今天是第946期日報(bào)。
Science[IF:41.058]
① 結(jié)腸細(xì)胞代謝是調(diào)控腸道穩(wěn)態(tài)的開關(guān)，腸道穩(wěn)態(tài)時結(jié)腸細(xì)胞代謝趨于氧化磷酸化和脂肪酸氧化，耗氧量高；② 由此形成的低氧環(huán)境利于專性厭氧菌生長，它們可降解纖維生成短鏈脂肪酸，進(jìn)而促進(jìn)宿主健康；③ 若結(jié)腸細(xì)胞代謝狀態(tài)改變、腸上皮氧合作用增加，會導(dǎo)致以兼性厭氧菌增殖為特征的菌群失調(diào)；④ 腸道病原體會破壞結(jié)腸細(xì)胞代謝，以逃脫腸道菌群的生態(tài)位保護(hù)作用；⑤ 通過代謝重編程恢復(fù)結(jié)腸細(xì)胞缺氧、維護(hù)結(jié)腸穩(wěn)態(tài)，是治療多種疾病的潛在策略。
Colonocyte metabolism shapes the gut microbiota
11-29, doi: 10.1126/science.aat9076
【主編評語】多種慢性疾病可能與腸道菌群失調(diào)有關(guān)，近期研究表明，結(jié)腸上皮細(xì)胞的代謝狀態(tài)對于菌群的塑造有很大影響。Science本周發(fā)表的綜述對此進(jìn)行探討，提出結(jié)腸細(xì)胞的兩種代謝狀態(tài)（炎癥和穩(wěn)態(tài)）類似于巨噬細(xì)胞的M1和M2極化，恢復(fù)結(jié)腸細(xì)胞缺氧代謝狀態(tài)的治療策略，或能改善腸道菌群失調(diào)和相關(guān)疾病。（@mildbreeze）
Microbiome[IF:9.133]
① 首次構(gòu)建涵蓋7個雞種、全部腸段的雞腸道宏基因集（904萬基因），菌群多樣性及功能與飼養(yǎng)模式、腸段及日齡有關(guān)；② 博落回提取物（MCE）作為促生長抗生素的替代品，主要通過影響前腸菌群，降低宿主炎癥，促進(jìn)肉雞的生長與健康；③ 金霉素（CTC）和MCE分別促進(jìn)鏈霉菌科和乳桿菌屬的生長，但CTC會使抗生素合成通路及耐藥基因增加，而MCE不會；④ 二者都增強(qiáng)菌群次級膽汁酸生成能力，CTC還促進(jìn)脂肪酸合成，而MCE則加強(qiáng)氨基酸與維生素生成途徑。
The chicken gut metagenome and the modulatory effects of plant-derived benzylisoquinoline alkaloids
11-27, doi: 10.1186/s40168-018-0590-5
【主編評語】動物養(yǎng)殖中常用低劑量抗生素促進(jìn)動物生長，但會加劇抗生素耐藥性問題，威脅人類健康，尋找替代抗生素的促生長劑對養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展有重要意義。Microbiome近期發(fā)表了由湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)曾建國、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院樊偉和咼于明合作主導(dǎo)的研究，首次構(gòu)建了涵蓋所有腸段的雞腸道微生物參考基因集，分析了博落回提取物（MCE）對肉雞腸道菌群和生長健康的影響，并與抗生素進(jìn)行對比，揭示了二者促進(jìn)肉雞生長的機(jī)制差異，表明MCE作為抗生素促生長劑的替代品在養(yǎng)殖業(yè)中的應(yīng)用潛力。（@mildbreeze）
Trends in Microbiology[IF:11.776]
① 微生物組研究，尤其是針對低微生物量的樣品，可存在污染問題，主要源于非樣本DNA和樣本間的交叉污染；② RIDE核對清單可幫助研究者、編輯和審稿人科學(xué)評價(jià)菌群研究中的污染問題；③ 采樣和處理過程中要盡量保持環(huán)境與材料的清潔和步驟的統(tǒng)一，嚴(yán)格設(shè)置采樣、DNA提取和非模板擴(kuò)增的陰性和陽性對照；④ 數(shù)據(jù)分析時可采用如下三種策略減少污染的影響：比較對照與生物樣本之間的差異、從生物樣本中剔除陰性對照數(shù)據(jù)、利用模型估測存在的污染。
