先問問大家，還記不記得剛確診后拿到基因檢測報告時的自己是怎樣的表情？是不是頭上不知道出現(xiàn)了多少個問號？ 今天就由上海長征醫(yī)院腫瘤科的焦主任給大家講述“如何看懂基因檢測報告”。 上海長征醫(yī)院腫瘤科 副主任醫(yī)師 醫(yī)學(xué)博士 副教授 本文內(nèi)容主要有以下五點： 什么是腫瘤基因檢測 要不要做基因檢測？ 拿什么做基因檢測？ 用什么方法做基因檢測？ 基因檢測報告怎么判讀？（四個要點） 什么是腫瘤基因檢測？ 腫瘤與基因突變有著干絲萬縷的聯(lián)系。腫瘤細(xì)胞中的基因變異，也決定了癌細(xì)胞的生長與分裂。這時候就可以針對腫瘤細(xì)胞的基因序列進(jìn)行測序，從而確定到底發(fā)生了哪些突變，而這個過程就叫做基因檢測。
要不要做基因檢測?
從醫(yī)生的角度，我想說是的；但是從患者的角度，我想說不一定。
醫(yī)生一方面需要基因檢測數(shù)據(jù)為臨床治療提供指引，另一方面從研究和數(shù)據(jù)積累的角度也需要積累足夠多的患者數(shù)據(jù)，以便日后更好地服務(wù)于患者。
但是從患者本身臨床治療出發(fā)，并不是每一個患者都需要進(jìn)行基因檢測。比如，對于腸癌根治性切除術(shù)后地患者，可以通過手術(shù)根除解決問題，后續(xù)不需要接觸到內(nèi)科治療。那這種時候?qū)颊哌M(jìn)行基因檢測就不太會對臨床治療產(chǎn)生指引，所以這種情況，就不需要進(jìn)行基因檢測；又比如，對于治療中不大用得到靶向治療得患者也是不需要進(jìn)行基因檢測的。
但是否需要進(jìn)行基因檢測與患者本身的疾病狀態(tài)以及在某一癌種中基因檢測能為患者帶來的臨床獲益是相關(guān)的。例如對于晚期肺腺癌患者就推薦做基因檢測，尋找腫縮的治療靶點，因為這類患者治療時首先會考慮能否使用靶向藥治療；還例如在治療后線，其他藥物治療耐藥的情況下，可以考慮進(jìn)行基因檢測，尋找其他潛在的治療機(jī)會。
要不要做，考慮以下四點：
看什么類型的腫瘤：肺癌？其他腫瘤？
看什么性質(zhì)的治療：輔助治療？晚期治療？
看什么階段的治療：一線治療？后線治療？
特殊情況下也需要考慮：遺傳致病基因檢測
綜上，要不要做基因檢測要結(jié)合患者情況，包括腫瘤類型、治療性質(zhì)、治療階段等方面綜合考量。除這些方面外，還有一種特殊情況，對于部分有可能存在遺傳的腫瘤，對于這部分患者和即使沒患者家屬都是建議需要做基因檢測來判斷是否攜帶遺傳基因。如果攜帶，那在未來日常生活中就需要尤為重視腫瘤的預(yù)防工作，篩查方面也要更加積極。
接下來重點給大家介紹一下這類“遺傳性腫瘤”。
腫瘤有兩種發(fā)生情況，一種是由于后天因素導(dǎo)致的，一種是由于先天遺傳因素導(dǎo)致的，這種先天遺傳因素導(dǎo)致的腫瘤就叫做遺傳性種瘤。比如一個家族中，連續(xù)幾代人都有出現(xiàn)癌癥，就很可能是家族遺傳性腫瘤。
遺傳性腫瘤基因檢測是什么？
腫瘤是一種「基因病」，所有腫瘤發(fā)生都跟基因發(fā)生異常改變相關(guān)，而遺傳性腫瘤便是由于患者先天就攜帶有異常/缺陷基因而導(dǎo)致的。這些發(fā)生缺陷后會導(dǎo)致遺傳性腫瘤發(fā)生的基因，叫做腫瘤易感基因。
遺傳性腫瘤基因檢測可以了解受試者是否攜帶有遺傳性腫瘤易感基因的異常突變，從而了解自身基因是否正常，罹患某些遺傳性腫瘤的風(fēng)險有多大等信息。遺傳性腫瘤基因檢測可以在身體還沒有發(fā)生腫瘤的情況下，找到威脅健康的隱患，提前預(yù)警，從而更針對性地改善自己的生活環(huán)境、生活習(xí)慣、加強(qiáng)預(yù)防與監(jiān)測，保障未來的健康生活。
什么人適合做遺傳性腫瘤基因檢測?
