今天是第1590期日報。
Nature Reviews Immunology[IF:40.358]
① 分娩方式、抗生素使用、母乳喂養(yǎng)、病毒感染等因素均可影響生命早期的菌群定殖；② 宿主的菌群變化可直接調(diào)控Treg的誘導(dǎo)、IgA的產(chǎn)生及Th2型免疫應(yīng)答，或通過代謝產(chǎn)生短鏈脂肪酸等方式調(diào)控Treg、ILC2等免疫細(xì)胞的發(fā)育、增殖與功能；③ 環(huán)境菌群的暴露也可通過不同的機(jī)制影響免疫系統(tǒng)的發(fā)育，病毒及真菌對免疫系統(tǒng)的調(diào)控也不容忽視；④ 益生菌/益生元干預(yù)、預(yù)防呼吸道感染、提前接觸食物、攝入水解配方奶粉等方式或可通過調(diào)節(jié)菌群以預(yù)防過敏。
Early life microbial exposures and allergy risks: opportunities for prevention
09-11, doi: 10.1038/s41577-020-00420-y
【主編評語】現(xiàn)代化的生活方式可直接或間接影響菌群（包括細(xì)菌、病毒、真菌），后者在宿主免疫應(yīng)答的塑造中起到主導(dǎo)作用。生命早期是菌群發(fā)育的窗口期，也是有效預(yù)防過敏性疾病的關(guān)鍵時機(jī)。Nature Reviews Immunology上發(fā)表的一篇綜述文章，介紹了各種過敏性疾病的風(fēng)險因素（包括剖腹產(chǎn)、抗生素暴露、缺少母乳喂養(yǎng)、病毒感染等）對生命早期菌群定殖及免疫系統(tǒng)發(fā)育的影響，并討論了通過調(diào)控菌群以預(yù)防過敏的潛在策略。（@szx）
Nature Reviews Disease Primers[IF:40.689]
① UC發(fā)病率地區(qū)差異但不受種族影響，多種遺傳/環(huán)境因素影響UC風(fēng)險；② UC致病機(jī)制：菌群失調(diào)導(dǎo)致結(jié)腸粘液層受損，促進(jìn)細(xì)菌易位并激活巨噬細(xì)胞及其它APC，增強(qiáng)趨化/促炎因子分泌，以促進(jìn)免疫細(xì)胞浸潤；③ 應(yīng)綜合病史、內(nèi)窺、組織學(xué)及實驗室檢測進(jìn)行診斷，糞便鈣衛(wèi)蛋白等或可作為非侵入性診斷標(biāo)志物；④ 根據(jù)病程采用5-ASA、類固醇、生物制劑（靶向TNF、IL-12/23、整合素）、JAK抑制劑、手術(shù)等治療手段；⑤ 應(yīng)關(guān)注患者的腸外癥狀及生活質(zhì)量的改善。
Ulcerative colitis (Nature Reviews Disease Primers)
09-10, doi: 10.1038/s41572-020-0205-x
【主編評語】Nature Reviews Disease Primers上發(fā)表的一篇綜述文章，詳細(xì)介紹了潰瘍性結(jié)腸炎（UC）的流行病學(xué)、風(fēng)險因素、發(fā)病機(jī)制、診斷/篩查/預(yù)防、藥物及手術(shù)等治療及管理方式，并討論了未來的研究方向，包括機(jī)制研究、治療目標(biāo)變化、新藥研發(fā)及個性化醫(yī)療。（@szx）
Immunity[IF:22.553]
① 負(fù)向能量平衡（攝取<消耗）促進(jìn)代謝重編程（脂肪酸氧化>糖酵解），以調(diào)節(jié)免疫應(yīng)答等生理過程，從而促進(jìn)健康及長壽；② 肥胖相關(guān)的能量失調(diào)導(dǎo)致脂肪組織中的促炎性免疫細(xì)胞浸潤及NLRP3炎性小體活化，以促進(jìn)2型糖尿病、心血管疾病、癌癥等發(fā)生，并弱化針對病原體的免疫防御；③ 蛋白及必需氨基酸限制誘導(dǎo)轉(zhuǎn)硫作用途徑及整合性應(yīng)激應(yīng)答，以抑制NLRP3炎性小體介導(dǎo)的炎癥及Th17應(yīng)答；④ 卡路里限制減少循環(huán)中的免疫細(xì)胞，并降低系統(tǒng)性炎癥應(yīng)答。
