最近，約翰霍普金斯大學(xué)Kimmel癌癥中心的科學(xué)家，在對101例胰腺癌患者的血液和腫瘤進(jìn)行基因組測序后發(fā)現(xiàn)，至少三分之一患者的腫瘤有基因突變，這些突變有朝一日可能幫助指導(dǎo)疾病的精密治療。他們說，與標(biāo)準(zhǔn)的影像學(xué)檢查方法相比，血液檢測的結(jié)果，可以早半年預(yù)測到癌癥的復(fù)發(fā)。
約翰斯霍普金斯大學(xué)醫(yī)學(xué)院腫瘤學(xué)和病理學(xué)教授、Kimmel癌癥中心癌癥生物學(xué)項(xiàng)目聯(lián)合主任Victor Velculescu指出：“在所有癌癥類型中，胰腺癌是死亡率最高的一個(gè)。許多人認(rèn)為，沒有治療方案，但我們的研究表明，患者腫瘤樣本的基因組測序可以識別一些突變，這些突變可能是某些臨床試驗(yàn)或更適合這些患者的藥物的靶標(biāo)?！?/p> Velculescu警告說，為了讓患者認(rèn)識到基因組測序的治療指導(dǎo)益處，研究人員首先需要開發(fā)更大的、多機(jī)構(gòu)的試驗(yàn)，用實(shí)驗(yàn)或批準(zhǔn)的藥物，靶定該研究小組所確定的突變。他們測序研究的結(jié)果，利用Personal Genome Diagnostics（由霍普金斯大學(xué)的研究人員創(chuàng)辦的一個(gè)公司）公司產(chǎn)生的數(shù)據(jù)，在線發(fā)表于七月七日的《自然通訊》雜志（Nature Communications）。 在美國，每年有近50,000人被診斷出胰腺癌。診斷后存活期超過五年的患者只有不到百分之10，大多數(shù)患者都是根據(jù)他們的疾病階段（而不是他們腫瘤的基因組特質(zhì)），來確定治療方法。 在測序研究中，Velculescu和他的同事從101例II期胰腺癌患者收集了腫瘤標(biāo)本和正常的DNA，這些患者在賓夕法尼亞大學(xué)、哥本哈根大學(xué)和華盛頓大學(xué)接受了腫瘤手術(shù)切除。 研究小組對101例患者中24名患者的腫瘤和正常DNA，進(jìn)行了全外顯子組測序，以尋找驅(qū)動腫瘤生長的基因。然后，研究人員對其余患者的腫瘤和正常DNA進(jìn)行了測序，在一小部分促癌基因中尋找基因突變。 本文共同作者M(jìn)ark Sausen說，胰腺癌組織經(jīng)常是很難測序的，尋找突變充滿了挑戰(zhàn)性。為了克服這一挑戰(zhàn)，該研究小組使用敏感的“深度測序”方法，來確定突變基因。 該研究小組報(bào)道稱，101例患者中有98人在已知的胰腺癌基因（TP53、KRAS）中具有腫瘤突變。Sausen說，到目前為止，靶定這兩個(gè)突變的藥物，效果令人失望。然而，研究確定了38名患者，他們在ERBB2、PI3KCA、BRCA2、AKT1和AKT2這些基因中具有突變，這些基因是已被批準(zhǔn)用于其他疾病的藥物、正在進(jìn)行或發(fā)表的臨床試驗(yàn)的熱點(diǎn)基因。 可簡化二代測序建庫流程，詳細(xì)了解羅氏新技術(shù)>> >> Velculescu說，霍普金斯大學(xué)科學(xué)家們先前發(fā)表的研究，對精確選擇的藥物治療（它們能治療特定的癌癥突變）的潛在價(jià)值，提供了原理論證。他們對一名胰腺癌患者的腫瘤進(jìn)行測序，發(fā)現(xiàn)PALB2基因突變參與修復(fù)DNA損傷。當(dāng)醫(yī)生用絲裂毒素C（一種DNA損傷藥物）治療患者時(shí)，患者診斷后的存活期超過了五年，遠(yuǎn)高于平均存活期。
新測序研究發(fā)現(xiàn)的突變基因，與染色質(zhì)調(diào)控有關(guān)，這一過程指導(dǎo)DNA如何展開自身的小部分，從而使酶能夠激活基因。在目前的測序研究中，一組患者（20例，20%）——他們在ARID1A或MLL染色質(zhì)調(diào)控基因存在突變，并接受了常規(guī)療法治療，其存活率是缺乏突變患者的兩倍。十一例具有MLL基因突變的患者，在32個(gè)月后還活著，而具有正常MLL基因患者則是15個(gè)月。
在進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)中，科學(xué)家們每三個(gè)月一次，從51名早期胰腺癌患者中收集血液樣本，101名受試者中有44人和另外7人在目前的研究中接受了測序。51人中約有22（百分之43）人，在診斷時(shí)血液中有可檢測水平的癌癥DNA。此外，科學(xué)家們預(yù)測，與標(biāo)準(zhǔn)影像相比，通過尋找血液中脫落的癌癥DNA，可以早于六個(gè)月預(yù)測患者的術(shù)后腫瘤復(fù)發(fā)。
Velculescu說：“我們越早發(fā)現(xiàn)腫瘤復(fù)發(fā)，我們就可以越快地進(jìn)行額外的治療干預(yù)。使用血液樣本的液體活檢研究正在不斷發(fā)展，但這些初步結(jié)果為開發(fā)某種方法早期發(fā)現(xiàn)殘留病變和實(shí)時(shí)監(jiān)測患者腫瘤，提供了希望?！彼f，還需要開展更大的臨床試驗(yàn)，來確定血液為基礎(chǔ)的基因檢測的臨床效果。
Velculescu說，腫瘤組織的測序分析和基于DNA的血液測試，花費(fèi)數(shù)千元，可由商業(yè)公司和醫(yī)院提供。 如果進(jìn)一步的研究發(fā)現(xiàn)，測序可有效指導(dǎo)治療，Velculescu設(shè)想測定來自腫瘤組織或血液測試的靶序列。他說，雖然目前的研究中可能有一些額外的基因缺失，他們?nèi)匀豢s小了對指導(dǎo)治療可能會有幫助的基因數(shù)目。