有腫瘤家族史的人，需要盡早做遺傳性腫瘤基因檢測，了解自身患病風(fēng)險，及早做針對性預(yù)防；
已發(fā)生常見腫瘤如乳腺癌、結(jié)直腸癌的患者，甄別是否為遺傳性腫瘤，提供針對性治療，同時為親屬提供重要提示信息，遺傳性腫瘤患者有一半的幾率會將缺陷基因遺傳給自己的子女；
遺傳性腫瘤并非僅僅是有家族史才有風(fēng)險，即使沒有家族史，如果生殖細(xì)胞發(fā)生了突變，后代同樣可能患遺傳性腫瘤，因此遺傳性腫瘤基因檢測同樣適合于關(guān)注健康的人群。
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拿什么做基因檢測?
基因檢測的本質(zhì)是測定腫瘤基因的變化，換而言之，只要富含腫瘤相關(guān)基因的樣本都可以拿來做基因檢測的樣本。當(dāng)然，剛才提到的遺傳性腫瘤的測定就不需要腫瘤DNA，對于正常人可以使用正常體細(xì)胞所攜帶的基因（血液、唾液、上皮等）。那么在臨床上什么樣的樣本是富含腫瘤基因的樣本呢？
這張圖是醫(yī)生在給學(xué)生上課或者是給初學(xué)腫瘤的醫(yī)生講課時經(jīng)常會用到的，富含腫瘤基因的樣本可以是新鮮穿刺的組織、也可以是手術(shù)的樣本、也可以是石蠟固定的樣本，也可以是一些血液或者體液樣本，只要他存在著，或者說富含一定比例的腫瘤DNA，就可以作為腫瘤基因檢測的合格樣本。
這里再提一點，醫(yī)生在給學(xué)生上課時會非常注意強(qiáng)調(diào)體液樣本的重要性，因為在既往或基因檢測剛開始的時候，其實對這部分的樣本如何進(jìn)行合理使用存在一定爭議，或者說認(rèn)識不足。那么現(xiàn)在隨著基因檢測技術(shù)的不斷進(jìn)步，檢測的深度和精確度都有很大程度提高，現(xiàn)如今對于一些腫瘤DNA的含量、相對組織較少的液體樣本（如胸水、腹水、血液等），也都可以進(jìn)行準(zhǔn)確定性檢測。而且臨床實踐發(fā)現(xiàn)，其實這種基因檢測和組織的基因檢測是互補(bǔ)的，每種樣本都有它的優(yōu)勢和劣勢，兩者互補(bǔ)也可以使臨床上增添更多的選擇。
除此之外，經(jīng)常會有患者臨床中會問到一個問題：基因檢測時，是否需要做白細(xì)胞對照，送檢白細(xì)胞對照的目的是什么?
其實使用血液做白細(xì)胞對照就相當(dāng)于基因檢測做一個本體的對照，把原本存在于身體的一些突變篩選出來，避免在檢測結(jié)果判讀的時候后身體原本的問題影響。
用什么方法做基因檢測?
這張圖經(jīng)常用到，其實在臨床上去測定一個基因是否發(fā)生異常。除了使用二代測序的方法之外，還有一些其他手段，如：
①免疫組化
這是診斷腫瘤最基礎(chǔ)、最古老也是最便宜的方法，可能做一個免疫組化的指標(biāo)，只要幾十塊錢就夠了，雖然簡單便宜，但在基因檢測中仍然發(fā)揮著非常重要的作用，目前免疫組化仍然是我們臨床上經(jīng)常會采用的一種方法。當(dāng)然，這里必須要強(qiáng)調(diào)的是使用免疫組化來進(jìn)行的基因異常的判讀，它并不是直接針對基因去做的，而是針對基因突變之后所編碼出來的蛋白來進(jìn)行檢測的。這個檢測在臨床上最常用的兩個蛋白，一個是her2，另外一個就是肺癌患者中常見的ALK蛋白，一旦存在著her2和ALK免疫組化陽性達(dá)到了判定的值，就可以在臨床上給患者選擇相應(yīng)的靶向治療。
②FISH/CISH
在二代測序方法還沒有出來的時候，F(xiàn)ISH/CISH這種免疫熒光的方法是臨床上一種比較高大上的檢驗方法。它需要使用探針來進(jìn)行一些比較復(fù)雜的判讀。經(jīng)過FISH檢測，也可以判定部分基因的異常（ALK/ROSE1融合、HER2的擴(kuò)增）。
③一代、二代測序
一代測序比前兩種方法更新，這種方法的優(yōu)點是可以明確的知道基因所發(fā)生的直接變化，比前面兩種方式更加直接、直觀，但是它的缺點也比較明顯，它每次測定只是局限于單基因測定，成本相應(yīng)的也會高一些。
二代測序是最近幾年臨床腫瘤學(xué)進(jìn)展中檢測技術(shù)中進(jìn)步最快、應(yīng)用最為廣泛的一種，這個技術(shù)的出現(xiàn)既突破了前面三種方法一次只能檢測一種基因變化的瓶頸，又能夠把之前的測序成本較高的問題進(jìn)行克服，為臨床醫(yī)生提供了越來越多信息的同時也為患者提供了更多的治療機(jī)會。
基因檢測報告怎么判讀?
