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IPP秒殺Image J:一款高級(jí)的圖像分析工具介紹

校正圖片的光密度

1.校正圖片的光密度

2.新建一個(gè)新的校正參數(shù)

3.單擊image后,出現(xiàn)彈窗后,鼠標(biāo)單擊圖片空白處背景(一般數(shù)值應(yīng)該在230左右),點(diǎn)擊ok。

4.命名,然后點(diǎn)擊system。

測(cè)量參數(shù)的設(shè)置

1.下圖第3步,除了選中IOD,應(yīng)同時(shí)選上area(左側(cè)選上area,IOD即可),通過調(diào)節(jié)area的范圍,分析時(shí)可以很好的剔除面積很小的點(diǎn)(一般IOD的范圍不用改變)。

2.option 選項(xiàng)需要設(shè)置的有輪廓樣式(根據(jù)圖片選擇),是否剔除邊界的染色(一般選擇none),以上設(shè)置好后,點(diǎn)擊ok。

3.下圖第5步選中后,直接鼠標(biāo)點(diǎn)擊染色部位(我一般從深到淺)至染色部分全部選中。按照步驟保存好方法后,點(diǎn)擊close 然后直接點(diǎn)count。

1. 保存好設(shè)置好的方法后,接下來,按照前面的步驟,直接file→load file剛才保存的方法進(jìn)行count就行了。

2.查看分析結(jié)果、導(dǎo)出結(jié)果。(點(diǎn)擊view-statistics就能出現(xiàn)結(jié)果)

注:

(1)點(diǎn)擊file后可出現(xiàn)數(shù)據(jù)結(jié)果導(dǎo)出路徑;

(2)如果分析的組織是占滿整個(gè)圖片,直接看總的IOD值就行了。若不是,我們還應(yīng)計(jì)算目標(biāo)的面積,然后用IOD/area,這樣得到的結(jié)果才更加的準(zhǔn)確。

Tips

1. 拍攝時(shí),光源亮度、曝光時(shí)間應(yīng)一致(不要使用自動(dòng)曝光)。

2. 拍照前,應(yīng)在空白背景處進(jìn)行白平衡校正。(個(gè)人觀點(diǎn):拍照時(shí)盡量讓照片整體亮一點(diǎn),每次我顯微鏡的專業(yè)軟件拍完照片后,覺得挺好的,但是放PPT上或分析時(shí)一看整體有點(diǎn)暗。)

3. 專業(yè)相機(jī)拍照時(shí),應(yīng)保存TIFF格式(TIFF是一種靈活的位圖格式)。

image-Pro plus(IPP)是一種專業(yè)的圖像分析軟件

IPP能隨意對(duì)圖象切割、測(cè)量、計(jì)數(shù)、分類(材料學(xué)粒子粒徑測(cè)量,生物學(xué)細(xì)胞或組織大小測(cè)量等);HE等染色方法的陽性灰度、陽性比例計(jì)算;簡單電泳條帶分析;熒光強(qiáng)度分析等??梢赃x擇面積、周長、角度等50多種測(cè)量方式。

圖像分析方面:

IPP能夠熒光共位性分析;空間和灰度校對(duì);將測(cè)量結(jié)果以統(tǒng)計(jì)值、單個(gè)測(cè)量值、三維濃度圖和線形等方式輸出,并可以將測(cè)量結(jié)果輸出到EXCEL中處理。

而上文提到的免疫組化結(jié)果處理僅是其眾多應(yīng)用中的一種,希望大家可以充分的利用這個(gè)工具,更好地處理自己的科研結(jié)果。

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