Contamination in Low Microbial Biomass Microbiome Studies: Issues and Recommendations
11-26, doi: 10.1016/j.tim.2018.11.003
【主編評語】測序技術(shù)的高靈敏度對于低微生物量的菌群研究是一把雙刃劍，檢測樣本微的同時，也放大了樣本中DNA污染的影響。Trends in Microbiology近期發(fā)表觀點(diǎn)文章，對微生物組研究中的污染問題和解決方法進(jìn)行了探討，建議在研究和同行評審時采用RIDE核對清單（報(bào)告研究方法、設(shè)置對照、評估污染情況及其對下游分析的影響），來改善低微生物量研究的準(zhǔn)確性。（@mildbreeze）
Cell Host and Microbe[IF:17.872]
① 抗真菌藥氟康唑誘導(dǎo)腸道真菌失調(diào)，可持續(xù)加劇模型小鼠的過敏性氣道疾?。ˋAD）；② 該作用依賴于腸道真菌群（氟康唑?qū)AD的影響對腸道菌群中無真菌的小鼠無效，而對定殖失調(diào)腸道真菌群的小鼠有效），提示腸道真菌通過腸-肺軸機(jī)制影響肺部免疫；③ 腸道常駐的CX3CR1+單核吞噬細(xì)胞可識別腸道真菌，介導(dǎo)了腸道真菌失調(diào)對外周免疫的影響；④ 減少這種細(xì)胞，或選擇性抑制該細(xì)胞中位于真菌感知下游的脾酪氨酸激酶信號，可緩解模型小鼠的肺部過敏。
Response to Fungal Dysbiosis by Gut-Resident CX3CR1+ Mononuclear Phagocytes Aggravates Allergic Airway Disease
11-29, doi: 10.1016/j.chom.2018.11.003
【主編評語】腸道中的真菌能影響粘膜免疫，但是對于其它器官的影響仍待闡釋。Cell Host and Microbe發(fā)表的最新研究表明，腸道常駐的CX3CR1+單核吞噬細(xì)胞可感知腸道真菌失調(diào)，加劇模型小鼠的過敏性氣道疾病，為腸道真菌影響其它身體部位的免疫，提供了一種機(jī)制。（@mildbreeze）
PLoS Biology[IF:9.163]
① 喜馬拉雅地區(qū)的四個部族生活方式各異，與部族間腸道菌群的差異顯著相關(guān)，但alpha多樣性類似；② 上述傳統(tǒng)部族與美國人的腸道菌群差異大，表明工業(yè)化可能加劇了腸道菌群的差異性，農(nóng)業(yè)化部族的菌群與美國人更相似；③ 與采集文明相關(guān)的菌群，其多樣性在原始部族中較高；④ 半原始部族的菌群結(jié)構(gòu)介于原始和農(nóng)業(yè)部族之間，說明在一個人群世代內(nèi)，腸道菌群類型即可發(fā)生轉(zhuǎn)變；⑤ 飲用水源和烹調(diào)用的固體燃料等環(huán)境因素，與腸道菌群結(jié)構(gòu)顯著相關(guān)。
Gut microbiome transition across a lifestyle gradient in Himalaya
11-15, doi: 10.1371/journal.pbio.2005396
【主編評語】人類腸道菌群結(jié)構(gòu)受現(xiàn)代化水平、生活方式的影響。本論文指出，喜馬拉雅地區(qū)四個農(nóng)業(yè)化程度不同的傳統(tǒng)部族，其腸道菌群結(jié)構(gòu)的差異與生活方式、水源和能源的不同有關(guān)；而且隨著生活方式的轉(zhuǎn)變，腸道菌群類型的轉(zhuǎn)變可在一個人群世代內(nèi)發(fā)生。該結(jié)果對研究人類腸道菌群的影響因素、分析菌群類型轉(zhuǎn)化及其對宿主的影響具有參考價(jià)值。（@小腸君）
American Journal of Clinical Nutrition[IF:6.549]
