免疫浸潤是一整套知識體系,是一種邏輯思維方式,是免疫浸潤分析及相關(guān)研究的基礎(chǔ)。三年前,我們結(jié)合經(jīng)典綜述《新一代癌癥的標志》,并以經(jīng)典教材《癌生物學(xué)》為線索,制作了腫瘤免疫12講系列。在實際分享中,我們經(jīng)歷了幾次小幅度的內(nèi)容調(diào)整,但是大體框架基本是通識 專題的思路。
腫瘤微環(huán)境和腫瘤基質(zhì)是腫瘤細胞周圍中所有非腫瘤成分的同義術(shù)語,包括成纖維細胞、髓源性抑制細胞、巨噬細胞、淋巴細胞、細胞外基質(zhì)以及由內(nèi)皮細胞和周細胞構(gòu)成的交織血管。這些基質(zhì)細胞與腫瘤細胞有著緊密的相互作用。因此,腫瘤微環(huán)境是惡性腫瘤“種子”生存和遠端轉(zhuǎn)移不可或缺的“土壤”。
腫瘤的生長和進展離不開血管。無論發(fā)生腫瘤的器官是什么,腫瘤內(nèi)皮細胞(TEC)都是腫瘤微環(huán)境的關(guān)鍵組成部分,促進腫瘤的進展和轉(zhuǎn)移。由于血管生成是腫瘤的標志之一,抗血管生成治療(AAT)被廣泛用于多種腫瘤。然而,AAT的使用受到療效和耐藥性不足的限制,不同腫瘤和患者的療效和耐藥性不同,這表明TEC表型的瘤間以及瘤內(nèi)變異性。內(nèi)皮細胞是異質(zhì)性的,具有在不同血管和器官中執(zhí)行獨特功能的特殊表型,這可能是AAT的局限性的原因之一。
2023年8月,比利時魯汶VIB-KU癌癥生物學(xué)中心的Peter Carmeliet教授課題組在Nat Rev Cancer期刊發(fā)表題為Understanding tumour endothelial cell heterogeneity and function from single-cell omics的綜述,概述了迄今為止在單細胞水平上研究的所有人類腫瘤類型TEC的異質(zhì)性。作者使用不同人類腫瘤的scRNA-seq數(shù)據(jù),重點概述了單細胞水平上的TEC異質(zhì)性,討論了從單細胞組學(xué)了解TEC異質(zhì)性的限制,新技術(shù)和未來可能的方向,并提出了利用TEC單細胞組學(xué)數(shù)據(jù)進行治療開發(fā)的策略。
血管生成性尖端細胞、免疫調(diào)節(jié)性TEC和ECM重塑性TEC是各腫瘤中最常見的功能亞群。這三種功能性TEC亞群與腫瘤特征相一致,可以誘導(dǎo)或接近血管系統(tǒng)、致瘤性炎癥或避免免疫攻擊并激活侵襲和轉(zhuǎn)移,提示不同的TEC之間在促進腫瘤進展方面的協(xié)調(diào)合作。血管生成尖端細胞是不同腫瘤中最常見的表型,并以不同的方式調(diào)節(jié)血管生成;免疫調(diào)節(jié)性TEC可能在控制促腫瘤或抗腫瘤免疫方面具有相關(guān)功能。這些細胞表達低水平的MHC-II,但表達高水平的免疫細胞趨化因子分子。
單細胞多組學(xué)。細胞具有多維信息:基因組(DNA拷貝數(shù))、表觀基因組(染色質(zhì)可及性和DNA甲基化)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)。多組學(xué)技術(shù)能夠從同一細胞中捕捉多個維度,更好地反映了負責(zé)細胞功能的復(fù)雜相互作用網(wǎng)絡(luò)。然而,如何整合不同類型的單細胞組學(xué)數(shù)據(jù)是該領(lǐng)域的熱門話題。