今天是第581期日報。
Cell Host and Microbe[IF:14.946]
① 以往的很多研究明確了腸道有益細(xì)菌對黏膜屏障的保護(hù)作用，但很少有研究把關(guān)注點(diǎn)放到有益真菌上；② 用抗生素處理后的小鼠，腸屏障受損，對結(jié)腸炎和甲型流感病毒敏感，而在腸道單一定殖假絲酵母菌或釀酒酵母，就可有效逆轉(zhuǎn)這樣的狀況；③ 保護(hù)作用由真菌細(xì)胞壁上非常保守的組成——甘露聚糖介導(dǎo)，在腸道中，它自身就可以逆轉(zhuǎn)清除共生細(xì)菌后小鼠的疾病敏感性；④ 若要發(fā)揮保護(hù)作用，真菌需要長期在腸道定殖，并正向刺激保護(hù)性CD8+T細(xì)胞激活。
Commensal Fungi Recapitulate the Protective Benefits of Intestinal Bacteria
2017-11-23 DOI: 10.1016/j.chom.2017.10.013
Nature Reviews Genetics[IF:40.282]
① 埃博拉和寨卡病毒的疫情提示需要持續(xù)監(jiān)控、快速診斷和實(shí)時跟蹤新發(fā)傳染??；② 臨床宏基因組學(xué)、便攜式測序儀等新技術(shù)可應(yīng)用于快速反應(yīng)診斷；③ 基因組診斷及流行病學(xué)分析，聯(lián)合創(chuàng)新型疾病檢測平臺，促進(jìn)了全球開放性數(shù)字化病原體監(jiān)測系統(tǒng)的建設(shè)；④ 利用宏基因組學(xué)進(jìn)行疫情的快速診斷及應(yīng)對，面臨的挑戰(zhàn)不僅來自于病原體（基因組大小）及宿主（感染時期、病原體滴度），還來自于采樣、樣本處理、測序、信息分析與交流、有效的行動等環(huán)節(jié)。
Towards a genomics-informed, real-time, global pathogen surveillance system
2017-11-13 DOI: 10.1038/nrg.2017.88
Mass Spectrometry Reviews[IF:9.373]
① 腸道菌群通過改變腸道內(nèi)穩(wěn)態(tài)影響大腦功能，腸-腦互作的功能紊亂與多種神經(jīng)退行性疾病相關(guān)；② 腸道菌群和宿主共代謝的小分子代謝物（SMM）包括多種神經(jīng)遞質(zhì)、色氨酸分解代謝產(chǎn)物、多不飽和脂肪酸、短鏈脂肪酸、膽汁酸等；③ 通過血流、迷走神經(jīng)和腸神經(jīng)系統(tǒng)，在腸-腦雙向交流中起到關(guān)鍵作用；④ 將多種主要質(zhì)譜技術(shù)（液相色譜-質(zhì)譜、氣相色譜-質(zhì)譜、質(zhì)譜成像等）應(yīng)用于生物樣本的代謝組學(xué)分析，可鑒定出與神經(jīng)退行性疾病相關(guān)的SMM。
Mass spectrometry-based metabolomics: Targeting the crosstalk between gut microbiota and brain in neurodegenerative disorders
2017-11-12 DOI: 10.1002/mas.21553
Neurotherapeutics[IF:5.166]
① 焦慮和抑郁等精神疾病與菌群-腸-腦軸緊密相關(guān)；② 消化道中不同位置和類型的腸內(nèi)分泌細(xì)胞可分泌多種腸肽（神經(jīng)肽Y家族、縮膽囊素、胰高血糖素樣肽、促皮質(zhì)素釋放因子、催產(chǎn)素、 饑餓素等）；③ 這些信號分子及其受體作用于消化道，并在大腦中廣泛表達(dá)，可通過迷走神經(jīng)、血液循環(huán)和免疫系統(tǒng)，直接或間接影響大腦功能；④ 腸道菌群可調(diào)控腸肽的分泌和濃度；⑤ 通過精神益生菌手段（Psychobiotics）改善菌群以調(diào)控腸肽，可為精神疾病提供新療法。
Anxiety, Depression, and the Microbiome: A Role for Gut Peptides
2017-11-13 DOI: 10.1007/s13311-017-0585-0
Frontiers in Physiology[IF:4.134]
