機關單位和事業(yè)單位的區(qū)別有：1、性質不同：機關單位是行政單位；事業(yè)單位是國家基于公共目的成立的公共事業(yè)組織。2、編制不同：機關單位使用行政編制，其經費由國家行政經費負擔；事業(yè)單位使用事業(yè)編制，其經費由國家事業(yè)經費負擔。3、含義不同：機關單位是國家為行使其職能而設立的各種機構，專司國家權力和國家管理職能的組織；事業(yè)單位是由政府利用國有資產設立的，從事教育、科技、文化、衛(wèi)生等活動的社會服務組織。
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