隨著測(cè)序技術(shù)的進(jìn)步,一系列重要物種的全基因組測(cè)序得以完成,極大地促進(jìn)了植物基因組學(xué)研究的開(kāi)展。基于全基因組數(shù)據(jù)來(lái)探討基因組的進(jìn)化規(guī)律越來(lái)越成為進(jìn)化生物學(xué)研究的重要方向。想研究有意義的植物基因家族進(jìn)化,那研究那種呢？好多初學(xué)者都有這個(gè)疑問(wèn)。
看你研究什么物種，現(xiàn)在都有現(xiàn)成的網(wǎng)站進(jìn)行了分析，以擬南芥為例，已經(jīng)鑒定的轉(zhuǎn)錄因子有2296個(gè)，分成了58個(gè)基因家族，這只是轉(zhuǎn)錄因子的，一般研究轉(zhuǎn)錄因子的基因家族比較多，你可以根據(jù)你的物種進(jìn)行具體分析。
其他物種的，網(wǎng)站都有，我發(fā)下鏈接，大家覺(jué)得好，關(guān)注一下我公眾號(hào)生信漫談，謝謝！
植物的都在這里有，具體的查找點(diǎn)上方菜單Download，也可以輸入物種名稱(chēng)點(diǎn)Search進(jìn)行查找。
這網(wǎng)站的功能還是很齊全的，大家多多研究：
以擬南芥的轉(zhuǎn)錄因子AP2家族的一個(gè)基因?yàn)槔M(jìn)行分析，可以看到一些具體的保守結(jié)構(gòu)域：
一些功能分析，靶基因預(yù)測(cè)，互作蛋白：
圖片：來(lái)自網(wǎng)絡(luò)
文章：來(lái)自網(wǎng)絡(luò)
排版：生信小白
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