Dietary Regulation of Immunity
09-15, doi: 10.1016/j.immuni.2020.08.013
【主編評語】整合性免疫代謝應(yīng)答（IIMR）將膳食攝入、能量利用及儲存與免疫應(yīng)答調(diào)控相聯(lián)系，對于穩(wěn)態(tài)的維持與恢復(fù)至關(guān)重要。來自Immunity上發(fā)表的一篇綜述文章，詳細(xì)介紹了飲食中的宏量營養(yǎng)素攝入及其代謝與免疫系統(tǒng)的關(guān)聯(lián)，重點討論了飲食中葡萄糖、脂肪、蛋白等組分的變化可能如何影響免疫系統(tǒng)——尤其是脂肪組織中的免疫應(yīng)答。（@szx）
Cellular and Molecular Immunology[IF:8.484]
① 噬菌體在細(xì)菌體內(nèi)可經(jīng)歷裂解周期和溶源周期，細(xì)菌通過CRISPR-Cas系統(tǒng)對噬菌體進(jìn)行防御，溶源性轉(zhuǎn)換可改變細(xì)菌對宿主的感染性及毒性；② 噬菌體通過多種方式與宿主腸道免疫系統(tǒng)互作，包括：抑制巨噬細(xì)胞的細(xì)菌吞噬及炎癥因子產(chǎn)生、激活樹突細(xì)胞及ILC產(chǎn)生IFN、直接抑制細(xì)菌定殖等；③ 遺傳因、飲食、出生方式、年齡等因素可能影響噬菌體組成；④ 噬菌體療法在治療多藥耐藥菌感染、靶向調(diào)控菌群、免疫調(diào)節(jié)領(lǐng)域具有巨大應(yīng)用前景。
Phages and their potential to modulate the microbiome and immunity
09-08, doi: 10.1038/s41423-020-00532-4
【主編評語】噬菌體雖被視為耐藥菌感染的潛在天然療法，卻因其特性和機(jī)制不明而受到應(yīng)用限制。測序技術(shù)的發(fā)展促進(jìn)了對噬菌體攻擊、破壞細(xì)菌的溶解和溶原機(jī)制的了解。Cellular and Molecular Immunology上發(fā)表的一篇綜述文章，詳細(xì)介紹了噬菌體-菌群-宿主免疫系統(tǒng)的互作機(jī)制，并展望了噬菌體在靶向菌群治療和免疫調(diào)節(jié)領(lǐng)域的巨大應(yīng)用前景。深入探索噬菌體--細(xì)菌-宿主間的相互作用，有助于更好的利用噬菌體治療多種傳染或非傳染性疾病。（@szx）
eLife[IF:7.08]
① 肥胖/糖尿病患者的不同組織（包括脂肪組織）高表達(dá)ACE2，ADAM17（高表達(dá)于肥胖/糖尿病患者中）介導(dǎo)的ACE2脫落導(dǎo)致后者在體內(nèi)重新分布并在肺部累積；② 肥胖/2型糖尿病患者的腸道屏障受損導(dǎo)致細(xì)菌及其產(chǎn)物滲漏進(jìn)入循環(huán)，而病毒感染誘導(dǎo)的腎素-血管緊張素系統(tǒng)（RAS）失調(diào)可損傷血管內(nèi)皮功能，進(jìn)一步促進(jìn)細(xì)菌易位；③ 循環(huán)中的LPS增加導(dǎo)致肺部的內(nèi)毒素累積，病毒與LPS的互作可上調(diào)促炎因子表達(dá)，并可穩(wěn)定病毒粒子的穩(wěn)定性并提高病毒感染性。
Obesity and diabetes as comorbidities for COVID-19: Underlying mechanisms and the role of viral–bacterial interactions
