1.管弦樂隊演奏的交響曲：
MWV.N.8 D大調(diào)交響曲（為弦樂隊而作的《D大調(diào)第八交響曲》的管弦樂隊版本，由門德爾松本人親自改編），完成于1822年；
MWV.N.13 c小調(diào)第一交響曲（首演時稱c小調(diào)第十三交響曲），Op.11，完成于1824年；
MWV.A.18 降B大調(diào)第二（頌贊歌）交響曲（亦交響康塔塔），Op.52，完成于1840年；
MWV.N.18 a小調(diào)第三（蘇格蘭）交響曲，Op.56，完成于1842年；
MWV.N.16 A大調(diào)第四（意大利）交響曲，Op.90，完成于1833年；
MWV.N.15 d小調(diào)第五（宗教改革）交響曲，Op.107，完成于1830年，出版于1868年；
MWV.N.17 降B大調(diào)交響曲（未完成，僅存片段），寫于1839年；
MWV.N.19 C大調(diào)交響曲（未完成，僅存片段），寫于1845年。
2.弦樂隊演奏的交響曲（早期的作品，完成于1821-1823年）：
MWV.N.1 C大調(diào)第一交響曲，3個樂章，1821；
MWV.N.2 D大調(diào)第二交響曲，3個樂章，1821；
MWV.N.3 e小調(diào)第三交響曲，3個樂章，1821；
MWV.N.4 c小調(diào)第四交響曲，3個樂章，1821；
MWV.N.5 降B大調(diào)第五交響曲，3個樂章，1821；
MWV.N.6 降E大調(diào)第六交響曲，3個樂章，1821；
MWV.N.7 d小調(diào)第七交響曲，4個樂章，1821；
MWV.N.8 D大調(diào)第八交響曲，4個樂章，1822；
MWV.N.9 C大調(diào)第九交響曲，4個樂章，1823；
MWV.N.10 b小調(diào)第十交響曲，1個樂章，1823；
MWV.N.11 F大調(diào)第十一交響曲，5個樂章，1823；
MWV.N.12 g小調(diào)第十二交響曲，3個樂章，1823；
MWV.N.14 c小調(diào)交響樂章，1個樂章，1823。
3.玩具交響曲（Kindersinfonie，全部遺失）
MWV.P.4 玩具交響曲，寫于1828年；
MWV.P.6 玩具交響曲，寫作時間不明；
MWV.P.8 玩具交響曲，寫作時間不明。
（二）序曲
MWV.P.3 E大調(diào)仲夏夜之夢序曲，Op.21（1826）；
MWV.P.1 C大調(diào)管樂序曲，Op.24（1824）；
MWV.P.7 b小調(diào)赫布里底群島序曲，Op.26（1830，又名芬格爾洞序曲）；
MWV.P.5 D大調(diào)平靜的大海和幸福的航行序曲，Op.27（1828）；
MWV.P.12 F大調(diào)美麗的梅露西娜序曲，Op.32（1833）；
MWV.P.15 c小調(diào)呂伊·布拉斯序曲，Op.95（1839）；
MWV.P.2 C大調(diào)小號序曲，Op.101（1826）。
（三）其它管弦樂作品
MWV.P.14 a小調(diào)葬禮進(jìn)行曲，Op.103（1836）；
MWV.P.16 D大調(diào)進(jìn)行曲，Op.108（1841）；
MWV.P.17 降E大調(diào)進(jìn)行曲，寫作時間不明；
MWV.P.18 降E大調(diào)進(jìn)行曲，寫作時間不明。
（四）鋼琴協(xié)奏曲
MWV.O.2 a小調(diào)鋼琴協(xié)奏曲（一架鋼琴與弦樂隊），完成于1822年；
MWV.O.5 E大調(diào)鋼琴協(xié)奏曲（兩架鋼琴與管弦樂隊），完成于1823年；
MWV.O.6 降A(chǔ)大調(diào)鋼琴協(xié)奏曲（兩架鋼琴與管弦樂隊），完成于1824年；
以下為一架鋼琴與管弦樂隊的協(xié)奏曲：
MWV.O.7 g小調(diào)第一鋼琴協(xié)奏曲，Op.25，完成于1831年；
MWV.O.11 d小調(diào)第二鋼琴協(xié)奏曲，Op.40，完成于1837年；
MWV.O.13 e小調(diào)第三鋼琴協(xié)奏曲，寫于1842至1844年；
注：門德爾松本人并未完成e小調(diào)第三鋼琴協(xié)奏曲，它有部分管弦樂譜（其中只有第一樂章的前11小節(jié)是完整的，此外還有56小節(jié)不完整的管弦樂譜）和鋼琴譜草稿，并未由作曲家本人親自配器完成。第一、二樂章（分別為e小調(diào)、a小調(diào)）的鋼琴譜草稿由門德爾松本人完成，第三樂章（E大調(diào)）的鋼琴譜草稿未完成，僅有20小節(jié)。由意大利鋼琴家普羅希達(dá)（Roberto Prosseda）于2006年在牛津的圖書館中發(fā)現(xiàn)這兩份手稿，并求助于研究門德爾松作品的權(quán)威學(xué)者布法里尼，將之補(bǔ)寫完成，并于2007年進(jìn)行全球首演，后又與指揮大師里卡多·夏伊（Ricardo Chailly）和萊比錫布商大廈管弦樂團(tuán)合作錄制了一張唱片。
（五）小提琴協(xié)奏曲
MWV.O.3 d小調(diào)小提琴協(xié)奏曲（一把小提琴與弦樂隊），完成于1822年；
MWV.O.14 e小調(diào)小提琴協(xié)奏曲（一把小提琴與管弦樂隊），Op.64，完成于1844年；
（六）二重協(xié)奏曲
MWV.O.4 d小調(diào)鋼琴與小提琴協(xié)奏曲（鋼琴、小提琴與弦樂隊），完成于1823年。
（七）大提琴協(xié)奏曲
門德爾松曾于1844年之后寫過一首大提琴協(xié)奏曲，不過此曲手稿后來遺失。
（八）鋼琴與樂隊作品（協(xié)奏曲除外）
MWV.O.1 d小調(diào)宣敘調(diào)曲（鋼琴與弦樂隊），完成于1820年；
MWV.O.8 b小調(diào)輝煌隨想曲，Op.22，完成于1832年；
MWV.O.9 c小調(diào)輝煌變奏曲（Duo concertant en variations brillantes，兩架鋼琴與樂隊），Woo.25，完成于1833年。
MWV.O.10 降E大調(diào)輝煌回旋曲，Op.29，完成于1834年；
MWV.O.12 b小調(diào)小夜曲與歡快的快板，Op.43，完成于1838年。
