真核生物域
真菌界
擔(dān)子菌門
傘菌亞門
傘菌綱
傘菌亞綱
傘菌目
小菇科
小菇科（學(xué)名：Mycenaceae）是傘菌目下的一個科，最早于1926年由荷蘭真菌學(xué)家卡斯帕爾·凡·歐沃瑞姆（英語：Casper van Overeem）設(shè)立。2008年出版的真菌辭典（Dictionary of the Fungi）第十版中，列出了本科下分十個屬，共705個物種，本科也是經(jīng)由序列分析后，從口蘑科拆分出來的科之一。本科物種多行腐生生長，廣泛分布于全球各種生態(tài)系中。本科之下有一屬Protomycena（英語：Protomycena）在一枚伊斯帕尼奧拉島的多米尼加琥珀（英語：Dominican amber）中被發(fā)現(xiàn)，出現(xiàn)于中新世布爾迪加爾階（英語：Burdigalian）的地層，是目前化石紀(jì)錄中已發(fā)現(xiàn)的四個傘菌的屬之一。
2002年一篇大規(guī)模的種系發(fā)生學(xué)研究以核糖體大次單元的基因序列分析傘菌目下各類群的親緣關(guān)系，以小菇科之名描述一個包含網(wǎng)孔菌屬（英語：Dictyopanus）、膠孔菌屬（英語：Favolaschia）、小菇屬、扇菇屬（英語：Panellus）、孔小菇屬（英語：Poromycena）、脂小菇屬、Mycenoporella與Prunulus等屬、可信度較高的演化支。后來網(wǎng)孔菌屬被并入扇菇屬中，孔小菇屬與Prunulus則皆被并入小菇屬中。
半小菇屬（學(xué)名：Hemimycena）是小菇科的一個屬，于1938年由德國真菌學(xué)家洛夫·辛格描述發(fā)表。本屬蕈類的子實體多呈白色，小而脆弱，表面常覆有粉被（英語：Pruinescence）或軟毛（Pubescence），且蕈傘上具有菌蓋皮。其組織與擔(dān)孢子的梅澤試劑檢測結(jié)果均無淀粉樣蛋白。本屬蕈類多分布于草原與闊葉林中，在針葉林中則較少出現(xiàn)。截至2008年，本屬共記錄有約50種物種。2002年，一項大規(guī)模的分子種系發(fā)生學(xué)研究以核糖體大次單元的基因序列分析傘菌目中各類群的親緣關(guān)系，發(fā)現(xiàn)半小菇屬與小菇科其他屬間的親緣關(guān)系并不接近，不與其形成共同支序，而是與掛鐘菌（英語：Calyptella capula）親緣關(guān)系最近，兩者組成一單系群。
小菇屬（學(xué)名：Mycena）是傘菌目小菇科的一個屬，學(xué)名詞源是古希臘文的μ?κη?（mykes），意指蘑菇。本屬包含超過500個物種，大多數(shù)為較小型的蕈類。
小菇屬物種多行腐生生長，蕈傘一般較小，通常直徑不超過數(shù)公分，呈圓錐形或鐘形，蕈柄通常十分細(xì)小脆弱，蕈褶中通常有囊狀體（英語：Cystidium），孢子印則多為白色，擔(dān)孢子中常有類淀粉顆粒，子實體在梅澤試劑檢驗下常呈現(xiàn)似糊精反應(yīng)（英語：dextrinoid）。本屬多數(shù)物種為灰色或棕色，但也有部分物種顏色較鮮艷，如粉紅色的粉色小菇。
小菇屬物種間的區(qū)分相當(dāng)困難，有些物種只能用囊狀體的形狀等微觀特征加以鑒別，某些種類是可食的，某些則可能含有各種真菌毒素（英語：mycotoxin）而有毒，不過多數(shù)物種因太小而沒有煮食價值，有毒與否亦不明。本屬物種中，Mycena cyanorrhiza（英語：Mycena cyanorrhiza）略呈藍(lán)色，并可產(chǎn)生有致幻效果的裸蓋菇素，潔小菇則除了裸蓋菇素外，尚有毒蕈堿。紅紫柄小菇等部分物種蕈柄破裂時會流出乳膠。有些物種會發(fā)出類似氯氣的氣味。
小菇屬中，有超過33個物種會發(fā)出螢光，產(chǎn)生狐火（英語：Foxfire）的現(xiàn)象，分屬17個節(jié)（英語：Section (biology)），目前尚不知這些物種的發(fā)光現(xiàn)象是平行演化而來，或是其共祖即有此特征，不發(fā)光的類群則是在演化中丟失了此特征。這些物種發(fā)光的目的目前亦仍不明。
1947年，美國真菌學(xué)家亞歷山大·史密斯（英語：AlexanderSmith）以本屬為主題的專著中，共列出了232個物種，現(xiàn)在本屬在全世界已有超過500種物種發(fā)表。1992年，荷蘭真菌學(xué)家魯?shù)婪?/span>·艾諾特·馬斯·赫斯特拉努斯（英語：Rudolph Arnold Maas Geesteranus）將本屬物種分成38個節(jié)，隨著更多物種被發(fā)現(xiàn)，本屬中又設(shè)立了若干個新的節(jié)，不過具體分類情況十分復(fù)雜，有些物種不完全符合其所屬之節(jié)的特征，或只有在生活史的某階段符合。有些節(jié)下只含有一個物種。2002年，一項大規(guī)模的分子種系發(fā)生學(xué)研究以核糖體大次單元的基因序列分析傘菌目中各類群的親緣關(guān)系，發(fā)現(xiàn)小菇屬為復(fù)系群，其下部分物種應(yīng)移入其他屬中，小菇屬的核心支序則與扇菇屬（英語：Panellus）、膠孔菌屬（英語：Favolaschia）等類群的關(guān)系較近。
