“健康”微生物組的多態(tài)多元性（綜述）

Gastroenterology——[17.373]

① 微生物組即在機(jī)體中共生菌群基因信息的集合，含細(xì)菌、病毒和真菌。其“健康”的定義受環(huán)境、飲食及生活方式等因素影響；② 定義“健康”微生物組就要正確分類(lèi)、找出核心菌群并采用離群值細(xì)化范疇；③ 如以社會(huì)工業(yè)化程度、非傳播性慢性疾病風(fēng)險(xiǎn)作為指標(biāo)界定工業(yè)化、非工業(yè)化菌群；④ 微生物組具功能冗余性，采用保守的功能性定義如代謝更能區(qū)分常態(tài)、非常態(tài)；⑤ 還需關(guān)注菌種特異性、生物節(jié)律、微生物組在人生進(jìn)程中的進(jìn)化等重要參數(shù)。

【主編評(píng)語(yǔ)】

從2008年人類(lèi)微生物組工程（HMP）開(kāi)啟至今，我們對(duì)微生物的認(rèn)知越來(lái)越廣泛也越來(lái)越深化。在繼續(xù)推進(jìn)微生物診斷、微生物療法向臨床轉(zhuǎn)化前，應(yīng)該更準(zhǔn)確的給出什么才是健康腸道微生物組的定義。Gastroenterology發(fā)表的綜述對(duì)此進(jìn)行了探討。顯然“健康”微生物組是一個(gè)受多因素影響、多態(tài)多元的概念。不同群體都需建立相應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)參。在這十多年的研究中，我們獲得了很多已知，但還有更多已知的未知，和未知的未知需要探索。其中一個(gè)大方向在最近幾篇綜述中均有提及，即腸道研究從菌群組成轉(zhuǎn)向菌群功能性分類(lèi)。（@好雨）

【原文信息】

The Healthy Microbiome (What is the definition of a healthy gut microbiome?)

2020-11-26, doi: 10.1053/j.gastro.2020.09.057

一文讀懂IBD與菌群的密切關(guān)聯(lián)（綜述）

Gastroenterology——[17.373]

① 無(wú)菌條件下IBD不易感，反之IBD患者腸道菌群多樣性下降、厚壁菌門(mén)減少、變形桿菌增多，表明其菌群基礎(chǔ)；② 菌群失調(diào)也包括真菌、噬菌體及古細(xì)菌，除了區(qū)分類(lèi)群更應(yīng)注重菌群的功能性變化；③ 菌群失調(diào)誘發(fā)因素：遺傳、免疫、膳食、代謝產(chǎn)物如膽酸鹽、腸道屏障完整性及嬰幼兒時(shí)期的環(huán)境擾動(dòng)；④ IBD由共生致病菌引起或關(guān)鍵共生菌減少，特別是其重要功能無(wú)法維系；⑤ 治療包括手術(shù)、藥物、益生素、益生菌、糞菌移植等，以及新興的后生元。

【主編評(píng)語(yǔ)】

Gastroenterology發(fā)表的綜述，詳細(xì)討論了IBD背后的腸道菌群基礎(chǔ)，總結(jié)看來(lái)答案并不或從不唯一。文章內(nèi)容十分全面，意在為相關(guān)流行病學(xué)、發(fā)病機(jī)理、及致病因素的分析提供一個(gè)概念框架。特別值得注意的是，文章反復(fù)提出對(duì)于IBD菌群失調(diào)和開(kāi)發(fā)相應(yīng)治療手段，更應(yīng)關(guān)注功能類(lèi)群而非個(gè)別菌種。（@好雨）

【原文信息】

Inflammatory Bowel Diseases (IBD) (Inflammatory Bowel Diseases and the Microbiome: Searching the Crime Scene for Clues)

2020-11-26, doi: 10.1053/j.gastro.2020.09.056

腸道菌群調(diào)控體重、脂質(zhì)代謝及胰島素敏感性的機(jī)制

Gastroenterology——[17.373]