09-15, doi: 10.7554/eLife.61330
【主編評語】肥胖和糖尿病是COVID-19的并存病，患有肥胖/糖尿病的COVID-19患者可能表現(xiàn)出更嚴(yán)重的癥狀。來自eLife上發(fā)表的一篇綜述文章，詳細(xì)討論了肥胖與糖尿病惡化COVID-19的潛在機(jī)制，包括：患者脂肪組織中的ACE2高表達(dá)、ACE2的脫落及在肺部的累積、SARS-CoV-2感染促進(jìn)腸道細(xì)菌向循環(huán)中的易位、細(xì)菌-病毒互作對病毒感染性的提升等。（@szx）
Biosensors and Bioelectronics[IF:10.257]
① 硝酸鹽是腸道炎癥的生物標(biāo)志物；② 利用大腸桿菌中的NarX-NarL雙組分調(diào)控系統(tǒng)構(gòu)建硝酸鹽響應(yīng)的遺傳回路，該回路在腸樣厭氧條件下起作用；③ 利用靈敏度和特異度對硝酸鹽生物傳感器進(jìn)行優(yōu)化，隨后引入益生菌大腸桿菌Nissle1917；④ 該生物傳感器可在具有天然腸道菌群的小鼠的腸道炎癥過程中檢測到升高的硝酸鹽水平；⑤ 用布爾AND門生成一個遺傳編碼的生物傳感器，可同時檢測硫代硫酸鹽和硝酸鹽生物標(biāo)志物，增加監(jiān)測腸道炎癥工具的特異性。
A designed whole-cell biosensor for live diagnosis of gut inflammation through nitrate sensing
08-20, doi: 10.1016/j.bios.2020.112523
【主編評語】Biosensors and Bioelectronics近期發(fā)表的文章，開發(fā)出利用硝酸鹽反應(yīng)基因回路傳感來進(jìn)行實時診斷腸道炎癥的全細(xì)胞生物傳感器，或為炎癥相關(guān)疾病的非侵入性診斷提供新的途徑。（@愛的抉擇）
Nature Communications[IF:12.121]
① TMDI降低小鼠腸道菌群的定殖抗性，以促進(jìn)口服Lm在腸道中的擴(kuò)增，從而增強(qiáng)抗原特異性CD8+ Trm的應(yīng)答；② 重復(fù)使用抗生素處理可增強(qiáng)TMDI的效應(yīng)，進(jìn)一步促進(jìn)抗原特異性CD8+ Trm的產(chǎn)生；③ 高抗原負(fù)荷可增強(qiáng)腸道中抗原特異性CD8+ Trm的擴(kuò)增；④ 機(jī)制上，TMDI通過CXCL9/CXCL10-CXCR3軸，促進(jìn)CD8+ T細(xì)胞向腸道的遷移；⑤ 小鼠口服Lm30天后再次接受高劑量Lm，TMDI可通過增強(qiáng)CD8+ T細(xì)胞、CD4+ T細(xì)胞及γδT細(xì)胞等T細(xì)胞亞群的應(yīng)答起到組織保護(hù)作用。
Enhancing mucosal immunity by transient microbiota depletion
09-08, doi: 10.1038/s41467-020-18248-4
【主編評語】腸道中的CD8+ 組織駐留性記憶T細(xì)胞（Trm）可在遇到抗原后快速再活化，在粘膜表面提供免疫防御，但增強(qiáng)Trm應(yīng)答的機(jī)制尚未明確。Nature Communications上發(fā)表的一項最新研究，在單核細(xì)胞增多性李斯特氏菌（Lm）免疫后的小鼠中，發(fā)現(xiàn)短暫性菌群耗損強(qiáng)化免疫法 （TMDI）可通過抑制腸道菌群的定殖抗性，促進(jìn)Lm在腸道中的擴(kuò)增，從而增強(qiáng)抗原特異性CD8+ Trm的應(yīng)答，以在之后的二次免疫中提供組織保護(hù)作用。TMDI可作為研究腸道Trm應(yīng)答的工具，或作為設(shè)計新型粘膜疫苗的研究平臺。（@szx）
