今天是第1122期日報。
Nature Medicine[IF:32.621]
① 目前菌群相關新聞報道存在的缺陷包括缺乏及時性、專業(yè)性，研究者夸大其詞，評論文章解讀不到位等；② 許多臨床試驗的結果在報道中失實，而臨床前期研究、動物模型研究結果卻被夸大；③ 報道菌群相關研究時，需要明確指出研究的局限性，鼓勵領域專家進行及時監(jiān)督，并明確區(qū)分動物研究成果與臨床進展；④ 有必要成立專業(yè)機構對菌群研究和新聞報道進行督導；⑤ 研究生和博士后群體有望成為追蹤菌群領域最新研究的主力軍。
Responsible stewardship for communicating microbiome research to the press and public
05-27, doi: 10.1038/s41591-019-0470-y
【主編評語】將菌群領域的研究成果準確傳達給大眾，需要學術期刊編輯、領域專家、監(jiān)管機構和新聞媒體共同參與。《Nature Medicine》近期發(fā)表評論文章，總結了目前在宣傳微生態(tài)研究成果方面存在的弊端，強調正確宣傳科研成果需要領域專家、監(jiān)管機構以及青年研究人員共同參與。（@小腸君）
Nature Medicine[IF:32.621]
① 菌群干預療法可申請成為膳食補充劑或醫(yī)療療法，但申請難度差異顯著，分別由FDA的不同部門監(jiān)管；② 菌群干預有傳播病原體的風險，對菌群供體的病原篩查難度高，實驗室純化得到的菌株又難保其治療效果；③ 菌群干預的療效可能在數年后才顯現，菌群供體存在的疾病風險可能轉嫁給受體，但都缺乏預測機制；④ 臨床試驗機構的監(jiān)管部門應當把控菌群干預臨床試驗的科學性和安全性；⑤ 實施菌群干預措施需要謹慎，需將相應風險明確告知患者和公眾。
Regulating microbiome manipulation
05-27, doi: 10.1038/s41591-019-0451-1
【主編評語】在調節(jié)菌群改善健康的臨床實驗大量開展前，需要優(yōu)先考慮監(jiān)管的必要性?！禢ature Medicine》近期發(fā)表評論文章，總結了目前美國對于益生菌、菌群移植等菌群干預手段的監(jiān)管方法，列舉了菌群干預手段存在的潛在風險和隱患，并提出了一系列對研究、運用菌群干預進行監(jiān)管的建議，對于干預療法研究者、產品研發(fā)團體、臨床試驗機構、監(jiān)管部門均有參考價值。（@小腸君）
Cell Host and Microbe[IF:17.872]
① 給限菌小鼠定植組成明確的人腸道共生細菌群落，之后引入靶向其中特定細菌的裂解性噬菌體；② 噬菌體直接減少了其靶細菌的數量，并可與靶細菌長期共存，使抗噬菌體的靶細菌富集；③ 噬菌體對靶細菌的影響，通過細菌間互作，可波及到菌群中的其它非靶細菌成員，從而對菌群造成廣泛影響；④ 噬菌體對腸道菌群的影響可直接改變腸道代謝組譜，包括神經遞質代謝物等可影響宿主生理的代謝產物。
Dynamic Modulation of the Gut Microbiota and Metabolome by Bacteriophages in a Mouse Model
06-04, doi: 10.1016/j.chom.2019.05.001
【主編評語】噬菌體如何在體內影響菌群？《Cell Host and Microbe》發(fā)表的一項最新研究，使用限菌小鼠模型，揭示出噬菌體對其靶細菌的直接影響，可對菌群造成級聯效應，波及其它菌群成員，導致腸道代謝組改變，從而可對宿主產生影響，這些發(fā)現對于研究靶向腸道菌群的噬菌體療法，很有參考意義。（@李丹宜）
Cell Host and Microbe[IF:17.872]
① 非結構蛋白NS1是由感染鼠類的諾如病毒MNoV分泌的非常規(guī)蛋白，形成過程涉及由Casp3酶介導的NS1/2蛋白切割，分泌后形成可溶性單體蛋白；② 人類諾如病毒中也存在NS1蛋白；③ MNoV在感染過程中，會對腸道中的干擾素IFN-γ免疫應答產生廣泛的抑制作用；④ 在腸道上皮成簇細胞中，IFN-γ介導了對MNoV的免疫效應，而NS1的IFN-l的干擾效應對于MNoV成功感染至關重要；⑤ 接種NS1可幫助小鼠獲得抗MNoV感染能力，但NS1并不結合宿主的抗衣殼蛋白抗體。
A Secreted Viral Nonstructural Protein Determines Intestinal Norovirus Pathogenesis
05-21, doi: 10.1016/j.chom.2019.04.005
【主編評語】諾如病毒感染腸道上皮簇狀細胞，導致小鼠產生癥狀?！禖ell Host and Microbe》近期發(fā)表研究，發(fā)現鼠類諾如病毒分泌的NS1蛋白可抑制腸上皮成簇細胞中IFN-γ介導的免疫應答，促進病毒感染，而且NS1蛋白在小鼠中表現出良好的免疫原性。該結果對于了解諾如病毒感染機制，以及開發(fā)相應疫苗具有參考價值。（@小腸君）
Microbiome[IF:9.133]
① 從噬菌體中新發(fā)現的92個產生多樣性的逆轉錄因子（DGR）基因盒，噬菌體宿主主要分布于擬桿菌門、變形菌門和厚壁菌門；② 其中5個噬菌體含有高突變蛋白，與博爾德氏桿菌噬菌體BPP-1尾部蛋白相似，其他DGR的功能未知；③ 以Bacteroides dorei為宿主的噬菌體Hankyphage，可在13種不同擬桿菌中實現溶原化，34%的菌群宏基因組和21%的人類病毒組數據中均包含該噬菌體；④ 由溫和噬菌體導致的高突變，可能是介導噬菌體-細菌互作的普遍機制。