① 腸道菌群通過(guò)調(diào)節(jié)能量的提取、處理及貯存、白色脂肪組織褐變、代謝產(chǎn)生吲哚調(diào)節(jié)microRNA等方式調(diào)控體重；② 腸道菌群可通過(guò)膽汁酸、短鏈脂肪酸等代謝產(chǎn)物以影響脂質(zhì)的吸收與清除，從而調(diào)控脂質(zhì)代謝；③ 腸道菌群衍生的代謝產(chǎn)物，包括丙酸咪唑、色氨酸衍生代謝產(chǎn)物、吲哚、犬尿氨酸、5-羥色胺、支鏈氨基酸、短鏈脂肪酸可影響胰島素抵抗；④ 靶向調(diào)控腸道菌群及其代謝產(chǎn)物、限制熱量攝入、間歇性禁食等手段可改善代謝。

【主編評(píng)語(yǔ)】

腸道菌群的變化與肥胖及2型糖尿病相關(guān)。來(lái)自Gastroenterology上發(fā)表的一篇綜述文章，詳細(xì)介紹了腸道菌群調(diào)控體重、脂質(zhì)代謝及胰島素抵抗的機(jī)制，并討論了通過(guò)靶向調(diào)控菌群、飲食干預(yù)等方式改善代謝疾病的可能。（@szx）

【原文信息】

Metabolism and Metabolic Disorders and the Microbiome: The intestinal microbiota associated with obesity, lipid metabolism and metabolic health: pathophysiology and therapeutic strategies

2020-11-26, doi: 10.1053/j.gastro.2020.10.057

菌群對(duì)腫瘤發(fā)展、抗腫瘤免疫及腫瘤免疫治療的影響（綜述）

Gastroenterology——[17.373]

① 幽門(mén)螺桿菌釋放CagA、VacA等毒力因子引起胃上皮細(xì)胞的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激、自噬及氧化應(yīng)激，以促進(jìn)胃癌發(fā)展；② 具核梭桿菌通過(guò)毒力因子FadA上調(diào)原癌基因表達(dá)等機(jī)制促進(jìn)結(jié)直腸癌；③ 次級(jí)膽汁酸、LPS等腸道菌群代謝產(chǎn)物進(jìn)入肝臟，促進(jìn)肝癌發(fā)展及免疫逃逸；④ 腸道菌群通過(guò)多種方式影響抗腫瘤免疫應(yīng)答及腫瘤治療：瘤內(nèi)細(xì)菌對(duì)藥物的修飾、細(xì)菌代謝產(chǎn)物及MAMP對(duì)抗原呈遞細(xì)胞的激活/脫敏、誘導(dǎo)T細(xì)胞對(duì)腫瘤抗原的交叉應(yīng)答、誘導(dǎo)免疫細(xì)胞的抑制性表型等。

【主編評(píng)語(yǔ)】

來(lái)自Gastroenterology上發(fā)表的一篇綜述文章，詳細(xì)介紹了在結(jié)直腸癌、肝癌、胃癌及胰腺癌等癌癥中，腸道菌群對(duì)腫瘤發(fā)生發(fā)展、局部及全身的抗腫瘤免疫應(yīng)答、PD-1單抗及CTLA-4單抗等腫瘤免疫治療的調(diào)控機(jī)制。（@szx）

【原文信息】

Cancer and the Microbiome: Influence of the commensal microbiota on cancer, immune responses, and immunotherapy

2020-11-27, doi: 10.1053/j.gastro.2020.11.041

腸道菌群與慢性肝病綜合管理（綜述）

Gastroenterology——[17.373]

① 腸道菌群失調(diào)是所有慢性肝?。–LD）共有特征，菌群隨病程（前期-進(jìn)展-惡化）變化并起重要作用；② 無(wú)菌動(dòng)物和糞菌移植揭示菌群是CLD同謀，其中致病共生菌決定肝臟損傷程度；③ 菌群是卓越的生物感受器，在CLD的肝-腦-腸軸中至關(guān)重要；④ 菌群和宿主在飲食、生活方式改變下繼續(xù)共同進(jìn)化；⑤ 飲食（如富含纖維）、益生菌治療等或可通過(guò)調(diào)節(jié)菌群改善CLD；⑥ 微生物療法應(yīng)聚焦相關(guān)檢測(cè)、肝臟移植前或危重病護(hù)理、口腸軸、個(gè)性化飲食和噬菌體療法等。

