樣本來(lái)源
01
引物情況
02
引物情況:研究根據(jù)Drosophila melanogaster(黑腹果蠅)線粒體基因組設(shè)計(jì)了三對(duì)COI基因引物,具體如下:
研究結(jié)果
03
樣本中總共發(fā)現(xiàn)3264個(gè)節(jié)肢動(dòng)物OTUs(3綱22目281科1068屬1279種),包括食草動(dòng)物、捕食者、寄生性動(dòng)物和碎屑性動(dòng)物。每個(gè)單獨(dú)樣品平均回收200多個(gè)OTU,其中綠茶的平均OTU數(shù)最高。雖然大部分OTUs可能來(lái)源于收獲前的田間,但也發(fā)現(xiàn)了少量代表典型貯藏害蟲(chóng)的OTUs,它們可能是在加工和干燥后進(jìn)入樣品的。
圖1 三種引物組合的比較
圖2 樣品中回收的節(jié)肢動(dòng)物的分類(lèi)組成
看到這里,手里的的茶包頓時(shí)感覺(jué)不香了?!
別怕!檢測(cè)出OUTs并不代表茶葉中有這些昆蟲(chóng)的碎片,它們可能只是在葉片上小憩一下~因此,茶包里檢測(cè)到的DNA,只能證明該DNA的主人曾經(jīng)出現(xiàn)在這個(gè)環(huán)境中,但不表示它現(xiàn)在依然在這個(gè)茶包里。
喜大普奔
凌恩生物明星產(chǎn)品
魚(yú)類(lèi)eDNA產(chǎn)品再次大升級(jí)!
自建魚(yú)類(lèi)數(shù)據(jù)庫(kù)
本次升級(jí)獲得了更大的數(shù)據(jù)庫(kù)
更全面的物種分類(lèi)
更多的分析內(nèi)容
魚(yú)類(lèi)物種檢測(cè)更加精準(zhǔn)!!
The bug in a teacup—monitoring arthropod–plant associations with environmental DNA from dried plant material.Biology Letters,2022.
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