外顯子的數(shù)據(jù)不會(huì)看怎么辦?
miRNA的靶基因怎么預(yù)測(cè)?
MeV怎么畫熱圖?
GSEA軟件怎么用?
數(shù)據(jù)上傳NCBI報(bào)錯(cuò)怎么辦?
單細(xì)胞測(cè)序有沒有最新的文獻(xiàn)解讀?
測(cè)序建庫的method怎么寫?
……
以上是合作伙伴在向技術(shù)支持尋求幫助時(shí),經(jīng)常會(huì)提到的問題。
華大科技去年9月推出的在線知識(shí)庫,涵蓋了高通量測(cè)序的各種知識(shí)和教程,并在不斷更新中。自上線以來,知識(shí)庫獲得了合作伙伴的廣泛好評(píng)。
根據(jù)日常的技術(shù)回復(fù)統(tǒng)計(jì),近期我們對(duì)知識(shí)庫內(nèi)容進(jìn)行集中升級(jí),知識(shí)體量進(jìn)一步上升,隨時(shí)在線查看,繼續(xù)免費(fèi)!??!
先給大家看看更新總覽:
√結(jié)果解讀視頻
新增ATAC-seq、微生物和質(zhì)譜類產(chǎn)品,更新WGS & WES
√產(chǎn)品幫助文檔FAQ
擴(kuò)容,并新增:微生物和質(zhì)譜類產(chǎn)品幫助文檔
√測(cè)序基礎(chǔ)概念
√數(shù)據(jù)實(shí)用技巧
新增:KOBAS、DAVID、MapMan、AgriGO、Metascape軟件使用,利用FZ上傳SRA數(shù)據(jù)等等,新增培訓(xùn)課程視頻(課程涵蓋Dr.Tom、Excel、GSEA和Cytoscape),新增小RNA靶基因工具教程
√文章套路解讀(擴(kuò)容)
√提取建庫的實(shí)驗(yàn)SOP和方法描述(新增)
讓我們具體一一介紹:
01
結(jié)果解讀視頻
此次升級(jí),知識(shí)庫新增了ATAC-seq產(chǎn)品解讀視頻,更新了WGS和WES的解讀視頻。ATAC是一個(gè)較新的技術(shù),拿到數(shù)據(jù)結(jié)果后,很多合作伙伴往往不知道該如何利用和解讀。WGS和WES方面,則新添了實(shí)際案例以幫助挖掘數(shù)據(jù)。
整體來說,這部分內(nèi)容涵蓋mRNA、非編碼RNA、DNA、表觀和動(dòng)植物重測(cè)序等產(chǎn)品的報(bào)告(report)和數(shù)據(jù)文件(data)解讀,針對(duì)每一個(gè)條目、每一個(gè)文件及概念都有詳細(xì)的解讀視頻。
圖1 WES & WGS視頻解讀截圖
02
產(chǎn)品幫助文檔FAQ
蛋白和代謝類的產(chǎn)品FAQ此前沒有收錄進(jìn)來,本次更新成功收錄。另外,知識(shí)庫新增了各個(gè)方向的高頻提問,方便大家搜索。
總的來說,此部分收錄了各類FAQ問題,涵蓋所有科服核心產(chǎn)品,從取樣建庫、基礎(chǔ)分析到高級(jí)分析等每個(gè)步驟均有涉及,全面解答大家的疑惑;同時(shí),我們定期更新收集到的問題,使數(shù)據(jù)庫保持在最全最新的狀態(tài)。
圖2 幫助文檔FAQ內(nèi)容截圖
03
相關(guān)測(cè)序概念
此部分囊括了常見概念、基因組變異相關(guān)概念、組學(xué)概念、數(shù)據(jù)文件格式的介紹、中心法則相關(guān)概念和常見數(shù)據(jù)庫的介紹。
圖3 NGS相關(guān)概念目錄
04
數(shù)據(jù)實(shí)用技巧
這部分的更新內(nèi)容非常多,涉及了各種第三方軟件的使用、NCBI數(shù)據(jù)的上傳、定量PCR實(shí)驗(yàn)的引物設(shè)計(jì)等,尤其是針對(duì)Excel、GSEA和Cytoscape三個(gè)工具錄制了強(qiáng)大的培訓(xùn)視頻,從原理、操作等方面帶領(lǐng)大家掌握和使用。具體更新內(nèi)容如下:
1)新增KOBAS、DAVID、MapMan、AgriGO等富集工具使用教程,Metascape注釋軟件使用教程;
2)新增上傳16S數(shù)據(jù)以及利用FileZilla上傳SRA數(shù)據(jù)的教程;
3)新增引物設(shè)計(jì)方法,協(xié)助合作伙伴開展qPCR驗(yàn)證實(shí)驗(yàn);
4)新增各大數(shù)據(jù)庫參考序列查找方法,涵蓋主流數(shù)據(jù)庫的不同物種;
5)新增在線培訓(xùn)視頻錄播,內(nèi)容涵蓋Dr.Tom、Excel、GSEA和Cytoscape;
6)新增小RNA專題,主要涉及靶基因工具的簡(jiǎn)單教程;
7)充實(shí)Excel作圖系列教程到應(yīng)用九,涵蓋各類熱圖繪制。
表1 新增教程的部分分析工具
圖4 Excel技巧目錄
05
文章套路解讀
分析整理已發(fā)表文章的思路,可以幫助我們?cè)O(shè)計(jì)課題實(shí)驗(yàn)和樣本分組。因此,我們收集了不同產(chǎn)品方向的2018-2019年最新論文,搭配解讀PPT直觀展示,通過文章思路分析和結(jié)果解讀,拆解最新最全的文章套路,協(xié)助大家設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)方案和分析思路。本次擴(kuò)容,重點(diǎn)新增10X單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、表觀、免疫組庫、微生物等產(chǎn)品的文章解讀。
圖5 文章解讀部分截圖
06
提取建庫的實(shí)驗(yàn)流程和方法描述
這是知識(shí)庫的全新模塊!很多小伙伴在撰寫文章Method時(shí),苦于不清楚具體的建庫測(cè)序步驟,更無法使用英語來描述,因此,此部分展示了常規(guī)DNA、RNA測(cè)序產(chǎn)品的提取和建庫方法,并改編為方法method英文段落,協(xié)助合作伙伴撰寫英文文章!
圖6 實(shí)驗(yàn)流程文件夾部分截圖
最后附上在線技術(shù)知識(shí)庫的二維碼,大家掃一下,收藏起來!
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注
集中升級(jí),
繼續(xù)免費(fèi),
隨時(shí)在線查看!
撰稿:歸佳棟
編輯:市場(chǎng)部
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