【主編評(píng)語(yǔ)】

隨著肥胖、非酒精性脂肪肝和酗酒的日益增多，慢性肝?。–LD）已成為流行病，發(fā)病率及死亡率均不可小覷。Gastroenterology發(fā)表綜述，討論微生物組與CLD的相關(guān)性。CLD病因復(fù)雜，與遺傳背景、并發(fā)癥、社會(huì)經(jīng)濟(jì)因素及飲食相關(guān)，需要分而視之。舉例說(shuō)明，酒精性肝病和非酒精性脂肪肝在北美、歐洲常見(jiàn)，而非洲、亞洲則更多見(jiàn)乙肝病毒感染。盡管如此，腸道菌群失調(diào)卻越來(lái)越被認(rèn)同作為各種CLD共同點(diǎn)之一。這一認(rèn)識(shí)有助于我們對(duì)CLD的了解，以期達(dá)到盡早診斷，綜合治療的目的。文章圖文并茂，并提出了很多需要關(guān)注的問(wèn)題和未來(lái)研究領(lǐng)域。（@好雨）

【原文信息】

Chronic Liver Diseases and the Microbiome: Translating Our Knowledge of Gut Microbiota to Management of Chronic Liver Disease

2020-11-27, doi: 10.1053/j.gastro.2020.10.056

基于菌群的功能性胃腸病治療，如何邁向臨床轉(zhuǎn)化？（綜述）

Gastroenterology——[17.373]

① 不少研究報(bào)道了IBS患者腸道菌群的組成和代謝物（SCFA、GABA、膽汁酸等）變化及其潛在的致病機(jī)制（腸屏障、免疫活化、神經(jīng)反應(yīng)等），但尚無(wú)定論；② 目前菌群導(dǎo)向的IBS干預(yù)方法有益生菌/元、飲食、抗生素、糞菌移植等，仍需深入研究；③ 功能性胃腸病中，相互增強(qiáng)的宿主和菌群的變化或是重要因素；④ 基于癥狀、生理和多組學(xué)的方法可對(duì)患者精細(xì)分類(lèi)，研發(fā)針對(duì)特定疾病機(jī)制的菌群干預(yù)（多菌、單菌、微生物代謝物、微生物過(guò)程）。

【主編評(píng)語(yǔ)】

Gastroenterology近期發(fā)表來(lái)自美國(guó)梅奧醫(yī)學(xué)中心的綜述，回顧了目前在腸道菌群與功能性胃腸病（特別是腸易激綜合征IBS）的研究所取得的進(jìn)展，重點(diǎn)探討了未來(lái)開(kāi)發(fā)菌群療法的研究策略，推薦專(zhuān)業(yè)人士參考。（@mildbreeze）

【原文信息】

Functional Gastrointestinal Disorders and the Microbiome: What is the best strategy for moving microbiome-based therapies for functional gastrointestinal disorders into the clinic?

2020-11-27, doi: 10.1053/j.gastro.2020.10.058

菌群如何影響兒童發(fā)育的方方面面？（綜述）

Gastroenterology——[17.373]

① 腸道微生物組通過(guò)調(diào)節(jié)能量代謝、生長(zhǎng)激素信號(hào)、病菌定植以及炎癥反應(yīng)等影響兒童早期發(fā)育，或可決定生長(zhǎng)表型好壞；② 菌群與神經(jīng)系統(tǒng)并行發(fā)育，失調(diào)可導(dǎo)致神經(jīng)發(fā)育不良、多動(dòng)癥等神經(jīng)精神疾病；③ 先天免疫保護(hù)嬰兒腸道不受病菌侵?jǐn)_，反之菌群影響腸道相關(guān)淋巴組織發(fā)育及胸腺形成；④ “斷奶反應(yīng)”是菌群與免疫互作的放大反應(yīng)，也是調(diào)節(jié)腸道菌群的“關(guān)鍵窗”；⑤ 早期菌群失調(diào)可導(dǎo)致過(guò)敏、哮喘，而調(diào)節(jié)性T細(xì)胞生成則可產(chǎn)生長(zhǎng)期腸-肺軸免疫保護(hù)。

【主編評(píng)語(yǔ)】

兒童早期發(fā)育包括了生理、心理以及情緒的變化。可分為嬰兒期、學(xué)齡前、兒童中期以及青春期四個(gè)階段。Gastroenterology發(fā)表綜述，討論從生命之初到青春期結(jié)束的時(shí)間里，腸道微生物組作為一個(gè)多功能器官系統(tǒng)如何影響人類(lèi)發(fā)育的方方面面。包括菌群與大腦、免疫系統(tǒng)以及肺功能的發(fā)育之間的關(guān)系。（@好雨）

