單細(xì)胞測(cè)序在腫瘤、發(fā)育生物學(xué)、免疫學(xué)、神經(jīng)科學(xué)、大規(guī)模細(xì)胞圖譜構(gòu)建、細(xì)胞亞群細(xì)化&稀有細(xì)胞類型鑒定等領(lǐng)域有重要應(yīng)用，是目前研究的焦點(diǎn)。
腫瘤
2019.10.7
研究小組使用類器官技術(shù)和單細(xì)胞RNA測(cè)序研究膀胱癌
西班牙國(guó)家癌癥研究中心（CNIO）的帕科·雷爾（Paco Real）領(lǐng)導(dǎo)的上皮癌變研究小組的科學(xué)家已經(jīng)使用創(chuàng)新的類器官技術(shù)來實(shí)現(xiàn)小鼠尿路上皮細(xì)胞穩(wěn)定，長(zhǎng)期培養(yǎng)。隨后，他們通過對(duì)單個(gè)細(xì)胞的RNA進(jìn)行測(cè)序來表征類器官，并鑒定出少量的干細(xì)胞（增殖細(xì)胞），這些細(xì)胞產(chǎn)生了類器官，目前尚無法研究。這將開創(chuàng)泌尿系統(tǒng)疾病研究的新紀(jì)元。該研究發(fā)表在《自然通訊》雜志上。
DOI：10.1038 / s41467-019-12307-1
2018.11.30
研究人員使用優(yōu)化的單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序來更好地了解結(jié)腸癌腫瘤的異質(zhì)性
與中國(guó)多個(gè)機(jī)構(gòu)有聯(lián)系的一組研究人員發(fā)現(xiàn)，使用優(yōu)化的單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序可以更好地揭示結(jié)腸癌腫瘤的異質(zhì)性。該小組在《科學(xué)》雜志上發(fā)表的論文中描述了他們了解結(jié)直腸癌進(jìn)展的獨(dú)特方法。
研究人員指出，大多數(shù)大腸癌進(jìn)展的遺傳研究都涉及基因表達(dá)。他們建議需要更多的研究來了解結(jié)直腸腫瘤如何轉(zhuǎn)移。為此，他們開發(fā)了一種測(cè)序方法，可同時(shí)分析單個(gè)細(xì)胞中的拷貝數(shù)變異，甲基化和基因表達(dá)-該方法將單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)與來自染色體構(gòu)象，表觀遺傳數(shù)據(jù)和腫瘤細(xì)胞其他特征的信息結(jié)合在一起。
DOI：10.1126 / science.aao3791
2018.11.28
單細(xì)胞測(cè)序揭示了為什么癌癥會(huì)在特定細(xì)胞類型中形成
一項(xiàng)稱為單細(xì)胞RNA測(cè)序的革命性新技術(shù)使研究人員能夠研究單個(gè)細(xì)胞中的基因表達(dá)，從而消除了污染的細(xì)胞樣品和取平均值的問題。伊利諾伊大學(xué)芝加哥分校的研究人員組裝了一個(gè)Drop-seq儀器，以分離發(fā)育中的果蠅的眼睛細(xì)胞，實(shí)驗(yàn)室將其用作模型系統(tǒng)。然后，他們能夠研究眼睛中成千上萬個(gè)不同細(xì)胞中RB基因突變引起的基因表達(dá)變化，而不是具有正常RB基因拷貝的細(xì)胞中的基因表達(dá)。他們的結(jié)果發(fā)表在《自然通訊》上。這是一項(xiàng)真正的革命性技術(shù)，有望為癌癥的起源以及某些癌癥為何起源于某些細(xì)胞類型而非其他癌癥提供新的認(rèn)識(shí)。
DOI：10.1038 / s41467-018-07540-z
2018.11.28
單細(xì)胞測(cè)序揭示了為什么特定細(xì)胞類型會(huì)形成癌癥