A diversity-generating retroelement encoded by a globally ubiquitous Bacteroides phage
2018-10-23, doi: 10.1186/s40168-018-0573-6
【主編評語】產生多樣性的逆轉錄因子（DGR）是一種基因盒，可選擇性突變噬菌體基因組，產生高突變蛋白?！禡icrobiome》近期發(fā)表研究，報道了新發(fā)現的92個DGR，發(fā)現其中一種含有DGR的擬桿菌噬菌體廣泛分布于共生菌群中，指出DGR的基因突變功能很可能介導了菌群中噬菌體-細菌互作，對于研究病毒組、病毒-細菌互作具有參考價值。（@小腸君）
Environmental Science & Technology Letters[IF:5.869]
① 新開發(fā)的病毒監(jiān)測方法ICC-MS結合了細胞培養(yǎng)-質譜分析，可通過鑒別細胞中的病毒復制蛋白來識別病毒；② 測試階段ICC-MS可有效檢測培養(yǎng)液、污水中的鼠肝炎病毒；③ 使用Vero、BGMK和BSC-1作為細胞系時，ICC-MS可以檢測到污水樣品中的人類呼腸孤病毒；④ 在一級進水、二級出水、和紫外消毒出水樣品中，可檢測到呼腸孤病毒1型、2型和3型特異性蛋白；⑤ ICC-MS方法不需要設計病毒特異性引物，有望作為監(jiān)測環(huán)境樣品中人類病毒的新方法。
Integrated Cell Culture-Mass Spectrometry Method for Infectious Human Virus Monitoring
05-06, doi: 10.1021/acs.estlett.9b00226
【主編評語】監(jiān)測環(huán)境中的病毒對于預防感染具有重要意義。《Environmental Science & Technology Letters》近期發(fā)表研究，介紹了一種監(jiān)測環(huán)境病毒的新方法，通過細胞培養(yǎng)和質譜分析特異性蛋白，可以不依賴特異性引物來來檢測污水中的人源病毒。該方法對于病毒監(jiān)測和感染預防具有參考價值。（@小腸君）
American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine[IF:15.239]
① 母乳喂養(yǎng)提供抗體、免疫細胞和微生物所需寡糖，并有助于防止嬰幼兒呼吸道感染（RTI）；② 陰道分娩出生的嬰兒可更快獲得棒狀桿菌等菌屬，減少呼吸道病原菌定殖；③ 嬰兒鼻咽部微生態(tài)平衡是預防RTI的關鍵，感染前鼻咽菌群中奈瑟氏球菌等口腔菌種豐度上升增加了RTI易感性；④ 鼻咽部和口腔的菌群差異性丟失在進入幼托后進一步加重，使兒童更易發(fā)生RTI；⑤ 鼻咽和口腔間的菌群差異喪失可能是任何年齡患者RTI易感的共同原因。
Loss of Microbial Topography Precedes Infection in Infants
04-12, doi: 10.1164/rccm.201903-0687ED
【主編評語】《American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine》發(fā)表的一篇評論文章，簡單闡述了嬰幼兒呼吸道感染的母體和菌群因素，并圍繞Man等人的研究（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1065415317）展開討論，提出鼻咽和口腔間的菌群差異或影響呼吸道感染易感性。（@李丹宜）
Journal of Experimental Medicine[IF:10.79]
① β-淀粉樣蛋白（Aβ）模型小鼠出生后短期用抗生素灌胃（ABX），雌雄小鼠腸道菌群變化相似；② 長期ABX使小鼠的炎癥因子和腸道菌群發(fā)生性別特異性改變，雄性小鼠腦內Aβ沉積減少；③ 伴隨雄性小鼠大腦內的小膠質細胞轉錄組改變，由神經退行性表型恢復為穩(wěn)態(tài)功能表型；④ 移植無ABX的小鼠糞菌可減少ABX引起的雄性小鼠盲腸擴大，恢復菌群結構、Aβ病理沉積和小膠質細胞形態(tài)；⑤ 腸道菌群在調節(jié)Aβ淀粉樣變性和小膠質細胞生理中發(fā)揮因果性作用。
Sex-specific effects of microbiome perturbations on cerebral Aβ amyloidosis and microglia phenotypes
05-16, doi: 10.1084/jem.20182386
【主編評語】阿爾茨海默癥的主要特點是大腦內的β-淀粉樣蛋白（Aβ）沉積，《Journal of Experimental Medicine》發(fā)表的一項研究，在Aβ小鼠疾病模型中通過抗生素處理和糞菌移植試驗證明，腸道菌群對Aβ病理和小膠質細胞表型有因果性影響，且這種影響具有性別特異性，為腸道菌群參與阿爾茨海默癥病理添加了新證據。（@李丹宜）
感謝本期日報的創(chuàng)作者：小腸君，Echo-gdm，李丹宜，方芳
