日前,上海辰山植物標(biāo)本館(CSH)順利完成了將館藏系統(tǒng)切換為APG IV的工作,這在國內(nèi)目前尚屬首家。
▲APG系統(tǒng)發(fā)育樹 中文海報 @鐘蜀黍滿臉黑線 制作,本文最下方附有海報下載地址。
APG系統(tǒng)又稱被子植物APG分類法,即基于演化歷史的被子植物分類系統(tǒng),該系統(tǒng)以親緣分支為手段,以單系群作為原則,利用分子生物學(xué)數(shù)據(jù)對被子植物進(jìn)行分類。1998年該系統(tǒng)首次發(fā)表,完全顛覆了傳統(tǒng)植物形態(tài)分類系統(tǒng)的基礎(chǔ)結(jié)構(gòu),很多科的范圍也有較大變動。
經(jīng)過近20年的發(fā)展,分子證據(jù)獲得手段的加強(qiáng)及其他證據(jù)的補(bǔ)充,2016年APG系統(tǒng)已經(jīng)發(fā)表第4版,框架已基本穩(wěn)定,其結(jié)論也得到主流學(xué)界的認(rèn)同。基于同樣手段,苔蘚類、石松及蕨類植物、裸子植物都有了較為完備的分子系統(tǒng)。
APG系統(tǒng)目前在國外各植物園和標(biāo)本館已得到廣泛認(rèn)可和應(yīng)用,如法國巴黎自然歷史博物館(888萬份)、邱園標(biāo)本館(700萬份)、瑞士日內(nèi)瓦植物園標(biāo)本館(600萬份)、密蘇里植物園標(biāo)本館(650萬份)等,全部已經(jīng)按照APG系統(tǒng)對館藏標(biāo)本進(jìn)行了重新排列。
為啥我們對APG系統(tǒng)了解甚少?
然而,在中國,學(xué)校的教材、專業(yè)機(jī)構(gòu)的志書專著,標(biāo)本館、數(shù)據(jù)庫,教育教學(xué)、科學(xué)普及,幾乎看不到對APG系統(tǒng)的介紹及應(yīng)用。其原因主要有:傳統(tǒng)分類觀念根深蒂固;認(rèn)為APG系統(tǒng)結(jié)果“不自然”;同科植物形態(tài)差異較大;對系統(tǒng)發(fā)育(Phylogeny)和支序分類學(xué)(Cladistics)原理的了解不夠深入;APG系統(tǒng)相關(guān)資料,尤其是中文資料較少;無人推廣APG系統(tǒng)在各相關(guān)領(lǐng)域的應(yīng)用。
事實表明,APG系統(tǒng)可以在形態(tài)上簡明直觀的解讀。在上海辰山植物園建園之初,全園標(biāo)牌、引種登記系統(tǒng)都已按APG系統(tǒng)進(jìn)行排列。隨著與之相配套的科普活動,APG系統(tǒng)得到了良好的宣傳及推廣,認(rèn)知度也得到很大提高。植物園是普通大眾接觸植物分類的主要場所,在中國各植物園和標(biāo)本館使用并推廣早已在國外普及多年的APG系統(tǒng)迫在眉睫。
▲CSH辦公區(qū)
在此環(huán)境下,經(jīng)多位館員和館長馬金雙教授討論后,上海辰山植物標(biāo)本館(CSH)決定與國際主流接軌,將館藏的十萬余份標(biāo)本全部由目前所采用的恩格勒系統(tǒng)(1964版)切換為最新發(fā)表的APG IV系統(tǒng)。
▲CSH標(biāo)本鑒定間
整個工作從2016年6月開始進(jìn)行,經(jīng)過對目前館藏迅速而妥善的重新規(guī)劃、編程、計算,在多位實習(xí)生的協(xié)助之下,歷時近四個月,完成了已入柜館藏標(biāo)本的系統(tǒng)切換和重新排布,這將極大地方便國內(nèi)外專家入館進(jìn)行查詢、鑒定和交流——對APG系統(tǒng)不熟悉的專家,標(biāo)本館將另有對比標(biāo)牌系統(tǒng)輔助查找。
▲CSH標(biāo)本柜外的標(biāo)識系統(tǒng)
▲CSH工作人員正在將館藏標(biāo)本數(shù)字化
上海辰山植物標(biāo)本館立足華東、面向全國,聚焦于生物多樣性重點地區(qū)和關(guān)鍵類群,致力于標(biāo)本收集和基于憑證的植物多樣性編目。標(biāo)本館占地1561.5平方米,已經(jīng)收集標(biāo)本12萬份。
▲CSH館藏的一份華東地區(qū)最大的植物標(biāo)本,筆筒樹(桫欏科)的一片葉子
標(biāo)本館采用數(shù)字化標(biāo)本采集新模式,并制訂了嚴(yán)格的標(biāo)本采集、制作、保藏規(guī)范,為辰山植物園的科研和活植物收集工作提供了基礎(chǔ)的標(biāo)本材料和技術(shù)支持。另外,標(biāo)本館創(chuàng)建了專業(yè)機(jī)房,為科研數(shù)據(jù)提供了可靠的海量存儲空間與基礎(chǔ)運(yùn)算平臺,創(chuàng)建了數(shù)字植物標(biāo)本館系統(tǒng)與活植物管理系統(tǒng),對標(biāo)本與科研數(shù)據(jù)均進(jìn)行數(shù)字化管理工作。
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