【原文信息】

Childhood Development and the Microbiome: The Intestinal Microbiota in Maintenance of Health and Development of Disease During Childhood Development

2020-12-07, doi: 10.1053/j.gastro.2020.08.065

菌群失調(diào)或可加速衰老？（綜述）

Gastroenterology——[17.373]

① 衰老、衰弱人群常呈現(xiàn)腸道菌群紊亂、免疫力下降及代謝功能失調(diào)；② 菌群失調(diào)特別是產(chǎn)丁酸菌減少和促炎菌增多，或可導(dǎo)致老年性衰弱；③ 也可能加重炎性衰老及免疫衰老，誘發(fā)阿爾茲海默癥、帕金森等老年疾??；④ 使用抗生素或其它藥物可引起菌群失調(diào)及多藥耐藥菌的產(chǎn)生，特別是在養(yǎng)老院護(hù)理系統(tǒng)中；⑤ 長(zhǎng)壽人群菌群多樣性高且富含產(chǎn)短鏈脂肪酸的有益菌；⑥ 關(guān)注功能性核心菌群，采用益生菌、益生元和健康飲食等手段或可調(diào)節(jié)菌群從而延緩衰老。

【主編評(píng)語(yǔ)】

社會(huì)老齡化已經(jīng)是一個(gè)全球現(xiàn)象。Gastroenterology發(fā)表的綜述探討了腸道微生物組與衰老及老年性疾病的關(guān)系。深度解析了腸道菌群失調(diào)如何影響衰老、衰弱等人類(lèi)生理狀態(tài)，也相應(yīng)討論了年輕化菌群是否能延緩衰老以及如何使菌群年輕化。怎樣才能健康地老去？與腸道菌群又何相干？也許在閱讀此篇綜述的同時(shí)，也可再翻看由現(xiàn)代微生物學(xué)與免疫學(xué)開(kāi)創(chuàng)元老élie Metchnikoff撰寫(xiě)的《壽命延長(zhǎng)：樂(lè)觀的研究》這本書(shū)。（@好雨）

【原文信息】

Aging, Frailty, and the Microbiome: How Dysbiosis Influences Human Aging and Disease

2020-12-07, doi: 10.1053/j.gastro.2020.09.060

如何破除益生菌市場(chǎng)亂象，讓大眾更好的了解益生菌產(chǎn)品？（綜述）

Gastroenterology——[17.373]

① 菌群研究的進(jìn)展促進(jìn)了益生菌產(chǎn)業(yè)的發(fā)展，但由于監(jiān)管等問(wèn)題，對(duì)益生菌產(chǎn)品健康益處的聲明目前仍存在亂象，這不僅對(duì)醫(yī)生和消費(fèi)者造成困擾，也為開(kāi)展相關(guān)研究帶來(lái)阻礙；② 為解決這一問(wèn)題，需要聯(lián)合學(xué)術(shù)界、專(zhuān)業(yè)組織和產(chǎn)業(yè)界，建立沒(méi)有利益沖突的專(zhuān)業(yè)機(jī)構(gòu)，采用GRADE分析評(píng)估益生菌產(chǎn)品臨床益處的證據(jù)等級(jí)，嚴(yán)格評(píng)價(jià)產(chǎn)品質(zhì)量，并公開(kāi)相關(guān)信息供大眾參考；③ 這將有助于益生菌企業(yè)和產(chǎn)品獲得大眾信任，構(gòu)建更好的市場(chǎng)秩序。

【主編評(píng)語(yǔ)】

Gastroenterology近期發(fā)表的綜述，回顧了益生菌的發(fā)展歷史，介紹了益生菌產(chǎn)品的監(jiān)管分類(lèi)，針對(duì)如何改善目前益生菌產(chǎn)品健康益處聲明中存在的問(wèn)題，提出了一種解決方案，希望能夠促進(jìn)開(kāi)展高質(zhì)量的益生菌研究，增加公眾信任，改善市場(chǎng)秩序。（@mildbreeze）

【原文信息】

Probiotics and the Microbiome: How can we help patients make sense of probiotics?

2020-12-08, doi: 10.1053/j.gastro.2020.11.047