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白血病基因診斷

作者簡(jiǎn)介:盧興國,迪安診斷總部血液病實(shí)驗(yàn)室專家,原浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第二醫(yī)院骨髓室負(fù)責(zé)人,國內(nèi)知名形態(tài)學(xué)家,血液腫瘤多學(xué)科整合診斷專家。擔(dān)任第四屆至第九屆中華醫(yī)學(xué)會(huì)檢驗(yàn)分會(huì)全國血液體液學(xué)學(xué)組委員,第三屆中國微循環(huán)學(xué)會(huì)理事及多本雜志的編委等職務(wù)。致力于血液與骨髓細(xì)胞學(xué)和病理學(xué)診斷與研究四十六年,以第一完成人完成“四片聯(lián)檢在血液形態(tài)學(xué)中的臨床應(yīng)用”等獲浙江省科學(xué)技術(shù)獎(jiǎng)進(jìn)步三等獎(jiǎng)4項(xiàng),浙江省高??蒲谐晒泉?jiǎng)1項(xiàng),浙江省醫(yī)藥科技創(chuàng)新二等2項(xiàng)。共發(fā)表論文230余篇,主編專著17本。

基因診斷即分子診斷。通過分子技術(shù)可發(fā)現(xiàn)染色體畸變所累及的基因位置及其表達(dá)產(chǎn)物,檢出細(xì)胞遺傳學(xué)檢查方法不能發(fā)現(xiàn)的異常,還能發(fā)現(xiàn)(尤其是核型正常者)癌基因突變、抑癌基因失活、凋亡基因受抑與DNA-染色質(zhì)空間構(gòu)型改變。一般所述的白血病基因檢查(診斷),包含了四層意義:精細(xì)分類分型(特定類型)、解釋發(fā)病原理、評(píng)估預(yù)后和指導(dǎo)治療。

一、提供細(xì)分特定類型的診斷依據(jù)

在AML和ALL細(xì)分的特定類型(表1和表2)中,需要通過基因檢查確認(rèn)特定的融合基因(包括基因重排后癌基因異位高表達(dá))和染色體異常,提供診斷依據(jù)。如AML的RUNX1-RUNX1T1(FAB分類的M2,少數(shù)為M4、M1)、CBFB-MYH11(M4,少數(shù)為M2等)、PML-RARα(M3)、MLLT3-MLL(M5,少數(shù)為M4)、RBM15-MKL1(M7)、DEK-NUP214(M2、M4),ALL的MLL重排、ETV6-RUNX1、IL3-IGH(癌基因異位高表達(dá))、TCF3-PBX1等(表1、表2)。

表1. AML及相關(guān)前體細(xì)胞腫瘤分類類型(WHO,2017)

表2. 原始淋巴細(xì)胞白血病/淋巴瘤分類(WHO,2017)

(一)FAB分類形態(tài)學(xué)與基因診斷類型的關(guān)系

在FAB形態(tài)學(xué)診斷類型與染色體和基因診斷類型之間的關(guān)系見圖1和圖3。

(二)2017年WHOAML重現(xiàn)性異常類型與特定基因突變類型

2017年WHO修訂的AML伴重現(xiàn)性遺傳學(xué)異常分為AML伴平衡易位或倒位以及AML伴特定基因突變兩大類(圖4)。前者有8個(gè)類型,后者3個(gè)類型(表1)。這組特征是重現(xiàn)性遺傳學(xué)異常,常為一開始便是(原發(fā))AML,分子異常與形態(tài)學(xué)密切相關(guān)。一些急性白血病,遺傳學(xué)檢查核型正常,部分病例融合基因檢查也為正常,但卻檢查出一些與細(xì)胞行為和患者預(yù)后有關(guān)的基因突變。與髓系腫瘤(主要見于AML)有關(guān)的突變除了RUNX1、NPM1和CEBPA外,還有FLT3、KIT、NPM1、RAS、DNMT3A、TET2和IDH1與IDH2等突變。常見的如FLT3基因突變,見于1/3核型正常的AML患者,可以預(yù)示不良預(yù)后;NPM1突變見于50%正常核型AML(核型異常者中只有10%~15%),F(xiàn)AB類型的M4(77%)、M5a(71%)、M5b(90%)都有高突變率,M3、M4Eo和M7則尚未檢出突變;AML1(runt結(jié)構(gòu)域)點(diǎn)突變見于M0和M7等。CEBPA突變約見于9%AML病例,但其中70%為正常核型,預(yù)后良好(圖4)。