① 收集37例肺結(jié)核（初治結(jié)核NTB、復(fù)治結(jié)核RTB）以及20例健康對照組樣本，對腸道菌群進(jìn)行分析；② 基于豐度的覆蓋率估計（ACE）提示，RTB患者的菌群多樣性指數(shù)高于健康對照組；③ RTB患者糞便中，包含多種致病菌的放線菌門及變形菌門增高，包含多種有醫(yī)生共生菌的擬桿菌門降低；④ NTB和RTB患者中口腔來源的普氏菌屬、毛螺菌屬均顯著低于健康對照組；⑤ 腸道菌群與外周血CD4+T細(xì)胞正相關(guān)，維持腸道菌群生態(tài)平衡，對宿主恢復(fù)及預(yù)防結(jié)核復(fù)發(fā)有益。
Alternation of Gut Microbiota in Patients with Pulmonary Tuberculosis
2017-11-17 DOI: 10.3389/fphys.2017.00822
Frontiers in Microbiology[IF:4.076]
① 單一抗生素或抗生素組合處理后，小鼠的空腹血糖降低，但體重未受影響；② 抗生素組合、氨芐青霉素、萬古霉素處理引起葡萄糖耐受的改變；③ 抗生素改變回腸及肝臟中的基因表達(dá)，并改變腸道菌群的α及β多樣性；④ 網(wǎng)絡(luò)分析揭示了Akk菌與空腹血糖及肝臟法尼醇X受體（Fxr）的相關(guān)性，提示腸道細(xì)菌介導(dǎo)葡萄糖代謝的系統(tǒng)性變化的可能機(jī)制；⑤ 單形擬桿菌與肝臟Fxr正相關(guān)，與葡萄糖6-磷酸酶負(fù)相關(guān)。
Antibiotic-induced Alterations in Gut Microbiota are Associated with Changes in Glucose Metabolism in Healthy Mice
2017-11-22 DOI: 10.3389/fmicb.2017.02306
Frontiers in Immunology[IF:6.429]
① 益免疫菌（Immunobiotics）指可有益地調(diào)節(jié)宿主免疫系統(tǒng)的菌株；② 其或可預(yù)防和緩解感染，調(diào)控腸道TLR3的活化，減少局部炎癥組織損傷，調(diào)節(jié)腸道上皮細(xì)胞的免疫轉(zhuǎn)錄應(yīng)答，誘導(dǎo)產(chǎn)生I型干擾素和抗病毒因子，分化調(diào)控細(xì)胞因子、趨化因子和粘附分子；③ 并或可調(diào)控遠(yuǎn)端粘膜免疫應(yīng)答，改善呼吸系統(tǒng)感染預(yù)后，增強(qiáng)抗病毒免疫，防止繼發(fā)性細(xì)菌感染，減輕代謝紊亂嚴(yán)重程度，參與調(diào)控其他系統(tǒng)的炎癥和代謝；④ 其免疫調(diào)控功能具有菌種和菌株特異性。
Immunobiotics-Interactions of Beneficial Microbes with the Immune System
2017-11-17 DOI: 10.3389/fimmu.2017.01580
Nature Communications[IF:12.124]
① 在大腸桿菌的多重耐藥（mar）操縱子中，轉(zhuǎn)錄因子MarR和MarA調(diào)控流出泵和孔蛋白表達(dá)；② 鑒定出廣泛的MAR調(diào)節(jié)因子，PxseA為marA活化的啟動子，marA激活mla調(diào)節(jié)因子的轉(zhuǎn)錄，缺乏marA調(diào)控的xseA的細(xì)胞DNA鏈斷裂；③ 缺乏mlaFEDCB的細(xì)胞，屏障功能缺陷、表面疏水性增強(qiáng)，SoxS和Rob結(jié)合于xseA和mlaFEDCB啟動子；④ MarA激活DNA修復(fù)和脂類運(yùn)輸所需基因的表達(dá)，從而減少抗生素進(jìn)入細(xì)菌及喹諾酮誘導(dǎo)的DNA損傷。
The multiple antibiotic resistance operon of enteric bacteria controls DNA repair and outer membrane integrity
2017-11-13 DOI: 10.1038/s41467-017-01405-7
感謝本期日報的創(chuàng)作者：熱心腸先生，花開，mildbreeze，沈志勛
