(tǒng)的相互作用，從我們出生的那一刻就開(kāi)始了，并且會(huì)貫穿我們的一生。一個(gè)三歲幼童體內(nèi)的微生物已經(jīng)和成人非常相似了，它們可以幫助我們抵御外來(lái)微生物的侵?jǐn)_。
友好的微生物在我們身體里安居樂(lè)業(yè)，所以它們不希望外來(lái)者的干擾。如果有入侵者試圖在腸道里分一杯羹，腸道中的細(xì)菌當(dāng)然不愿妥協(xié)，它們會(huì)分泌一些物質(zhì)殺死入侵者，從而保護(hù)我們的腸道健康。這樣的例子還有很多，再比如，育齡女性的陰道中存在著乳酸桿菌，它們能夠分泌出大量的乳酸，從而降低了陰道內(nèi)的pH值，使其不適合真菌等病原體的生存。即使有時(shí)入侵者能僥幸搶到一小塊立足之地，但過(guò)不了多久，也會(huì)被我們體內(nèi)的微生物排擠和驅(qū)逐，并最終消失。因此，人體內(nèi)的微生物群落保持得相當(dāng)穩(wěn)定，一生中都很少發(fā)生改變。
關(guān)于人體共生微生物，是最近十來(lái)年才被科學(xué)家重視起來(lái)的，認(rèn)識(shí)還非常有限。已經(jīng)達(dá)成的共識(shí)是：微生物非常地、極端地重要，是認(rèn)識(shí)人體的新維度。破解了微生物與人的關(guān)系，可以極大地推進(jìn)醫(yī)學(xué)乃至心理學(xué)等學(xué)科的發(fā)展。
當(dāng)你認(rèn)識(shí)到自己不是一個(gè)人而是一大堆生命時(shí)，你的思維與行為會(huì)發(fā)生這么一些變化：
1、不要挑食，吃的東西要均衡而全面。因?yàn)?，你不是一個(gè)人在吃，你也要考慮到體內(nèi)的細(xì)菌?。√羰车娜?，體內(nèi)菌群就不怎么健康，所以身體肯定不太好。嬰兒最好能吃一年左右的母乳，一個(gè)重要原因是，母乳中含有細(xì)菌愛(ài)吃的物質(zhì)，可以幫助嬰兒盡快建立完善的微生物群落。
2、慎用抗生素。這個(gè)大家都知道了，抗生素除了會(huì)造成超級(jí)細(xì)菌，還會(huì)傷害人體內(nèi)正常的微生物群落。當(dāng)共生菌群被破壞了，人的各個(gè)方面都受會(huì)影響，且難以重建。
3、盡量自然分娩，慎用剖宮產(chǎn)。子宮里是無(wú)菌的，當(dāng)嬰兒自然出生，他會(huì)接觸到母親的產(chǎn)道，從而獲得有益的菌群。如果是剖宮產(chǎn)，嬰兒獲得的菌群就不一樣，身體沒(méi)有自然分娩的好。目前，科學(xué)家正在加緊研究這個(gè)問(wèn)題，相信會(huì)有更多的結(jié)論出來(lái)。
4、傳統(tǒng)中藥，湯湯水水的，目標(biāo)靶點(diǎn)根本不清楚，作用機(jī)制也不明白。所以，很多科學(xué)潔癖者反對(duì)中醫(yī)，認(rèn)為它不科學(xué)，沒(méi)有用。但是，任何人不可否認(rèn)的是，中醫(yī)經(jīng)常能治療一些疑雜難癥。現(xiàn)在，一個(gè)解釋是，中藥湯劑可能對(duì)人體內(nèi)的微生物有好處或有壞處，然后由微生物調(diào)節(jié)了人體。
5、如果你遇到了一些難以理解的事情，不妨從微生物菌群的差異來(lái)解釋。比如，一個(gè)人在一起吃飯，飯量差不多，但是有的胖有的瘦，這就可能與他們的腸道內(nèi)的菌群有關(guān)，因?yàn)樗鼈儧Q定了食物吸收。現(xiàn)在有一種新療法，腸糞移植，挺有趣的。
在很多人的感知中，人類(lèi)相關(guān)微生物群（Human Assiociated Microbiota）可能還只是一個(gè)新生的研究領(lǐng)域。但實(shí)際上，人類(lèi)對(duì)這一生物類(lèi)群的描述可以追溯到 1670 年代至 1680 年代。當(dāng)時(shí)，安東尼·范·列文虎克研發(fā)了一種新的手工顯微鏡，并正興致盎然地觀(guān)察一個(gè)前所未見(jiàn)的微觀(guān)生物世界。到如今，我們對(duì)人類(lèi)相關(guān)微生物群的研究已經(jīng)取得了長(zhǎng)足的進(jìn)步。那么在此過(guò)程中，是哪些關(guān)鍵進(jìn)展推動(dòng)了我們從觀(guān)察單個(gè)細(xì)胞轉(zhuǎn)向?qū)?fù)雜微生物群落的研究呢？就讓我們跟隨《Nature 里程碑》系列 ，探索一番該領(lǐng)域的基礎(chǔ)性突破和進(jìn)展吧。
1944：體外培養(yǎng)厭氧菌
1958：糞便微生物群移植治療感染
1965：腸道微生物移植模型
1972：微生物群影響宿主藥物代謝
1981：嬰兒共生微生物的演替
1996：基于序列鑒定菌群
1998：菌群的穩(wěn)定性與獨(dú)特性
2003：細(xì)菌之外的共生微生物
2004：微生物群對(duì)粘膜免疫的調(diào)節(jié)
2005：養(yǎng)好腸道菌群的重要性
2006：腸道菌群移植的治療潛力
2006：飲食通過(guò)腸道菌群影響健康
2007：定植抵抗的機(jī)制
2007：腸道菌群進(jìn)入組學(xué)時(shí)代
2008：抗生素破壞腸道菌群
2010：微生物測(cè)序數(shù)據(jù)分析工具
2011：群體規(guī)模的菌群分析
2012：微生物組-腸-腦軸
2012：新培養(yǎng)方式擴(kuò)大可培養(yǎng)菌群
2012：全球的人類(lèi)微生物組
2013：微生物短鏈脂肪酸誘導(dǎo)Treg
2014：人類(lèi)微生物群產(chǎn)生的抗生素
2015：宿主靶向藥物影響微生物群
2018：人類(lèi)微生物群影響癌癥治療
2019：宏基因組組裝發(fā)現(xiàn)新特征
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