(三)AML特定類型的界定

AML伴t(8;21)(q22;q22.1);RUNX1-RUNX1T1被界定為有t(8;21)(q22;q22);RUNX1-RUNX1T1而形態(tài)學(xué)常顯示粒系細(xì)胞成熟特征和臨床預(yù)后良好的AML。融合基因RUNX1-RUNX1T1曾被稱為AML1-MTG8和CBFα-ETO。AML伴inv(16)(p13q22)或t(16;16)(p13;q22);CBFβ-MYH11被界定為有inv(16)(p13q22)或t(16;16)(p13;q22);CBFβ-MYH11并有嗜酸性粒細(xì)胞增多的AML,即多為FAB分類中的AML-M4Eo,常見形態(tài)學(xué)特征為單核細(xì)胞和粒細(xì)胞的成熟以及骨髓存在異常嗜酸性粒細(xì)胞,故也稱為伴異常嗜酸性粒細(xì)胞急性粒單細(xì)胞白血病(acute myelomonocytic leukaemia with abnormal eosinophils,AMML-Eo)。

APL伴PML-RARA被界定為有顆粒過多早幼粒細(xì)胞形態(tài)學(xué)特征以及分子遺傳學(xué)具有PML-RARA融合基因的APL。t(15;17)(q22;q12)易位及其PML-RARA融合基因形成是APL的典型型。這一融合基因還可見于隱蔽易位或復(fù)雜的細(xì)胞遺傳學(xué)重排。WHO(2016)為了強(qiáng)調(diào)該融合基因的意義,將有此融合的APL更名為APL伴PML-RARA。

AML伴t(9;11)(p21.3;q22.3);MLLT3-KMT2A被界定為有t(9;11)(p21.3;q22.3);MLLT3-KMT2A遺傳學(xué)異常特征和常具有單核系、粒單系細(xì)胞形態(tài)學(xué)特征以及臨床預(yù)后常差的AML。在2008版的WHO分類中,本型稱為AML伴t(9;11)(p22;q22);MLLT3-MLL。在2016更新分類中,將(mixed lineage leukemia,MLL)基因更名為賴氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶2A(lysine methyltransferase 2A,KMT2A)基因。

AML伴t(6;9)(p22;q34.1);DEK-NUP214被界定為有t(6;9)(p22;q34.1);DEK-NUP214遺傳學(xué)異常特征,并與伴嗜堿性粒細(xì)胞增多和病態(tài)造血的M2與M4有一定關(guān)聯(lián),且臨床預(yù)后常差的一種獨(dú)立病種。  

AML伴inv(3)(q21.3q26.2)或t(3;3)(q21.3;q26.2);GATA2,MECOM,在2008版WHO分類中為AML伴inv(3)(p21q26.2)或t(3;3)(q21;q26.2);RPN1-EVI1,由于RPN1-EVI1并非融合基因,而是遠(yuǎn)端的GATA2增強(qiáng)子重新定位而激活MECOM(EVI1)基因表達(dá),同時(shí)使GATA2基因單倍不足。因此,在2016年WHO分類中更名為AML伴inv(3)(q21.3q26.2)或t(3;3)(q21.3;q26.2);GATA2,MECOM。

AML(原始巨核細(xì)胞)伴t(1;22)(p13.3;q13.3);RBM15-MKL1 AML伴t(1;22)(p13;q13);RBM15-MKL1類型見于無唐氏綜合征的嬰兒AML,肝脾腫大明顯,預(yù)后較差。外周血和骨髓中白血病細(xì)胞具有原始巨核細(xì)胞的形態(tài)特點(diǎn),MPO和SBB陰性,CD41、CD61和CD42陽性。部分患者伴骨髓纖維化,且原始細(xì)胞可不見明顯增高??杀憩F(xiàn)為軟組織腫塊(髓系肉瘤),類似其他藍(lán)色圓形小細(xì)胞腫瘤。