其實這個問題，臨床醫(yī)生也很難能解釋得很清楚。在這里，給大家判讀基因檢測結(jié)果的四個要點：
1.合適的樣本、合理的時機(jī)、合格的質(zhì)控才會有可信的報告
合適的樣本一定要包含足夠的腫瘤DNA，無論是提取的新鮮組織、石蠟樣本還是血液、胸水，在進(jìn)行檢測之前，一定要判斷其中的腫瘤組織成分或腫瘤相關(guān)DNA的成分多少，這也是臨床醫(yī)生在解析基因檢測報告的時候非常關(guān)注的一點。
還要注意有沒有做質(zhì)量控制，質(zhì)量控制里面有沒有提到腫瘤細(xì)胞的含量，有沒有提到液體活檢樣本其中的腫瘤相關(guān)DNA的含量，這也是非常非常關(guān)鍵的一點。
時機(jī)也非常重要，比如十年前手術(shù)切掉的腫瘤，拿到十年后去做基因檢測，在臨床上實際就不可用，簡單地說準(zhǔn)確性不高，除此之外，用十年前的結(jié)果來指導(dǎo)目前的治療是很不可靠的。
所以只有合適的樣本、合理的時機(jī)、合格的質(zhì)控才會有可信的報告。
2.靶向治療、免疫治療和遺傳風(fēng)險是基因檢測報告的核心
關(guān)于基因檢測，我們需要通過一份基因檢測的結(jié)果知道靶向治療、免疫治療以及遺傳風(fēng)險。以肺癌患者舉例，在中國患者有50%以上的存在著驅(qū)動基因的突變，在對晚期肺癌患者進(jìn)行檢測的時候，首先需要關(guān)注的有沒有可治療的靶點，有沒有靶向治療的機(jī)會；
我們還要關(guān)注基因突變和免疫治療的關(guān)系，雖然免疫治療很新還存在一定不確定性，毋庸置疑的是，基因檢測能夠為患者是否使用免疫治療帶來一定指引；
最后大家應(yīng)該都知道，明確的基因突變和遺傳之間存在公認(rèn)聯(lián)系，有很多的基因異?？赡茴A(yù)示著患者會存在比較高的患病風(fēng)險，那么相應(yīng)地，這部分人也要更積極地篩查和預(yù)防。
3.具體判讀需要結(jié)合原發(fā)腫瘤、既往治療等具體情況
這一點相信不用過多解釋，對于一個基因檢測的報告進(jìn)行合理的判斷，一定要結(jié)合患者的情況進(jìn)行檢測，報告不是千人一讀，可能每兩個人的檢測報告一模一樣，但這兩個人的用藥可能是完全不同的。
4.部分情況下需要醫(yī)學(xué)、生物、生信、藥學(xué)等多團(tuán)隊共同解讀
這是目前臨床實踐中經(jīng)常去開展但仍然是非常困難的一個方面。很多情況下想要合理解讀一份基因檢測報告或想讓基因檢測報告轉(zhuǎn)化成為對患者一個最佳的治療方案，其實是非常難的一件事。而這件事很可能不光需要患者的臨床醫(yī)生，可能還需要病理科醫(yī)生、藥學(xué)科醫(yī)生一起來想辦法，除此之外我們還需要非醫(yī)學(xué)專業(yè)的，比如說生物學(xué)、生物信息學(xué)、遺傳學(xué)等等的專家一起來進(jìn)行解讀。
希望今天的內(nèi)容可以幫助大家更加了解基因檢測的那些事，如果看不懂基因檢測報告，或者需要幫助，請直接掃碼聯(lián)系小助手獲取幫助！
