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“年輕”的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù),在揪出癌癥的背后“兇手”
周佳萍2021-02-02 11:45

世界上沒有兩片相同的葉子,同樣,也沒有完全相同的細(xì)胞。

受精卵在發(fā)育過程中,基因表達(dá)的差異會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞與細(xì)胞之間呈現(xiàn)差異化,最終分化成各種組織和器官,有些分化成神經(jīng)元,有些成為骨骼肌,它們分別承擔(dān)著不同的生理功能。腫瘤微環(huán)境中也存在著類似的異質(zhì)性,并在近年來成為研究熱點(diǎn)。由于單細(xì)胞測(cè)序能夠檢出傳統(tǒng)bulk測(cè)序所無法得到的異質(zhì)性信息,這將生命科學(xué)帶入到一個(gè)新次元當(dāng)中。

全球單細(xì)胞測(cè)序是從2009年開始起步,國內(nèi)的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)也是在2014年才逐漸開始應(yīng)用。誕生于2018年的百奧智匯是一家專注于單細(xì)胞測(cè)序應(yīng)用的生物技術(shù)企業(yè),致力于將單細(xì)胞組學(xué)和生物信息學(xué)最大化地應(yīng)用于人類疾病診斷和治療,通過創(chuàng)建人類疾病的精準(zhǔn)細(xì)胞圖譜,充分利用自身強(qiáng)大的科研能力、自有平臺(tái)和數(shù)據(jù),尋找全新的具突破性的治療和診斷方法。

本文文章插圖來源于百奧智匯,經(jīng)授權(quán)使用

傳統(tǒng)的研究方法,大多是在多細(xì)胞水平中進(jìn)行的,然而多細(xì)胞水平得到的是平均信號(hào)值,異質(zhì)性信息被技術(shù)平臺(tái)的缺陷掩蓋,使得結(jié)果的準(zhǔn)確性受到了影響。而單細(xì)胞測(cè)序則解決了分辨精度不足的問題,不僅能使科學(xué)家們以更高的精確度研究基本生物學(xué)和醫(yī)學(xué)問題,還能同時(shí)分析成千上萬個(gè)細(xì)胞。

例如在腫瘤組織中,腫塊中心、腫塊周圍以及淋巴轉(zhuǎn)移灶等細(xì)胞在基因組和轉(zhuǎn)錄組等遺傳信息上均具有差異,通過單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的高分辨率,可以決定哪種細(xì)胞類型是對(duì)腫瘤最為有效的潛在靶點(diǎn),為藥物發(fā)現(xiàn)和研發(fā)提供強(qiáng)大的高質(zhì)量數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。

在應(yīng)用上,多樣單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)可以滿足多層次研究的需要。目前,百奧智匯已開發(fā)出了單細(xì)胞RNA大數(shù)據(jù)可視化平臺(tái)OmniBrowser,該平臺(tái)擁有豐富的單細(xì)胞數(shù)據(jù)資源和多種搜索、可視化、分析工具,為藥靶發(fā)現(xiàn)、藥物研發(fā)、科研探索等賦能。

本文文章插圖來源于百奧智匯,經(jīng)授權(quán)使用

據(jù)了解,目前該平臺(tái)已收錄涵蓋超680項(xiàng)研究的數(shù)據(jù)集共計(jì)1490余個(gè),超過18000個(gè)細(xì)胞群和2100萬個(gè)細(xì)胞的基因組及其他研究數(shù)據(jù)。百奧智匯的數(shù)據(jù)團(tuán)隊(duì)會(huì)頻繁定期地查詢PubMed以更新數(shù)據(jù)庫,找出與癌癥、免疫學(xué)、神經(jīng)科學(xué)和發(fā)育生物等有關(guān)的單細(xì)胞組學(xué)研究,并對(duì)其中影響力較大、用戶需求的期刊給予更高的錄入優(yōu)先級(jí)。

另外,百奧智匯數(shù)據(jù)化平臺(tái)的搭建是對(duì)行業(yè)數(shù)據(jù)利用率的極大提升。盡管大部分?jǐn)?shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)來源都是公開發(fā)表的,但研究者們想要將自己感興趣的領(lǐng)域的大量數(shù)據(jù)下載下來進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析與數(shù)據(jù)比較,除了有能力去下載外,還需要整理,加注,格式化等多方面的數(shù)據(jù)處理,需要花費(fèi)很多的時(shí)間和精力,還可能有所遺漏。百奧智匯通過標(biāo)準(zhǔn)化的萃取和整理,將數(shù)據(jù)系統(tǒng)化集成執(zhí)行軟件,能夠讓使用者更加高效便捷地獲得準(zhǔn)確的完整數(shù)據(jù)信息,從而大大節(jié)省時(shí)間成本,提高其科研和研發(fā)效率。另一方面,該平臺(tái)還集成了多種可視化和分析工具,能夠以圖形界面展示和操作,大大降低了使用者的生物信息學(xué)門檻,讓他們能夠把更多的精力放在自己對(duì)科研問題的研究和發(fā)現(xiàn)。