① 150名肥胖非吸煙者隨機(jī)分為2天/周的間歇能量限制組（ICR）、持續(xù)能量限制組（CCR）和對照組，依次進(jìn)行12周干預(yù)、12周維持和26周后續(xù)跟蹤；② 干預(yù)期后，ICR、CCR和對照組的“自然對數(shù)相對體重”分別減少7.1%、5.2%和3.3%，跟蹤期后減少5.2%、4.9%和1.7%，內(nèi)臟和皮下脂肪體積的變化相似；③ ICR和CCR組中，與肥胖和慢性疾病通路相關(guān)的82種基因表達(dá)、循環(huán)代謝生物標(biāo)志物均無顯著差異；④ ICR與CCR在減重和預(yù)防代謝疾病方面的差異不顯著。
Effects of intermittent and continuous calorie restriction on body weight and metabolism over 50 wk: a randomized controlled trial
11-23, doi: 10.1093/ajcn/nqy196
【主編評語】本研究納入了150名35-65歲肥胖人群，評估了間歇性和持續(xù)性能量限制對于減重、預(yù)防代謝疾病的差異，發(fā)現(xiàn)兩種呢能量限制策略的效果相當(dāng)，沒有顯著差別，說明間歇性能量限制的促健康優(yōu)勢并不顯著，值得參考。（@小腸君）
Neuropsychopharmacology[IF:6.544]
① 長期攝入冰毒（METH）或高熱量飲食（HCD），可影響雌性恒河猴逆向?qū)W習(xí)，使持續(xù)性錯誤增加，破壞柔性決策；② 在未攝入和長期攝入METH或HCD的猴子中，5-羥色胺2C受體（5-HT2CR）激動劑WAY163909均能增加猴子的正確應(yīng)答、減少持續(xù)性錯誤，說明5-HT2CR活化可改善柔性決策；③ 在飲食選擇實(shí)驗(yàn)中，WAY163909減少了猴子對HCD的攝入，但對低熱量飲食無影響；④ 5-HT2CR拮抗劑可阻斷WAY163909的上述作用。
Effects of long-term high-fat food or methamphetamine intake and serotonin 2C receptors on reversal learning in female rhesus macaques
09-06, doi: 10.1038/s41386-018-0200-z
【主編評語】與藥物/毒品成癮相似，人們也可能對高熱量飲食成癮。該研究以恒河猴為模型，研究了長期高熱量飲食和甲基苯丙胺（冰毒）攝入對認(rèn)知行為的影響，發(fā)現(xiàn)通過藥物活化5-羥色胺2C受體，或是改善藥物/毒品/飲食成癮對行為決策不良影響的治療策略。（@mildbreeze）
Clinical Infectious Diseases[IF:9.117]
① 一名有腹主動脈移植病史的病人發(fā)生非主動脈-腸瘺（AEF），表現(xiàn)出反復(fù)高燒和細(xì)菌血癥癥狀等，并非典型癥狀；② 通過上消化道內(nèi)鏡檢查（UGE）和腹部CT增強(qiáng)掃描，發(fā)現(xiàn)腸道移植物穿透了十二指腸的第三部分，從而引起了AEF；③ 從移植物中分離出耐甲氧西林、凝固酶陰性的葡萄球菌和糞腸球菌；④ 抗生素治療6周，停藥兩年后該患者的癥狀沒有復(fù)發(fā)；⑤ 當(dāng)腹主動脈置換病史的患者發(fā)生反復(fù)發(fā)熱，應(yīng)考慮是否為繼發(fā)性AEF，并可通過CT和UGE間接證實(shí)。
Recurrent High Fever due to Intestinal Bacteria-Associated Bacteremia
2017-10-30, doi: 10.1093/cid/cix584
【主編評語】本病歷涉及一名有腹主動脈移植病史病人的反復(fù)高燒癥狀，運(yùn)用了腹部CT增強(qiáng)掃描和上消化道內(nèi)鏡檢查等技術(shù)，輔助發(fā)現(xiàn)了患者的病因是由移植物引起的繼發(fā)性主動脈-腸瘺。該報(bào)告對相關(guān)癥狀的診斷具有一定的參考價(jià)值。（@小腸君）
感謝本期日報(bào)的創(chuàng)作者：米見對，mildbreeze，Echo，MAY DAY，吳芹，夢垚