Microbiome[IF:11.607]
① 納入26名乳糜瀉高危嬰兒，分析出生時、3月齡及6月齡的腸道菌群組成、功能及代謝組；② 剖腹產(chǎn)與普通擬桿菌及Bacteroides dorei的豐度降低、葉酸生物合成通路的豐度降低、羥基苯乙酸的豐度升高相關(guān)，上述變化與免疫系統(tǒng)失調(diào)及炎癥狀態(tài)相關(guān)；③ 未暴露于環(huán)境風(fēng)險因素（剖腹產(chǎn)、非母乳、抗生素暴露）的嬰兒，單形擬桿菌與3-3-羥基苯丙酸的豐度隨時間而增加，而硫辛酸及甲烷代謝通路隨時間而降低，上述變化與免疫調(diào)控及抗炎癥效應(yīng)相關(guān)。
Multi-omics analysis reveals the influence of genetic and environmental risk factors on developing gut microbiota in infants at risk of celiac disease
09-11, doi: 10.1186/s40168-020-00906-w
【主編評語】遺傳易感性及谷蛋白暴露是乳糜瀉的必要非充分條件，提示生命早期的其它環(huán)境因素暴露可能在乳糜瀉的發(fā)病機(jī)制中起到重要作用。來自Microbiome上發(fā)表的一項最新研究，通過多組學(xué)分析，揭示了環(huán)境風(fēng)險因素（包括剖腹產(chǎn)、配方奶粉攝入、抗生素暴露）對乳糜瀉高危嬰兒的腸道菌群組成、功能及代謝組的影響，發(fā)現(xiàn)剖腹產(chǎn)與免疫失調(diào)及炎癥相關(guān)的菌群變化相關(guān)，而未暴露于環(huán)境風(fēng)險因素與免疫調(diào)節(jié)及抗炎癥相關(guān)的菌群變化相關(guān)。（@szx）
Gut Microbes[IF:7.74]
① ?；悄懰峥纱龠M(jìn)艱難梭菌的萌發(fā)并在rCDI患者的糞便中富集，而次級膽汁酸可抑制艱難梭菌的營養(yǎng)生長與毒性；② FMT可增加rCDI患者的糞便次級膽汁酸水平，恢復(fù)膽汁酸代謝酶功能，并激活法尼醇X受體通路；③ rCDI患者糞便中的SCFA水平降低，F(xiàn)MT干預(yù)后恢復(fù)，SCFA可調(diào)節(jié)腸道屏障功能并抑制炎癥；④ 菌群代謝產(chǎn)物三甲胺和氧化三甲胺在FMT后升高，可能與患者的菌群恢復(fù)及供體的飲食相關(guān)，或可根據(jù)三甲胺與氧化三甲胺的水平選擇供體。
Understanding the mechanisms of efficacy of fecal microbiota transplant in treating recurrent Clostridioides difficile infection and beyond: the contribution of gut microbial-derived metabolites
09-06, doi: 10.1080/19490976.2020.1810531
【主編評語】糞菌移植（FMT）是治療復(fù)發(fā)性艱難梭菌感染（rCDI）的有效手段，但FMT的起效機(jī)制尚未明確。Gut Microbes上發(fā)表的一篇Addendum，討論了糞菌移植對腸道菌群代謝產(chǎn)物（包括膽汁酸及短鏈脂肪酸（SCFA）等）的調(diào)節(jié)在治療rCDI中的作用機(jī)制，以及糞菌移植對其它菌群代謝產(chǎn)物（包括三甲胺及氧化三甲胺等）潛在影響。（@szx）
感謝本期日報的創(chuàng)作者：高壓鍋里的水母，solo，szx，orchid，Echo Quasimodo