此外,百奧智匯圍繞單細(xì)胞組學(xué)建立起了單細(xì)胞基因組、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和單細(xì)胞染色質(zhì)可及性測(cè)序方案和實(shí)驗(yàn)平臺(tái),從而滿足生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究者的研究需要。2019年10月,百奧智匯創(chuàng)始人兼科學(xué)顧問張澤民教授聯(lián)合使用SMART-seq2和10x Genomics單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)刻畫肝癌免疫圖譜,相關(guān)文章發(fā)表在國際頂級(jí)期刊《自然》上。

“百奧智匯在科學(xué)和技術(shù)方面的實(shí)力和底蘊(yùn),是公司發(fā)展的基礎(chǔ),特別是在數(shù)據(jù)方面,這得益于創(chuàng)始團(tuán)隊(duì)的多年雄厚積累?!盋EO王泱洲博士說道。

百奧知匯的創(chuàng)始人張澤民博士現(xiàn)任北京大學(xué)教授,擁有16年的Genentech工作經(jīng)驗(yàn),曾任生物信息部主任和首席科學(xué)家,擁有60項(xiàng)專利,其中7項(xiàng)靶向藥物進(jìn)入了臨床試驗(yàn)階段,是國際知名的腫瘤基因組科學(xué)家。

而作為CEO,王泱洲博士也擁有著20多年的生物技術(shù)、制藥和生命科學(xué)行業(yè)的管理和運(yùn)營經(jīng)驗(yàn),曾任中美冠科生物技術(shù)股份有限公司首席運(yùn)營官及董事。據(jù)悉,王泱洲博士加入百奧智匯后不久,公司就迅速擴(kuò)展到目前的數(shù)十人,擁有了完整的業(yè)務(wù)團(tuán)隊(duì),公司的科研結(jié)果也逐漸轉(zhuǎn)變?yōu)闃?biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)分析流程,為進(jìn)一步的藥物研發(fā)和轉(zhuǎn)化應(yīng)用打下了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。

在商業(yè)化方面,除了通過數(shù)據(jù)化平臺(tái)為藥企等提供單細(xì)胞組學(xué)數(shù)據(jù)處理服務(wù)外,百奧智匯長(zhǎng)期來還與藥廠合作進(jìn)行藥物研發(fā)。王泱洲博士透露,百奧智匯在繼續(xù)與國內(nèi)外知名藥廠合作的同時(shí),還將自主研發(fā)候選藥物和靶點(diǎn)增量,且已有藥物靶點(diǎn)進(jìn)入初步驗(yàn)證階段。

王泱洲博士認(rèn)為,從藥物研發(fā)而言,中國市場(chǎng)對(duì)新藥研發(fā)和靶點(diǎn)需求度更高,因此在國內(nèi)新藥市場(chǎng)上,百奧智匯面臨較多機(jī)遇;而從商業(yè)角度來看,國外企業(yè)對(duì)臨床性靶點(diǎn)的接納程度大于國內(nèi)傳統(tǒng)生物醫(yī)藥企業(yè),因此在國外市場(chǎng)來看,商業(yè)化程度將會(huì)更高。據(jù)了解,百奧智匯目前已在中美設(shè)立了雙運(yùn)營中心,將不斷拓展國內(nèi)外市場(chǎng)。

目前,百奧智匯已完成了A+輪融資,由軟銀中國資本領(lǐng)投,IDG資本、杏澤資本跟投。王泱洲博士介紹,本輪融資將主要用于系統(tǒng)性的擴(kuò)大和加速單細(xì)胞大數(shù)據(jù)及單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析在藥物研發(fā)方面的應(yīng)用,并進(jìn)一步擴(kuò)大商業(yè)化布局,加速建立系統(tǒng)和高效的國際化運(yùn)營體系。

本文文章頭圖來源于百奧智匯,經(jīng)授權(quán)使用。本文為創(chuàng)業(yè)邦原創(chuàng),如需轉(zhuǎn)載或有任何疑問,請(qǐng)聯(lián)系editor@cyzone.cn。

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