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手推遺傳算法(Genetic Algorithm,GA)的詳細(xì)步驟圖解
來源:DeepHub IMBA


遺傳算法可以做什么?

遺傳算法是元啟發(fā)式算法之一。它有與達(dá)爾文理論(1859 年發(fā)表)的自然演化相似的機(jī)制。如果你問我什么是元啟發(fā)式算法,我們最好談?wù)剢l(fā)式算法的區(qū)別。

啟發(fā)式和元啟發(fā)式都是優(yōu)化的主要子領(lǐng)域,它們都是用迭代方法尋找一組解的過程。啟發(fā)式算法是一種局部搜索方法,它只能處理特定的問題,不能用于廣義問題。而元啟發(fā)式是一個(gè)全局搜索解決方案,該方法可以用于一般性問題,但是遺傳算法在許多問題中還是被視為黑盒。

那么,遺傳算法能做什么呢?和其他優(yōu)化算法一樣,它會(huì)根據(jù)目標(biāo)函數(shù)、約束條件和初始解給我們一組解。

最優(yōu)局部解與最優(yōu)全局解

遺傳算法是如何工作的?

遺傳算法有5個(gè)主要任務(wù),直到找到最終的解決方案。它們?nèi)缦隆?/span>
  • 初始化
  • 適應(yīng)度函數(shù)計(jì)算
  • 選擇
  • 交叉
  • 突變


定以我們的問題

我們將使用以下等式作為遺傳算法的示例。它有 5 個(gè)變量和約束,其中 X1、X2、X3、X4 和 X5 是非負(fù)整數(shù)且小于 10(0、1、2、4、5、6、7、8、9)。使用遺傳算法,我們將嘗試找到 X1、X2、X3、X4 和 X5 的最優(yōu)解。


將上面的方程轉(zhuǎn)化為目標(biāo)函數(shù)。遺傳算法將嘗試最小化以下函數(shù)以獲得 X1、X2、X3、X4 和 X5 的解決方案。


由于目標(biāo)函數(shù)中有 5 個(gè)變量,因此染色體將由 5 個(gè)基因組成,如下所示。


初始化

在初始化時(shí),確定每一代的染色體數(shù)。在這種情況下,染色體的數(shù)量是 5。因此,每個(gè)染色體有 5 個(gè)基因,在整個(gè)種群中總共有 25 個(gè)基因。使用 0 到 9 之間的隨機(jī)數(shù)生成基因。

在算法中:一條染色體由幾個(gè)基因組成。一組染色體稱為種群

下圖是第一代的染色體。


適應(yīng)度函數(shù)計(jì)算

它也被稱為評(píng)估。在這一步中,評(píng)估先前初始化中的染色體。對(duì)于上面示例,使用以下的計(jì)算方式。

這是第一代種群中的第一個(gè)染色體。


將 X1、X2、X3、X4 和 X5 代入目標(biāo)函數(shù),得到 53。


適應(yīng)度函數(shù)是 1 除以誤差,其中誤差為 (1 + f(x))。


下面公式中加 1 是為了避免零問題


這些步驟也適用于其他染色體。


選擇

輪盤賭法是遺傳算法中的一種隨機(jī)選擇方法。這就像賭場(chǎng)里的輪盤賭。它有一個(gè)固定點(diǎn),并且輪子旋轉(zhuǎn)直到輪子上的一個(gè)區(qū)域到達(dá)固定點(diǎn)的前面。

在遺傳算法的背景下,具有較高適應(yīng)度值的染色體將更有可能在輪盤賭中被選中。

首先,計(jì)算 5 條染色體的總適應(yīng)度值。

總計(jì) = ??.????????總計(jì) = 0.0185 + 0.0400 + 0.0178 + 0.0181 + 0.0434

然后,計(jì)算每個(gè)染色體的概率。下圖是第一條染色體概率的樣本計(jì)算(P1 = 0.1342)。


再次應(yīng)用到所有的染色體:


計(jì)算概率后,對(duì)于輪盤賭方法,需要計(jì)算其累積概率。


計(jì)算累積概率后,要使用輪盤進(jìn)行選擇,需要生成5個(gè)隨機(jī)數(shù)Uniform(0,1),這些隨機(jī)數(shù)決定了從選擇中剔除哪條染色體。