AML伴BCR-ABL1 AML伴BCR-ABL1是新增的伴重現(xiàn)性遺傳學(xué)異常的臨時(shí)病種,為罕見的原發(fā)類型,可以受益于酪氨酸激酶抑制劑治療?;颊咂⒛[大和嗜堿性粒細(xì)胞增多較CML急變者少見,細(xì)胞增生性也略低些。本型AML需要與CML急變相鑒別,IKZF1和(或)CDKN2A缺失和IGH、TCR基因內(nèi)隱蔽的缺失,可以支持原發(fā)AML的診斷而非CML急變期。

(四)ALL特定類型與FAB形態(tài)學(xué)

原始淋巴細(xì)胞白血?。ˋLL)/淋巴瘤,WHO分類中,將前B淋巴細(xì)胞(B 原始淋巴細(xì)胞)腫瘤和前T淋巴細(xì)胞(T原始淋巴細(xì)胞)腫瘤一起歸類為原始淋巴細(xì)胞腫瘤類型。

原始淋巴細(xì)胞腫瘤有3個(gè)類型,見表2。B原始淋巴細(xì)胞白血病/淋巴瘤又有兩個(gè)類型:不另作特定分類型(NOS)和細(xì)分的特定類型(伴重現(xiàn)性遺傳學(xué)異常類型)。B原始淋巴細(xì)胞白血病/淋巴瘤,NOS,為伴重現(xiàn)性遺傳學(xué)異常外的B系A(chǔ)LL/淋巴瘤,形態(tài)學(xué)為基本診斷,免疫表型為B、T系列確認(rèn)檢查,但不需要免疫表型的進(jìn)一步細(xì)分。B原始淋巴細(xì)胞白血病/淋巴瘤伴重現(xiàn)性遺傳學(xué)異常類型,在形態(tài)學(xué)和免疫表型檢查的基礎(chǔ)上,需要遺傳學(xué)和(或)基因檢查進(jìn)行細(xì)分的特定類型診斷(表2和圖5)。

在急性白血病中還有更多的細(xì)胞遺傳學(xué)與分子異常(基因表型,包括融合基因與重排后癌基因異位高表達(dá)),由于用于疾病定義的價(jià)值,或異常特征的特異性或公認(rèn)性,均未被WHO用于特定類型分型中,僅供參考和研究。這些形態(tài)學(xué)、遺傳學(xué)與分子學(xué)的表型有FAB分類M0、M2的[t(10;11)(p13;q14);CAML-AFIO]、M5的[t(8;16)(p11;p13);MOZ-CBP]等。

圖1. AML-M1和M2(FAB)及細(xì)分特定類型(WHO)的診斷          

ANC為有核細(xì)胞分類,NEC為非紅系細(xì)胞分類,AML1-MTG8又稱RUNX1-RUNX1T1;分類出特定類型(較少)后的為AML,NOS(較多);*有典型形態(tài)學(xué)特征者可以提示相應(yīng)的遺傳學(xué)和基因異常

圖2. AML-M4和M5(FAB)及細(xì)分特定類型(WHO)的診斷

*有典型形態(tài)學(xué)特征者可以預(yù)示相應(yīng)的遺傳學(xué)和基因異常;**為單核系細(xì)胞分類

圖3. 急性早幼粒細(xì)胞白血病(FAB)及細(xì)分類型(WHO)對(duì)維A酸的敏感性

*有典型形態(tài)學(xué)特征(密集顆粒、棒狀A(yù)uer小體和胞體胞核改變?cè)缬琢<?xì)胞)可以預(yù)示相應(yīng)的遺傳學(xué)和基因異常

圖4. AML伴重現(xiàn)性遺傳學(xué)異常類型與形態(tài)學(xué)類型的關(guān)系

紅線示兩者強(qiáng)相關(guān),黑線和綠線示該重現(xiàn)性遺傳學(xué)異常常見于和少見于對(duì)應(yīng)的形態(tài)學(xué)類型。黃色長(zhǎng)方形中的類型為重現(xiàn)性遺傳學(xué)異常。圓角矩形中類型表示形態(tài)學(xué)診斷的基本類型;綠色者與一種伴重現(xiàn)性遺傳學(xué)異常強(qiáng)相關(guān),無相應(yīng)的非特定類型(見表1)。*示該類型白血病原始細(xì)胞可低于20%。