一項(xiàng)稱為單細(xì)胞RNA測(cè)序的革命性新技術(shù)使研究人員能夠研究單個(gè)細(xì)胞中的基因表達(dá)，從而消除了污染的細(xì)胞樣品和取平均值的問題。Frolov的實(shí)驗(yàn)室采用了一種稱為Drop-seq的技術(shù)，該技術(shù)可使研究人員分離單細(xì)胞并對(duì)其進(jìn)行基因測(cè)序。Drop-seq可以同時(shí)對(duì)數(shù)千個(gè)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行測(cè)序。他們的結(jié)果發(fā)表在《自然通訊》上。
DOI：10.1038 / s41467-018-07540-z
2017.3.30
單細(xì)胞RNA測(cè)序揭示兩種主要類型腦腫瘤的詳細(xì)組成
對(duì)兩種腦腫瘤亞型的詳細(xì)分析顯示，它們可能起源于相同類型的神經(jīng)祖細(xì)胞，并通過基因突變模式和其微環(huán)境的組成加以區(qū)分。由麻省總醫(yī)院（MGH）和麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)博德研究所的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的一項(xiàng)研究結(jié)果將于3月31日出版的《科學(xué)》雜志上發(fā)表。
DOI：10.1126 / science.aai8478
發(fā)育生物學(xué)
2020.5.13
深入了解腸道激素
干細(xì)胞與發(fā)育生物學(xué)研究所的研究人員對(duì)腸道中產(chǎn)生人類激素的細(xì)胞進(jìn)行了深入的描述。結(jié)果發(fā)表在科學(xué)雜志《細(xì)胞》上在5月13日。研究人員開發(fā)了一個(gè)廣泛的工具箱，可以研究實(shí)驗(yàn)室中生長(zhǎng)的稱為類器官的小腸內(nèi)人類激素產(chǎn)生細(xì)胞。這些發(fā)現(xiàn)為治療2型糖尿病和肥胖癥等疾病提供了潛在的新途徑。研究人員首次使用稱為單細(xì)胞測(cè)序的技術(shù)描述了在不同類型的人類腸內(nèi)分泌細(xì)胞中有活性的所有基因?；谶@些數(shù)據(jù)，他們創(chuàng)建了迄今為止對(duì)人類腸內(nèi)分泌細(xì)胞不同亞型最深刻見解的地圖集。該圖集揭示了對(duì)腸內(nèi)分泌細(xì)胞功能至關(guān)重要的基因的活性。
DOI：10.1016 / j.cell.2020.04.036
2019.8.22
研究人員使用單細(xì)胞測(cè)序來更好地了解人類胚胎植入
中國(guó)多個(gè)機(jī)構(gòu)的一組研究人員使用單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)來了解子宮植入過程中有關(guān)人類胚胎的更多信息。該小組在《自然》雜志上發(fā)表的論文中描述了從植入前，植入中和植入后對(duì)數(shù)千個(gè)人類胚胎細(xì)胞進(jìn)行測(cè)序的過程，以及他們從中學(xué)到的知識(shí)。
DOI：10.1038 / s41586-019-1500-0
神經(jīng)科學(xué)
2018.6.29
使用新的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)揭示復(fù)雜的大腦回路
希望之城的子公司轉(zhuǎn)化基因組學(xué)研究所的研究人員與硅谷的一家名為Circuit Therapeutics Inc.的初創(chuàng)公司結(jié)合在一起，在大腦內(nèi)部深深地觀察了一種稱為紋狀體的結(jié)構(gòu)，該結(jié)構(gòu)負(fù)責(zé)控制人的運(yùn)動(dòng)方式，但也有助于大腦的決策和動(dòng)作的啟動(dòng)。通過使用單細(xì)胞RNA測(cè)序，該小組重新定義了對(duì)MSN細(xì)胞工作方式的先前了解，并將其添加到先前使用較舊技術(shù)通過研究大量紋狀體組織分析基因表達(dá)而發(fā)現(xiàn)的MSN標(biāo)記基因列表中。該研究發(fā)表在《細(xì)胞神經(jīng)科學(xué)前沿》雜志中。
DOI：10.3389 / fncel.2018.00159
免疫學(xué)