產(chǎn)生5個(gè)數(shù)字因?yàn)槲覀冇?條染色體


下圖就是挑選和消除染色體的方法。首先,根據(jù)累積概率排列染色體,所選擇的染色體由隨機(jī)數(shù)決定如下:


選擇后的新染色體如下所示。

交叉

在生物學(xué)中,交叉是指生殖的一個(gè)術(shù)語。兩條染色體被隨機(jī)選擇并通過數(shù)學(xué)運(yùn)算進(jìn)行匹配。在本例中使用單點(diǎn)交叉。

單點(diǎn)交叉意味著兩個(gè)親本的基因被一個(gè)交叉線交換

下圖包含使用Uniform(0,1)生成的隨機(jī)數(shù)。選擇用于交叉的染色體數(shù)量是由交叉率(Pc)控制的,其中最小值為0,最大值為1。例如確定Pc = 0.25,這意味著隨機(jī)數(shù)目小于0.25的染色體將成為交叉中的親本。

隨機(jī)數(shù)對(duì)染色體。例如,R1對(duì)1號(hào)染色體,R2對(duì)2號(hào)染色體,以此類推


交叉的染色體是染色體1,染色體3和染色體5。這三條染色體的結(jié)合如下所示。


為了確定交叉線的位置,需要生成一個(gè)1到n之間的隨機(jī)數(shù),其中n是染色體- 1的長度。我們生成了1到4。


染色體1和染色體3之間的交叉(稱為CO1)如下所示。


1號(hào)染色體和5號(hào)染色體之間的交叉(稱為CO2)如下所示。


3號(hào)染色體和5號(hào)染色體(稱為CO3)


突變

1號(hào)染色體和2號(hào)染色體來自新的2號(hào)染色體和4號(hào)染色體。他們沒有被選中進(jìn)行交叉。而染色體3、4和5來自前代的交叉。

下圖就是與“染色體選擇后使用交叉的結(jié)果”進(jìn)行的對(duì)比。


突變是我們賦予任何基因新的價(jià)值的過程。在本例中使用隨機(jī)突變,突變基因的數(shù)量由突變率決定(????)。首先,計(jì)算一個(gè)種群中的基因數(shù)量。

基因總數(shù) = 染色體 x 染色體中的基因數(shù)

接下來,發(fā)生突變的基因數(shù)量如下。


#突變的基因數(shù) = 基因總數(shù) x ????

因此,一個(gè)種群中的基因數(shù)量如下。

#genes = 5 x 6#genes = 30

突變基因數(shù)(????= 0.1)


#genes mutation = 30 x 0.1#genes mutation = 3

所以需要生成從1到30的隨機(jī)數(shù)。隨機(jī)數(shù)的結(jié)果是7、19和23。它們是突變基因的位置。接下來,對(duì)于每一個(gè)被選中的基因,生成一個(gè)從0到9的隨機(jī)數(shù)來替換舊的值。


這些突變后的新染色體是第二代


評(píng)估


對(duì)突變后的染色體進(jìn)行評(píng)估。


使用生成的新一代重復(fù)這個(gè)過程,就可以以獲得X1、X2、X3、X4和X5的最佳解。經(jīng)過幾代后,得到的最佳染色體如下。


這個(gè)目標(biāo)函數(shù)是有不同解的,所以我們這里只給出一個(gè)。如果需要添加限制條件,可以修改目標(biāo)函數(shù)。

代碼

下面的Jupyter Notebook是上面我們過程的代碼實(shí)現(xiàn):

https://gist.github.com/audhiaprilliant/f507d629a5322ca7f1ceaea027df0f6f


引用
[1] M. Fronita, R. Gernowo, V. Gunawan. 2017. Comparison of Genetic Algorithm and Hill Climbing for Shortest Path Optimization Mapping. The 2nd International Conference on Energy, Environment and Information System (ICENIS 2017). August 15th — 16th 2017. Semarang (ID). pp: 1–5.
[2] N. Arfandi, Faizah. 2013. Implementation of genetic algorithm for student placement process of community development program in Universitas Gadjah Mada. Journal of Computer Science and Information. 6(2): 70–75.
[3] T. Suratno, N. Rarasati, Z. Gusmanely. 2019. Optimization of genetic algorithm for implementation designing and modelling in academic scheduling. Eksakta: Berkala Ilmiah Bidang MIPA. 20(1): 17–24.

編輯:于騰凱
校對(duì):林亦霖
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