這里講一下如何查找質(zhì)粒圖譜。
最好的圖譜就是NCBI和公司里提供的了,
第一步去NCBI查找,一般常用質(zhì)粒都有了。然后以.db格式下載,再用Invitrogen的VectorNTI打開,就能得到一張很好的質(zhì)粒圖。
如果找不到,就去google,(baidu上比較不準),最好加個pdf,找到公司的質(zhì)粒介紹,那種圖也不錯。
如果還是找不到,就在google,baidu上查質(zhì)粒的序列,把序列輸入Invitrogen的VectorNTI,能夠得到類似酶切的圖譜,湊合著用吧,如果有序列信息,再自己添加也一樣。
我就是這么查的,相信大家用的多數(shù)都是常用序列,查起來應該不難。
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網(wǎng)站名:www.addgene.org
簡介:搜集整理各生物公司和實驗室所構(gòu)建質(zhì)粒之圖譜,以序列和圖像的方式供研究者參考。質(zhì)粒的長度,骨架來源,多克隆位點,啟動子,插入片斷等資料皆明晰可見;protocols、參考文獻和諸多在線小工具配合質(zhì)粒圖譜構(gòu)成基因克隆一攬子解決方案;還可以在線提供自己構(gòu)建的質(zhì)粒圖譜,資源共享……關(guān)鍵中的關(guān)鍵,是速度快,和螺旋網(wǎng)不相伯仲 啰嗦幾句:Plasmid Tools 中的Vectorpedia可以查詢構(gòu)建的空載體,也可以通過主頁中的搜索尋找構(gòu)建好的克隆。留意主頁上的那些News,說不定就有你想要的(啰嗦的時候偶就看到了攜帶最近很火的干細胞誘導因子質(zhì)粒的消息,哇咔咔)。其它功能大家各取所需,希望能對諸位的工作有所幫助~~ ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ 方法一:如何查找質(zhì)粒圖譜。 最好的圖譜就是NCBI和公司里提供的了, 第一步去NCBI查找,一般常用質(zhì)粒都有了。然后以.db格式下載,再用Invitrogen的VectorNTI打開,就能得到一張很好的質(zhì)粒圖。 如果找不到,就去google,(baidu上比較不準),最好加個pdf,找到公司的質(zhì)粒介紹,那種圖也不錯。 如果還是找不到,就在google,baidu上查質(zhì)粒的序列,把序列輸入Invitrogen的VectorNTI,能夠得到類似酶切的圖譜,湊合著用吧,如果有序列信息,再自己添加也一樣。 我就是這么查的,相信大家用的多數(shù)都是常用序列,查起來應該不難 方法二: 2. google 3.google scholar: http://scholar.google.com/ 4.嘗試從各大生物公司,例如invitrogen網(wǎng)站查詢. 5. 這個網(wǎng)站收錄了大量圖譜: |
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1.Vectorpedia: 輸入質(zhì)粒骨架,直接查詢,非常方便;
http://www.addgene.org/pgvec1?f=v&cmd=listvecinfo
2. google
檢索式子:質(zhì)粒名 + map
質(zhì)粒名 +sequence +filetype:txt or filetype:pdf
或者:進入google,點擊"圖片搜索",直接查找圖譜。
3.google scholar: http://scholar.google.com/
有些質(zhì)粒是經(jīng)過改造的,所以通過上述方法不能查詢到相應信息。這時,可以在google scholar中輸入質(zhì)粒名稱,可以直觀地看哪些學者在何文章中使用了該質(zhì)粒,從而可了解到質(zhì)粒的來源;或者籍此向作者咨詢或索取。
4.嘗試從各大生物公司,例如invitrogen網(wǎng)站查詢。
5. 這個網(wǎng)站收錄了大量圖譜:
http://www.embl-hamburg.de/~geerlof/webPP/vectordb/bact_vectors/table.html