圖5. ALL(FAB)和細(xì)分的特定類型(WHO)診斷

*典型形態(tài)學(xué)特征者可以提示免疫表型和細(xì)胞遺傳學(xué)與基因異常

二、解釋發(fā)病原理

對(duì)白血病等造血和淋巴組織腫瘤發(fā)病機(jī)制(分子病理)的深入了解,諸如慢性淋巴細(xì)胞白血?。–LL)、慢性粒細(xì)胞白血?。–ML)和真性紅細(xì)胞增多癥(PV),在血液和骨髓中的異常細(xì)胞均有凋亡途徑障礙所致的蓄積性機(jī)制參與;MDS和MA則是存在細(xì)胞凋亡過多的疾病。在細(xì)胞通迅和識(shí)別等應(yīng)答中的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)(signal transduction)失控而引起的細(xì)胞增殖、細(xì)胞骨架重排和轉(zhuǎn)化、細(xì)胞凋亡障礙是促發(fā)白血病等造血和淋巴組織腫瘤發(fā)生的又一原理,如慢性粒細(xì)胞白血病被認(rèn)為是致癌性BCR-ABL融合蛋白(非受體型酪氨酸激酶)使底物酪氨酸殘基持續(xù)磷酸化,使核內(nèi)靶基因轉(zhuǎn)錄增強(qiáng)而促發(fā);細(xì)胞凋亡理論指導(dǎo)的實(shí)踐又讓我們認(rèn)識(shí)一些造血和淋巴組織腫瘤(如Burkitt細(xì)胞白血病,即FAB分類的ALL-L3)高增殖和高凋亡的細(xì)胞學(xué)特征以及腫瘤性凋亡細(xì)胞的形態(tài);受體型酪氨酸激酶癌性蛋白(如原癌基因KIT突變和FIT3突變)均可經(jīng)細(xì)胞膜受體使下游信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑持續(xù)激活而促發(fā)造血和淋巴組織腫瘤;細(xì)胞因子介導(dǎo)的細(xì)胞內(nèi)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)異常,如細(xì)胞膜受體對(duì)粒細(xì)胞巨噬細(xì)胞集落刺激因子(granulocyte-macrophage colony stimulating factor,GM-CSF)特別敏感,持續(xù)激活RAS-MAPK和JAK-STAT信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑被認(rèn)為是促發(fā)幼年型慢性粒單細(xì)胞白血病的分子病理。又如急性白血病發(fā)生的分子病理,除了基因突變外,有兩個(gè)分子類型(圖6):融合基因型(fusion gene type)和轉(zhuǎn)錄調(diào)控異常型(transcriptional disregulation type)。AML的發(fā)生,多是染色體易位、基因重排導(dǎo)致癌基因與易位處的某個(gè)基因形成融合基因,抑制了正常調(diào)控的靶基因功能而導(dǎo)致細(xì)胞增殖失控、分化成熟和凋亡障礙,涉及這組原癌基因(proto-oncogene)與伙伴基因(partner gene)形成的融合基因有AML1-ETO(AML-M2)、PML-RARα(AML-M3)、CBFβ-MYH11(AML-M4)、DEK-CAN(AML-M2、AML-M4)、MLL-AF9等;而ALL的發(fā)生則多是染色體易位、基因重排導(dǎo)致原本處于相對(duì)靜止?fàn)顟B(tài)的原癌基因激活而過度表達(dá)(癌基因異位高表達(dá)),使細(xì)胞失控而增殖和轉(zhuǎn)化,涉及這組原癌基因有MYC(ALL-L3)、TAL1、LYL1、TTG1和TCL3(T-ALL)等。