部分物種∶
紅頂小菇（英語：Mycenaacicula） M. acicula
美男小菇（英語：Mycena adonis） M.adonis
鷹色小菇（英語：Mycenaaetites） M. aetites
堿味小菇（英語：Mycenaalcalina） M. alcalina
紫萁小菇（英語：Mycenaalphitophora） M. alphitophora
彎柄小菇（英語：Mycenaarcangeliana） M. arcangeliana
M.cahaya (bioluminescent)
加州小菇（英語：Mycenacaliforniensis） M. californiensis
毛狀小菇 M.capillaripes
發(fā)光小菇 M.chlorophos
灰小菇（英語：Mycenacinerella） M. cinerella
檸黃色小菇（英語：Mycenacitricolor） M. citricolor
桔色凹小菇 M.citrinomarginata
橙黃小菇（英語：Mycenacrocata） M. crocata
黃柄小菇 M.epipterygia
變紅小菇 M.erubescens
黃色小菇（英語：Mycenaflavescens） M. flavescens
藍(lán)小菇（英語：Mycenagalericulata） M. galericulata
乳柄小菇（英語：Mycenagalopus） M. galopus
紅紫柄小菇 M.haematopus
全紫小菇（英語：Mycenaholoporphyra） M. holoporphyra
美柄小菇（英語：Mycenainclinata） M. inclinata
炫藍(lán)蘑菇 M.interrupta
墾丁小菇 M.kentingensis
利氏小菇（英語：Mycenaleaiana） M. leaiana
狹頭小菇（英語：Mycenaleptocephala） M. leptocephala
黃小菇（英語：Mycenaluteopallens） M. luteopallens
斑點小菇（英語：Mycenamaculata） M. maculata
葉生小菇（英語：Mycena metata） M.metata
奧力根小菇 M.oregonensis
奧氏小菇（英語：Mycenaoverholtsii） M. overholtsii[
暗花紋小菇 M.pelianthina
溝傘小菇（英語：Mycenapolygramma） M. polygramma
微細(xì)小菇（英語：Mycenapseudostylobates） M. pseudostylobates
潔小菇 M. pura
林小菇（英語：Mycena renati） M.renati
粉色小菇 M. rosea
粉紅小菇（英語：Mycenarosella） M. rosella
紅褐蓋小菇（英語：Mycenasanguinolenta） M. sanguinolenta
密小菇 M. stipata
柱小菇（英語：Mycenastylobates） M. stylobates
藍(lán)褐小菇（英語：Mycenasubcaerulea） M. subcaerulea
鈴鐺小菇（英語：Mycenatintinnabulum） M. tintinnabulum
織紋小菇（英語：Mycenavitilis） M. vitilis
普通小菇（西班牙語：Mycenavulgaris） M. vulgaris
扇菇屬（學(xué)名：Panellus），是小菇科下的一個屬。
鱗皮扇菇（學(xué)名：Panellusstipticus），分布于世界各地，屬扇菇屬一種，色通常為黃褐色。另外，該種野菇也是木棲腐生的小菇類，直接食用會引起中毒，不過磨成粉之后可外敷，為治療外傷出血之藥效。一個常見的和廣泛分布的物種，它被發(fā)現(xiàn)在亞洲，大洋洲，歐洲和北美，它生長在落葉喬木的原木，樹樁，和樹干和，尤其是櫸木，橡木，和樺木，在那里它們以群體或密集重疊群集生長。
鱗皮扇菇是屬于生物發(fā)光的幾十種真菌中的一個。來自北美洲東部的菌株通常是生物發(fā)光，但是，來自北美的太平洋沿岸地區(qū)和其他大洲的菌株都沒有生物發(fā)光。
生物發(fā)光是指某些生物環(huán)境中通過酶的作用，以產(chǎn)生光的能力。生物發(fā)光真菌很普遍，已知的真菌超過70種。
脂小菇屬（學(xué)名：Resinomycena）是小菇科的一個屬，其下包含至少八種物種，分布于北美、歐洲與東亞，其中日本脂小菇（瑞典語：Resinomycena japonica）可以發(fā)出螢光。本屬菇類大小較小，顏色為白色至棕黃色，在腐爛的樹葉、樹枝與樹干等基質(zhì)上行腐生生長。本屬與小菇屬、小皮傘屬（英語：Marasmius）與半小菇屬的外形十分相似，特征為梅澤試劑檢驗的結(jié)果孢子含有類淀粉蛋白、但子實體組織則很少呈似糊精（英語：Amyloid (mycology)）反應(yīng)，且蕈褶中的囊狀體（英語：Cystidium）與蕈柄均含有許多油脂。