2017.3.30
研究人員使用單細(xì)胞測(cè)序來了解細(xì)胞如何老化
歐洲生物信息學(xué)研究所（EMBL-EBI），劍橋大學(xué)，惠康信托基金會(huì)桑格研究所和英國(guó)癌癥研究中心英國(guó)劍橋研究所（CRUK-CI）的研究人員闡明了關(guān)于免疫系統(tǒng)為什么會(huì)隨著年齡增長(zhǎng)而減弱的長(zhǎng)期爭(zhēng)論。他們的發(fā)現(xiàn)發(fā)表在《科學(xué)》（Science）雜志上，表明與較年輕的免疫細(xì)胞相比，較老的組織中的免疫細(xì)胞缺乏協(xié)調(diào)性，并且基因表達(dá)的變異性更大?？鐚W(xué)科研究為更深入探索不同類型細(xì)胞衰老的機(jī)制鋪平了道路。它還說明了單細(xì)胞測(cè)序的潛力，可以使人們對(duì)細(xì)胞的發(fā)育和活性有更深入的了解。
DOI: 10.1126/science.aah4115
2016.3.7
免疫學(xué)符合單細(xì)胞測(cè)序
惠康基因組園區(qū)單細(xì)胞基因組學(xué)中心的研究可能會(huì)改變我們看待基因表達(dá)和免疫反應(yīng)的方式。新方法TraCeR 在《自然方法》上發(fā)表，為研究免疫應(yīng)答、疫苗接種、癌癥和自身免疫性提供了強(qiáng)大的工具。
DOI：10.1038 / nmeth.3800
2016.2.15
通過單細(xì)胞RNA測(cè)序發(fā)現(xiàn)了ILC免疫細(xì)胞的新亞組
在發(fā)表于“ 自然免疫學(xué) ”雜志上的一項(xiàng)新研究中，對(duì)相對(duì)新發(fā)現(xiàn)的一組稱為ILC的免疫細(xì)胞進(jìn)行了詳細(xì)的研究。通過分析單個(gè)扁桃體細(xì)胞中的基因表達(dá)，瑞典Karolinska研究所的科學(xué)家發(fā)現(xiàn)了三個(gè)以前未知的ILC亞組，并揭示了這些細(xì)胞如何在人體中發(fā)揮作用。
DOI：10.1038 / ni.3368
大規(guī)模細(xì)胞圖譜構(gòu)建
2016.11.10
單細(xì)胞測(cè)序?qū)φ诎l(fā)育的小鼠心臟進(jìn)行普查
哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院領(lǐng)導(dǎo)的研究人員從小鼠胚胎發(fā)育的七個(gè)不同階段對(duì)心臟細(xì)胞進(jìn)行了采樣。他們使用最新的單細(xì)胞RNA測(cè)序技術(shù)，將細(xì)胞分為三個(gè)已知類別：心肌細(xì)胞或心肌細(xì)胞；形成血管的內(nèi)皮細(xì)胞；和成纖維細(xì)胞將一切結(jié)合在一起-并觀察其遺傳活性隨時(shí)間變化。該結(jié)果發(fā)表在《發(fā)育細(xì)胞》上，有助于闡明每個(gè)時(shí)間段心臟各部分中存在哪些細(xì)胞類型，并揭示先前未知的細(xì)胞類型。研究人員還描述了具有導(dǎo)致人類先天性心臟缺陷的基因突變的小鼠中特定細(xì)胞類型的錯(cuò)誤。
DOI：10.1016 / j.devcel.2016.10.001
細(xì)胞亞型細(xì)化
2018.7.18
單細(xì)胞RNA測(cè)序產(chǎn)生新的視網(wǎng)膜神經(jīng)節(jié)細(xì)胞亞型
康涅狄格大學(xué)健康中心（UConn Health）和杰克遜實(shí)驗(yàn)室（JAX）的研究人員已經(jīng)鑒定出40種亞型的視網(wǎng)膜神經(jīng)節(jié)細(xì)胞（RGC）以及區(qū)分它們的遺傳標(biāo)記和轉(zhuǎn)錄因子。他們的研究發(fā)表在《自然通訊》上，為生物學(xué)中的一個(gè)大問題提供了新的精確度：什么構(gòu)成細(xì)胞類型或亞型？
DOI：10.1038 / s41467-018-05134-3
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