圖6. 染色體易位基因異常的兩個(gè)主要類型與急性白血病的發(fā)生

白血病中,基因產(chǎn)物高表達(dá)是分子病理的一個(gè)形式,對(duì)于預(yù)后和診斷也有參考意義。常見擴(kuò)增基因有MYC、BAALC、MN1、ERG、WT1、TAL、TTG、TAN、LYL等。APL、ALL-L3和CML急變等,都可見MYC基因擴(kuò)增,與細(xì)胞高周轉(zhuǎn)相一致。ALL(T系)的TAL、TTG、TAN、LYL等都是染色體易位基因并置時(shí),原癌基因被激活而在異位的高表達(dá),是白血病/淋巴瘤的促發(fā)因素。

三、評(píng)估預(yù)后

預(yù)后方面評(píng)判。在診斷時(shí),遺傳學(xué)所見是除了年齡因素外評(píng)判治療反應(yīng)性、復(fù)發(fā)危險(xiǎn)性和總生存率的最重要指標(biāo)。遺傳學(xué)分析習(xí)慣于根據(jù)對(duì)治療的不同反應(yīng)把患者分成不同危險(xiǎn)組。例如,對(duì)于核心結(jié)合因子突變的預(yù)后良好組患者,用大劑量阿糖胞苷鞏固后最有可能獲得長(zhǎng)期緩解;而不良預(yù)后的細(xì)胞遺傳學(xué)患者對(duì)這一治療無效。約40%~50%患者診斷時(shí)為正常核型,屬于異質(zhì)性的中危組。AML細(xì)胞遺傳學(xué)和分子學(xué)改變進(jìn)行預(yù)后危險(xiǎn)度判定見表3和表4。

表3. 細(xì)胞遺傳學(xué)正常AML中發(fā)現(xiàn)的預(yù)后關(guān)聯(lián)基因突變

表4. 急性髓細(xì)胞白血病患者預(yù)后危險(xiǎn)度分級(jí)

四、指導(dǎo)治療

在臨床上,血液腫瘤分子學(xué)的應(yīng)用還在于治療上的指導(dǎo)意義,提供最直接的分子靶向治療(molecularly target-based therapy,molecularly targeted therapy)的依據(jù),譬如1996年開發(fā)的競(jìng)爭(zhēng)性抑制BCR-ABL1等非受體型酪酸激酶活性癌性蛋白與ATP的結(jié)合,封閉底物酪氨酸殘基磷酸化的STI571(Imatinib,Glivec),以及新的靶向藥物酪氨酸激酶抑制劑——Rydapt(midostaurin)治療伴FLT3-ITD的AML,都具有劃時(shí)代意義的代表性靶向藥物;組蛋白脫乙?;福╤istone deacetylase)與AML1-ETO(RUNX1-RUNX1T1)、PML-RARα等組成的復(fù)合物參與白血病的形成,為另一類白血病的分子病理,即組蛋白的乙?;╤istone acetylation)與脫乙?;瘜W(xué)修飾過程,開發(fā)的組蛋白脫乙?;敢种苿┩ㄟ^促進(jìn)組蛋白乙酰化激活轉(zhuǎn)錄而抑制白血病的增殖、誘導(dǎo)細(xì)胞成熟和凋亡(圖7)。如在Ph陽性ALL的一線治療方案中,聯(lián)合酪氨酸激酶抑制劑(tyrosine kinase inhibitor,TKI)如伊馬替尼和達(dá)沙替尼已成為標(biāo)準(zhǔn)治療。然而,TKI治療耐藥的出現(xiàn)是原發(fā)難治性或含TKI方案初始治療后復(fù)發(fā)的病人的挑戰(zhàn)。有些伊馬替尼耐藥ABL突變對(duì)新的TKI不敏感,如達(dá)沙替尼對(duì)包含ABL T315I、V299L和F317L突變的細(xì)胞沒有活性,因此需要用分子學(xué)技術(shù)鑒別出可能對(duì)治療耐藥的ABL突變。

圖7. 抗腫瘤新藥的分子靶位點(diǎn)

金黃色背景方框內(nèi)為靶向藥物,綠色橢圓形表示各種信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)分子;HDAC為組蛋白去乙酰化酶;DNMT為DNA甲基轉(zhuǎn)移酶

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